| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 课题研究背景与意义 | 第9-11页 |
| 1.1.1 PPI网络及其功能模块 | 第9-10页 |
| 1.1.2 功能模块检测的意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-14页 |
| 1.3 论文的主要研究内容 | 第14页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第14-17页 |
| 第2章 PPI网络功能模块检测概述 | 第17-23页 |
| 2.1 PPI网络及其功能模块检测过程 | 第17-19页 |
| 2.1.1 PPI网络数据 | 第17-18页 |
| 2.1.2 PPI网络功能模块检测过程 | 第18-19页 |
| 2.2 功能模块检测的常用评价指标 | 第19-21页 |
| 2.2.1 覆盖率 | 第19-20页 |
| 2.2.2 精度、召回率和F度量 | 第20-21页 |
| 2.2.3 敏感度、正预测率和准确度 | 第21页 |
| 2.3 本章小结 | 第21-23页 |
| 第3章 基于多标签传播机制的PPI网络功能模块检测方法 | 第23-37页 |
| 3.1 算法思想 | 第23-24页 |
| 3.1.1 标签传播思想 | 第23-24页 |
| 3.1.2 多标签传播思想 | 第24页 |
| 3.1.3 MLP-FMD算法基本思想 | 第24页 |
| 3.2 算法描述 | 第24-29页 |
| 3.2.1 初始化节点标签 | 第25-26页 |
| 3.2.2 多标签传播 | 第26-28页 |
| 3.2.3 后处理过程 | 第28-29页 |
| 3.2.4 算法流程与分析 | 第29页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第29-35页 |
| 3.3.1 实验数据集 | 第30页 |
| 3.3.2 实验结果与分析 | 第30-35页 |
| 3.4 本章小结 | 第35-37页 |
| 第4章 融合多标签传播和蜂群优化机制的PPI网络功能模块检测方法 | 第37-51页 |
| 4.1 算法思想 | 第37-39页 |
| 4.1.1 基本蜂群算法简介 | 第37-38页 |
| 4.1.2 LPABC-FMD算法基本思想 | 第38-39页 |
| 4.2 算法描述 | 第39-44页 |
| 4.2.1 多标签传播初始化种群 | 第39-41页 |
| 4.2.2 蜂群优化种群策略 | 第41-42页 |
| 4.2.3 后处理过程 | 第42-44页 |
| 4.2.4 算法流程与分析 | 第44页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第44-49页 |
| 4.3.1 实验数据集 | 第44页 |
| 4.3.2 实验结果与分析 | 第44-49页 |
| 4.4 本章小结 | 第49-51页 |
| 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59页 |