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马铃薯耐冻相关基因克隆与功能分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
英文缩略表第14-15页
第一章 文献综述第15-34页
    1.1 马铃薯耐冻性研究进展第15-32页
        1.1.1 低温危害第15-16页
        1.1.2 冷驯化及作用第16-17页
        1.1.3 冷驯化过程中的冷诱导基因第17-18页
        1.1.4 马铃薯耐冻性遗传变异及改良第18-20页
        1.1.5 马铃薯耐冻性与基因表达变化的关系第20-21页
        1.1.6 转录组测序第21-24页
        1.1.7 脂肪酸脱氢酶与植物抗冻性第24-29页
        1.1.8 CAPS分子标记研究进展第29-30页
        1.1.9 马铃薯的转基因研究第30-32页
    1.2 本论文的研究内容与目的及拟解决的关键问题第32-34页
第二章 马铃薯野生种S.acaule冷驯化前后的转录组分析及验证第34-54页
    2.1 试验材料第34-35页
    2.2 方法第35-38页
        2.2.1 RNA提取及纯化第35页
        2.2.2 cDNA反转录第35-36页
        2.2.3 建库第36页
        2.2.4 数据过滤第36页
        2.2.5 比对统计第36页
        2.2.6 基因表达注释第36-37页
        2.2.7 内参基因及引物设计第37页
        2.2.8 qRT-PCR第37页
        2.2.9 标准曲线的绘制及基因扩增效率第37页
        2.2.10 数据分析第37-38页
        2.2.11 验证序列的引物设计及合成第38页
        2.2.12 序列比对分析第38页
        2.2.13 统计分析第38页
    2.3 结果与分析第38-50页
        2.3.1 测序产量及质量第38-40页
        2.3.2 基因表达覆盖度统计结果第40-41页
        2.3.3 GO分类第41页
        2.3.4 代谢途径基因注释第41页
        2.3.5 差异基因表达分析第41-42页
        2.3.6 冷驯化期间寒冷诱导相关基因的差异表达分析第42-47页
        2.3.7 荧光定量PCR的效率第47-48页
        2.3.8 表达稳定性第48-49页
        2.3.9 序列比对结果第49-50页
        2.3.10 qRT-PCR第50页
    2.4 讨论第50-53页
        2.4.1 转录组分析第50-52页
        2.4.2 内参基因筛选第52页
        2.4.3 转绿组预测结果验证第52-53页
    2.5 小结第53-54页
第三章 三个耐冻性不同的野生马铃薯中SAD基因和FAD2基因的克隆及表达分析第54-68页
    3.1 材料和方法第55-57页
        3.1.1 材料第55页
        3.1.2 方法第55-57页
    3.2 结果与分析第57-65页
        3.2.1 耐冻性鉴定第57页
        3.2.2 序列分析第57-62页
        3.2.3 进化关系分析第62-64页
        3.2.4 基因表达分析第64-65页
    3.3 讨论第65-66页
    3.4 小结第66-68页
第四章 硬脂酰载体蛋白脱氢酶基因(SAD)CAPS标记的开发及验证第68-74页
    4.1 材料与方法第68-70页
        4.1.1 材料第68页
        4.1.2 方法第68-70页
    4.2 结果第70-73页
        4.2.1 耐冻性鉴定结果第70页
        4.2.2 SAD基因DAN序列的查找、序列分析及引物设计及筛选结果第70-71页
        4.2.3 SNP和CAPS标记第71-72页
        4.2.4 CAPS标记与冷驯化能力的相关分析第72-73页
    4.3 讨论第73页
    4.4 小结第73-74页
第五章 野生马铃薯S.commersonii的SAD基因遗传转化第74-87页
    5.1 材料与方法第74-78页
        5.1.1 材料第74页
        5.1.2 方法第74-78页
    5.2 结果与分析第78-85页
        5.2.1 SAD基因的克隆及序列分析第78-79页
        5.2.2 植物表达载体pBI121-SAD-CMM的酶切鉴定第79-80页
        5.2.3 农杆菌介导的SAD-CMM基因遗传转化第80-81页
        5.2.4 转基因植株的PCR检测第81-82页
        5.2.5 Southern blotting第82页
        5.2.6 GUS染色第82-83页
        5.2.7 SAD-CMM基因表达分析第83页
        5.2.8 耐冻性鉴定第83-84页
        5.2.9 脂肪酸成分分析第84-85页
    5.3 讨论第85-86页
    5.4 小结第86-87页
第六章 全文结论第87-89页
参考文献第89-106页
致谢第106-107页
作者简介第107页

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