| 摘要 | 第3-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 缩略语一览表 | 第16-19页 |
| 引言 | 第19-26页 |
| 1 研究背景 | 第19-25页 |
| 1.1 阳春砂 | 第19-20页 |
| 1.2 萜类化合物 | 第20-22页 |
| 1.3 茉莉酸甲酯 | 第22-23页 |
| 1.4 转录组测序 | 第23-25页 |
| 2 本研究工作的总体思路、主要研究方法和预期结果 | 第25-26页 |
| 第一章 MeJA诱导对阳春砂挥发性萜类的影响 | 第26-46页 |
| 1 植物材料、主要仪器及试剂 | 第26页 |
| 1.1 植物材料 | 第26页 |
| 1.2 主要仪器和试剂 | 第26页 |
| 2 方法 | 第26-27页 |
| 2.1 不同浓度MeJA喷施阳春砂叶片 | 第26-27页 |
| 2.2 挥发性萜类成分的提取 | 第27页 |
| 2.3 GC-MS分析 | 第27页 |
| 2.4 200μmol/L和600 μmol/LMeJA喷施挂果阳春砂 | 第27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-44页 |
| 3.1 不同浓度MeJA对阳春砂叶片中挥发性萜类成分的影响 | 第27-32页 |
| 3.2 200μmol/L和600 μmol/LMeJA对阳春砂中挥发性萜类的影响 | 第32-44页 |
| 4 讨论 | 第44-45页 |
| 本章小结 | 第45-46页 |
| 第二章 MeJA诱导后阳春砂转录组测序及数据分析 | 第46-64页 |
| 1 材料、主要仪器和试剂 | 第46页 |
| 1.1 植物材料 | 第46页 |
| 1.2 主要仪器及试剂 | 第46页 |
| 2 方法 | 第46-48页 |
| 2.1 总RNA的提取及质量检测 | 第46-47页 |
| 2.2 Illumina测序 | 第47-48页 |
| 2.3 转录组数据的挖掘 | 第48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-61页 |
| 3.1 RNA提取质量评价 | 第48页 |
| 3.2 Illumina测序质量分析 | 第48-50页 |
| 3.3 Unigenes注释情况分析 | 第50-57页 |
| 3.4 重点关注通路的注释情况分析 | 第57-61页 |
| 4 讨论 | 第61-63页 |
| 4.1 转录组测序材料的选择 | 第61-62页 |
| 4.2 转录组数据中unigenes存在不同的注释率 | 第62页 |
| 4.3 MeJA诱导对药用植物次生代谢相关基因转录的影响 | 第62-63页 |
| 本章小结 | 第63-64页 |
| 第三章 MeJA诱导的阳春砂表达谱测序及数据分析 | 第64-85页 |
| 1 材料、主要仪器和试剂 | 第64页 |
| 1.1 植物材料 | 第64页 |
| 1.2 主要仪器与试剂 | 第64页 |
| 2 方法 | 第64-66页 |
| 2.1 总RNA的提取及质量检测 | 第64页 |
| 2.2 表达谱测序及数据分析 | 第64-66页 |
| 3 结果与分析 | 第66-83页 |
| 3.1 RNA提取质量分析 | 第66页 |
| 3.2 表达谱测序数据初步分析 | 第66-70页 |
| 3.3 不同样品间的两两比较与分析 | 第70-75页 |
| 3.4 多样品比较与富集分析 | 第75-77页 |
| 3.5 表达趋势分析 | 第77-83页 |
| 4 讨论 | 第83-84页 |
| 4.1 表达谱测序在药用植物次生代谢研究中的应用 | 第83页 |
| 4.2 萜类骨架合成途径中基因的差异表达 | 第83页 |
| 4.3 JA信号转导途径中基因的差异表达 | 第83-84页 |
| 本章小结 | 第84-85页 |
| 第四章 MeJA诱导后阳春砂部分基因的变化水平及相关性分析 | 第85-107页 |
| 1 材料、主要仪器和试剂 | 第85-86页 |
| 1.1 实验材料 | 第85页 |
| 1.2 主要仪器和试剂 | 第85-86页 |
| 2 方法 | 第86-88页 |
| 2.1 总RNA的提取和反转录 | 第86-87页 |
| 2.2 引物设计 | 第87页 |
| 2.3 引物验证及最佳退火温度筛选 | 第87页 |
| 2.4 基因的扩增效率和特异性 | 第87页 |
| 2.5 部分基因相对表达量的分析 | 第87页 |
| 2.6 JA信号转导基因、萜类合成基因和挥发性萜类成分的相关性分析 | 第87-88页 |
| 3 结果与分析 | 第88-104页 |
| 3.1 RNA的质量检测 | 第88页 |
| 3.2 引物验证及退火温度的筛选 | 第88-89页 |
| 3.3 扩增效率和特异性分析 | 第89-90页 |
| 3.4 目的基因的相对表达量分析 | 第90-92页 |
| 3.5 JA信号转导基因、萜类合成基因和挥发性萜类成分的相关性分析 | 第92-104页 |
| 4 讨论 | 第104-105页 |
| 4.1 实时荧光定量PCR内参基因的选择 | 第104-105页 |
| 4.2 MeJA诱导后部分基因的表达变化分析 | 第105页 |
| 4.3 JA信号转导与乙酸龙脑酯的生物合成 | 第105页 |
| 本章小结 | 第105-107页 |
| 第五章 总结与展望 | 第107-111页 |
| 1 总结 | 第107-109页 |
| 2 展望 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-116页 |
| 附录 | 第116-127页 |
| 发表论文与参与课题情况 | 第127-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |
