| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-23页 |
| 第一章 绪论 | 第23-55页 |
| 1 海绵共栖微生物研究概述 | 第23-28页 |
| ·海绵共栖微生物 | 第23-24页 |
| ·海绵共栖微生物次级代谢产物的研究 | 第24-26页 |
| ·含氮类化合物 | 第24-25页 |
| ·聚酮类化合物 | 第25页 |
| ·萜烯及甾体 | 第25-26页 |
| ·海绵共栖微生物的化学防御机制 | 第26-28页 |
| ·抵御病原微生物 | 第26-27页 |
| ·抵御捕食者 | 第27页 |
| ·竞争生存空间 | 第27-28页 |
| ·抗附着物 | 第28页 |
| 2 细菌群体感应系统的研究概述 | 第28-53页 |
| ·细菌群体感应现象的研究历史 | 第29-30页 |
| ·群体感应信息系统及信号分子研究概述 | 第30-45页 |
| ·细菌种内特异性的群体感应信息系统 | 第30-38页 |
| ·G-中AHLs-LuxI / LuxR 介导的信息系统 | 第30-35页 |
| ·G+中寡肽介导的信息系统 | 第35-38页 |
| ·细菌种间的 LuxS/AI-2 介导的群体感应信息系统 | 第38-41页 |
| ·其他群体感应信息系统及信号分子 | 第41-44页 |
| ·AI-3/肾上腺素/去甲肾上腺素信息系统 | 第41-42页 |
| ·其他群体感应信号分子 | 第42-44页 |
| ·真菌中的群体感应系统 | 第44-45页 |
| ·荚膜组织胞浆菌中的调节分子 | 第44页 |
| ·白色念珠菌中的调节分子 | 第44-45页 |
| ·酿酒酵母菌中的群体感应信号分子 | 第45页 |
| ·其它真菌的调节分子 | 第45页 |
| ·群体感应信号分子AHLs 检测方法研究 | 第45-51页 |
| ·理化方法 | 第46-49页 |
| ·高效液相色谱-质谱法 | 第46-47页 |
| ·液相色谱结合四极杆串联线性离子阱质谱法 | 第47页 |
| ·超高效液相色谱法 | 第47-48页 |
| ·气相色谱-质谱法 | 第48-49页 |
| ·生物学方法 | 第49-50页 |
| ·平板划线法检测AHLs | 第49页 |
| ·报告平板法检测AHLs | 第49-50页 |
| ·β-半乳糖苷酶活性检测法检测AHLs | 第50页 |
| ·薄层层析法 | 第50-51页 |
| ·基本原理 | 第50页 |
| ·薄层层析-生物传感法检测 AHLs | 第50-51页 |
| ·海洋细菌中的群体感应现象 | 第51-53页 |
| 3 本文的创新点及研究意义 | 第53-55页 |
| ·本文的创新点 | 第53页 |
| ·本文的研究意义 | 第53-55页 |
| 第二章 具有抗菌活性的海绵共栖细菌的筛选及鉴定 | 第55-65页 |
| 1 前言 | 第55页 |
| 2 实验部分 | 第55-59页 |
| ·仪器与试剂 | 第55-57页 |
| ·样品来源及药品、试剂 | 第55-56页 |
| ·常用溶液与培养基 | 第56页 |
| ·分子生物学试剂与引物 | 第56页 |
| ·实验仪器与软件 | 第56-57页 |
| ·海绵组织处理 | 第57页 |
| ·海绵共栖细菌分离 | 第57页 |
| ·粗提液制备 | 第57-58页 |
| ·活性菌株筛选 | 第58页 |
| ·活性共栖细菌分子鉴定 | 第58-59页 |
| ·DNA 的提取 | 第58-59页 |
| ·16S rRNA PCR 扩增 | 第59页 |
| ·序列分析和系统发生学地位的确定 | 第59页 |
| 3 结果与讨论 | 第59-64页 |
| ·海洋细菌的抗菌活性 | 第59-64页 |
| ·具有活性的海绵共栖细菌系统发育学鉴定及系统发育树的构建 | 第64页 |
| 本章小结 | 第64-65页 |
| 第三章 海绵共栖细菌 Pseudoalteromonas sp. NJ6-3-1 抗菌物质产生的密度依赖性 | 第65-127页 |
| 第一节 细菌 NJ6-3-1 抗菌物质的探明（1） | 第65-92页 |
| 1 前言 | 第65-66页 |
| 2 实验材料和方法 | 第66-71页 |
| ·实验菌株、仪器与试剂 | 第66-67页 |
| ·实验菌株 | 第66页 |
| ·实验试剂及培养基 | 第66页 |
| ·实验仪器 | 第66-67页 |
| ·菌株培养 | 第67页 |
| ·细菌代谢产物的提取 | 第67页 |
| ·细菌抗菌代谢产物的分离纯化 | 第67-69页 |
| ·硅胶柱层析 | 第67-68页 |
| ·TLC 薄板层析 | 第68页 |
| ·高效液相色谱 | 第68-69页 |
| ·细菌代谢产物的活性检测 | 第69页 |
| ·化合物结构的表征与解析 | 第69-71页 |
| ·HPLC/ESI TOF-MS 对化合物分子量的测定 | 第69页 |
| ·HPLC/ESI/APCI-IT-MS 对化合物结构的分析 | 第69-70页 |
| ·FT-IR 对化合物结构的分析 | 第70页 |
| ·NMR 测定 | 第70-71页 |
| ·化合物最低抑菌浓度 MIC 的测定 | 第71页 |
| ·不同浓度测试样品的制备 | 第71页 |
| ·化合物MIC 的测定 | 第71页 |
