摘要 | 第2-4页 |
abstract | 第4-5页 |
引言 | 第9-11页 |
第一章 CH伴甲状腺肿大患儿的NIS基因突变筛查 | 第11-21页 |
1.1 研究对象 | 第11页 |
1.2 研究材料与设备 | 第11-12页 |
1.2.1 主要实验试剂 | 第11页 |
1.2.2 主要实验仪器 | 第11-12页 |
1.2.3 实验主要软件及数据库 | 第12页 |
1.3 实验方法 | 第12-16页 |
1.3.1 基因组DNA提取 | 第12-13页 |
1.3.1.1 血液样品准备 | 第12页 |
1.3.1.2 试剂准备 | 第12-13页 |
1.3.1.3 DNA提取步骤 | 第13页 |
1.3.2 DNA质量检测 | 第13-14页 |
1.3.3 引物设计与保存 | 第14-15页 |
1.3.4 PCR扩增反应 | 第15页 |
1.3.5 1.5%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 | 第15-16页 |
1.3.6 PCR产物测序并结果分析 | 第16页 |
1.3.6.1 产物测序 | 第16页 |
1.3.6.2 测序结果分析 | 第16页 |
1.4 实验结果 | 第16-18页 |
1.4.1 NIS基因突变筛查结果 | 第16-17页 |
1.4.2 突变位点多物种同源性比较 | 第17-18页 |
1.5 讨论 | 第18-19页 |
1.6 结论 | 第19-21页 |
第二章 采用二代测序技术对CH伴甲状腺肿大患儿基因筛查研究 | 第21-33页 |
2.1 研究对象 | 第21页 |
2.2 材料与设备 | 第21页 |
2.2.1 主要仪器 | 第21页 |
2.2.2 主要试剂 | 第21页 |
2.3 生物信息数据库与分析软件 | 第21-22页 |
2.4 研究基本流程 | 第22-24页 |
2.4.1 全基因组DNA的提取并进行DNA质量的检测 | 第22页 |
2.4.2 基因组文库的制备 | 第22页 |
2.4.3 DNA簇(clusters)的生成 | 第22-23页 |
2.4.4 DNA簇在Genome Analyzer上边合成边测序 | 第23页 |
2.4.5 结果进行生物信息学及统计学分析 | 第23-24页 |
2.5 目标基因sanger测序验证 | 第24页 |
2.5.1 可疑突变位点设计引物并合成 | 第24页 |
2.5.2 PCR扩增 | 第24页 |
2.6 实验结果 | 第24-30页 |
2.6.1 基因分析 | 第24-25页 |
2.6.2 统计分析及结果 | 第25-28页 |
2.6.3 基因型和表型关联性分析 | 第28-30页 |
2.6.3.1 患儿 1(P1) | 第29页 |
2.6.3.2 患儿 2(P2) | 第29页 |
2.6.3.3 患儿 3(P3) | 第29页 |
2.6.3.4 患儿 4-6(P4-P6) | 第29-30页 |
2.7 讨论 | 第30-32页 |
2.8 结论 | 第32-33页 |
参考文献 | 第33-37页 |
综述 | 第37-50页 |
综述参考文献 | 第45-50页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第50-51页 |
致谢 | 第51-52页 |