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柑橘木虱线粒体基因组分析及基于其COI的种群遗传结构研究

摘要第4-6页
abstract第6-8页
第1章 引言第12-20页
    1.1 柑橘木虱研究概况第12-14页
        1.1.1 柑橘木虱的形态特征及分类研究第12-13页
        1.1.2 柑橘木虱的生物学特征第13页
        1.1.3 柑橘木虱的危害与防治第13-14页
    1.2 昆虫线粒体基因组研究进展第14-15页
        1.2.1 昆虫线粒体DNA结构特点第14页
        1.2.2 昆虫线粒体DNA的应用第14-15页
    1.3 种群遗传学研究第15-17页
        1.3.1 种群遗传多样性与遗传结构第15-16页
        1.3.2 种群遗传学研究使用的分子标记第16-17页
            1.3.2.1 DNA序列标记第16-17页
            1.3.2.2 微卫星第17页
    1.4 本文的研究目的与意义第17-18页
    1.5 本文研究内容第18-20页
第2章 柑橘木虱线粒体全基因组的测定与进化分析第20-47页
    2.1 材料与方法第20-27页
        2.1.1 柑橘木虱样品采集第20页
        2.1.2 主要仪器与试剂第20-21页
        2.1.3 DNA提取第21-22页
        2.1.4 PCR扩增与测序第22-23页
        2.1.5 DNA序列数据处理与分析第23-24页
        2.1.6 木虱总科线粒体基因组序列比较分析第24页
        2.1.7 胸喙亚目系统发育分析第24-27页
    2.2 结果与分析第27-44页
        2.2.1 柑橘木虱线粒体基因组全序列的分析第27-35页
            2.2.1.1 线粒体基因组结构与碱基含量第27-30页
            2.2.1.2 蛋白质编码序列分析第30-32页
            2.2.1.3 tRNA与rRNA基因第32-35页
            2.2.1.4 A+T富集区分析第35页
        2.2.2 木虱类线粒体基因组比较分析第35-41页
            2.2.2.1 线粒体基因组结构与碱基组成第35-37页
            2.2.2.2 线粒体基因组蛋白质编码基因第37-40页
            2.2.2.3 蛋白质编码基因进化速率分析第40页
            2.2.2.4 tRNA与rRNA基因比较分析第40-41页
            2.2.2.5 A+T富集区比较分析第41页
        2.2.3 基于线粒体基因组的系统发育分析第41-44页
    2.3 本章分析讨论第44-47页
        2.3.1 胸喙亚目线粒体基因比较分析第44-45页
        2.3.2 胸喙亚目线粒体基因组基因排列顺序第45页
        2.3.3 基于线粒体基因组的胸喙亚目的系统发育关系第45-47页
第3章 柑橘木虱种群遗传结构分析第47-62页
    3.1 材料与方法第47-51页
        3.1.1 柑橘木虱样品采集第47-48页
        3.1.2 主要仪器与试剂第48-49页
        3.1.3 单只柑橘木虱基因组DNA提取第49页
        3.1.4 mtDNA基因片段PCR扩增、测序第49页
        3.1.5 数据处理分析第49-51页
    3.2 实验结果第51-60页
        3.2.1 扩增结果与序列分析第51-53页
        3.2.2 种群遗传结构分析第53-57页
            3.2.2.1 种群遗传距离第53页
            3.2.2.2 种群之间的遗传分化(FST)第53页
            3.2.2.3 分子方差分析(AMOVA分析)第53-57页
            3.2.2.4 空间遗传结构分析第57页
        3.2.3 系统发育分析第57-60页
    3.3 本章分析讨论第60-62页
        3.3.1 遗传多样性分析讨论第60页
        3.3.2 种群遗传结构分析讨论第60-62页
第4章 主要结论及展望第62-65页
    4.1 主要结论第62页
    4.2 本研究的不足之处第62-63页
    4.3 展望第63-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-72页
攻读学位期间的研究成果及获奖情况第72页

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