| 3 结果与讨论 | 第71-92页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物的分离纯化 | 第71-78页 |
| ·TLC 分离纯化抗菌化合物 | 第71-73页 |
| ·HPLC 分离纯化抗菌化合物 | 第73-76页 |
| ·抗菌物质稳定性分析 | 第76-78页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物的结构解析 | 第78-89页 |
| ·HPLC/ESI TOF-MS 解析抗菌化合物的分子量 | 第78-81页 |
| ·HPLC/ESI/APCI IT-MS 解析抗菌化合物的结构 | 第81-85页 |
| ·FT-IR 解析抗菌化合物的结构 | 第85-86页 |
| ·NMR 解析抗菌化合物的结构 | 第86-89页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物MIC 的测定 | 第89-92页 |
| 第二节 细菌 NJ6-3-1 抗菌物质的探明（2） | 第92-112页 |
| 1 前言 | 第92页 |
| 2 实验材料和方法 | 第92-97页 |
| ·实验菌株、仪器与试剂 | 第92-94页 |
| ·实验菌株 | 第92-93页 |
| ·实验试剂及培养基 | 第93页 |
| ·实验仪器 | 第93-94页 |
| ·菌株培养 | 第94页 |
| ·细菌代谢产物的提取 | 第94页 |
| ·细菌抗菌代谢产物的分离纯化 | 第94-95页 |
| ·硅胶柱层析 | 第94页 |
| ·TLC 薄板层析 | 第94页 |
| ·高效液相色谱 | 第94-95页 |
| ·细菌代谢产物的活性检测 | 第95页 |
| ·化合物结构的表征与解析 | 第95-96页 |
| ·HPLC/ESI TOF-MS 对化合物分子量的测定 | 第95页 |
| ·HPLC/ESI/IT-MS 对化合物结构的分析 | 第95-96页 |
| ·FT-IR 对化合物结构的分析 | 第96页 |
| ·元素分析测定 | 第96页 |
| ·NMR 测定 | 第96页 |
| ·化合物最低抑菌浓度MIC 的测定 | 第96-97页 |
| ·不同浓度测试样品的制备 | 第96页 |
| ·化合物MIC 的测定 | 第96-97页 |
| 3 结果与讨论 | 第97-112页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物的分离纯化 | 第97-100页 |
| ·TLC 分离纯化抗菌化合物 | 第97-98页 |
| ·HPLC 分离纯化抗菌化合物 | 第98-100页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物的结构解析 | 第100-111页 |
| ·HPLC/ESI TOF-MS 解析抗菌化合物的分子量 | 第100-103页 |
| ·HPLC/ESI IT-MS 解析抗菌化合物的结构 | 第103-106页 |
| ·FT-IR 解析抗菌化合物的结构 | 第106-107页 |
| ·元素分析解析抗菌化合物的结构 | 第107页 |
| ·NMR 解析抗菌化合物的结构 | 第107-111页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌化合物MIC 的测定 | 第111-112页 |
| 第三节 细菌 NJ6-3-1 抗菌物质产生的密度依赖性 | 第112-126页 |
| 1 前言 | 第112页 |
| 2 实验部分 | 第112-117页 |
| ·实验菌株、仪器与试剂 | 第112-113页 |
| ·实验菌株 | 第112页 |
| ·实验试剂 | 第112-113页 |
| ·实验仪器 | 第113页 |
| ·培养基配制 | 第113页 |
| ·细菌NJ6-3-1 的培养 | 第113-114页 |
| ·细菌NJ6-3-1 细胞密度的测定 | 第114页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物的提取 | 第114页 |
| ·HPLC 分离条件的确定 | 第114-115页 |
| ·细菌NJ6-3-1 培养液中抗菌物质含量的测定 | 第115页 |
| ·细菌NJ6-3-1 培养液中抗菌物质的质谱鉴定 | 第115-116页 |
| ·细菌NJ6-3-1 培养液的抗菌活性检测 | 第116-117页 |
| 3 结果与讨论 | 第117-126页 |
| ·细菌NJ6-3-1 细胞密度的测定 | 第117页 |
| ·细菌NJ6-3-1 抗菌物质的测定 | 第117-120页 |
| ·细菌NJ6-3-1 抗菌物质含量与细胞密度的关系 | 第120-121页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中抗菌物质的结构解析 | 第121-125页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物的抗菌活性检测 | 第125-126页 |
| 本章小结 | 第126-127页 |
| 第四章 海绵共栖细菌 Pseudoalteromonas sp. NJ6-3-1 中 AHLs 信号分子的探明 | 第127-150页 |
| 第一节 细菌 NJ6-3-1 产生 AHLs 的情况 | 第127-141页 |
| 1 前言 | 第127-128页 |
| 2 实验材料和方法 | 第128-131页 |
| ·实验材料 | 第128-130页 |
| ·实验菌株与培养条件 | 第128页 |
| ·实验药品及试剂 | 第128-129页 |
| ·实验仪器 | 第129页 |
| ·培养基及溶液配制 | 第129-130页 |
| ·细菌 NJ6-3-1 代谢产物粗提液的制备 | 第130页 |
| ·平行划线法检测AHLs | 第130页 |
| ·报告平板打孔法检测AHLs | 第130页 |
| ·GC-MS 法检测AHLs | 第130-131页 |
| ·样品制备 | 第130页 |
| ·GC-MS 检测条件 | 第130-131页 |
| 3 结果与讨论 | 第131-141页 |
| ·平行划线法检测细菌NJ6-3-1 中的AHLs | 第131-133页 |
| ·报告平板打孔法检测细菌NJ6-3-1 中的AHLs | 第133-138页 |
| ·GC-MS 法检测细菌NJ6-3-1 中的AHLs | 第138-141页 |
| 第二节 外源 AHLs 对细菌 NJ6-3-1 抗菌物质的诱导作用 | 第141-149页 |
| 1 前言 | 第141-142页 |
| 2 材料与方法 | 第142-144页 |
| ·实验试剂和仪器 | 第142页 |
| ·实验所用菌株 | 第142页 |
| ·自诱导实验 | 第142-144页 |
| ·菌株培养 | 第142-143页 |
| ·AHLs 的配制 | 第143页 |
| ·自诱导物质的添加 | 第143页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物粗提液的制备 | 第143页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物粗提液的活性检测 | 第143页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物粗提液的HPLC 检测 | 第143-144页 |
| 3 结果与讨论 | 第144-149页 |
| ·生物自显影法检测AHLs 诱导作用 | 第144-146页 |
| ·HPLC 法检测AHLs 自诱导作用 | 第146-149页 |
| 本章小结 | 第149-150页 |
| 第五章 海绵共栖细菌 Pseudoalteromonas sp. NJ6-3-1 中 DKPs 信号分子的探明 | 第150-166页 |
| 1 前言 | 第150-152页 |
| 2 材料与方法 | 第152-154页 |
| ·实验试剂和仪器 | 第152-153页 |
| ·实验所用菌株 | 第153页 |
| ·自诱导实验 | 第153-154页 |
| ·菌株培养 | 第153页 |
| ·DKPs 的配制 | 第153页 |
| ·诱导物质的添加 | 第153页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物的提取 | 第153-154页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物粗提液的活性检测 | 第154页 |
| ·细菌NJ6-3-1 的发酵 | 第154页 |
| ·发酵液中代谢产物的提取分离 | 第154页 |
| 3 结果与讨论 | 第154-165页 |
| ·DKPs 诱导细菌NJ6-3-1 产生抗菌活性 | 第154-156页 |
| ·细菌NJ6-3-1 代谢产物中DKPs 化合物结构鉴定 | 第156-163页 |
| ·讨论 | 第163-165页 |
| 本章小结 | 第165-166页 |
| 第六章 海绵共栖细菌 Pseudoalteromonas sp. NJ6-3-1 群体感应系统的分子基础初步研究 | 第166-171页 |
| 1 前言 | 第166-167页 |
| 2 实验部分 | 第167-169页 |
| ·仪器与试剂 | 第167页 |
| ·样品来源及药品、试剂 | 第167页 |
| ·常用溶液与培养基 | 第167页 |
| 海绵共栖细菌Pseudoalteromonas sp.NJ6-3-1 中群体感应系统的研究 | 第167页 |
| ·细菌NJ6-3-1 基因组DNA 的制备 | 第167-168页 |
| ·基因组DNA 片段的破碎及测序接头的链接 | 第168页 |
| ·上机测序 | 第168页 |
| ·测序结果分析及部分基因注释 | 第168-169页 |
| 3 结果与讨论 | 第169-170页 |
| ·高分子量的细菌NJ6-3-1 基因组DNA 的制备 | 第169页 |
| ·DNA 片段选择 | 第169页 |
| ·测序拼装结果 | 第169-170页 |
| ·luxR 基因片段的获得 | 第170页 |
| 本章小结 | 第170-171页 |
| 第七章 结论与创新点 | 第171-173页 |
| 参考文献 | 第173-190页 |
| 附录 | 第190-208页 |
| 缩略语注释 | 第208-212页 |
| 致谢 | 第212-214页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第214-216页 |
