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通过深度测序对小细胞肺癌样本进行微小RNA的发现及表达分析

中文摘要第6-7页
英文摘要第7-8页
1、文献综述第9-20页
    1.1 miRNA的发现和产生第9-11页
        1.1.1 miRNA的发现第9-10页
        1.1.2 miRNA的产生第10-11页
    1.2 miRNA与肺癌的发生机制第11-16页
        1.2.1 miRNA在肺癌中的作用模式第11-12页
        1.2.2 与肺癌相关的miRNA第12页
        1.2.3 癌基因(oncogene)和 抑癌基因(anti-oncogene)第12-13页
        1.2.4 miRNA的表观遗传学调控第13-14页
        1.2.5 miRNA调节生长因子受体第14页
        1.2.6 调节新生血管生成第14-15页
        1.2.7 调节凋亡途径及端粒第15-16页
        1.2.8 miRNA的SNP第16页
    1.3 miRNA与肺癌的早期诊断第16-17页
    1.4 miRNA与肺癌的治疗第17-18页
    1.5 miRNA与肺癌的转移和预后第18-20页
2、前言第20-22页
3、材料与方法第22-37页
    3.1 实验材料第22-23页
        3.1.1 临床标本第22-23页
        3.1.2 标本处理第23页
        3.1.3 实验动物及瘤株第23页
    3.2 主要试剂第23-24页
        3.2.1 测序及实时定量PCR试剂第23-24页
        3.2.2 细胞培养、转染试剂第24页
        3.2.3 免疫组化试剂第24页
    3.3 主要试剂的配制第24-26页
    3.4 主要仪器第26-27页
    3.5 实验方法第27-34页
        3.5.1 用miRNA抽提试剂盒 (mirVana miRNA Isolation kit)提取小细胞癌样本中的小RNA的步骤第27页
        3.5.2 针对miRNA的特异性逆转录反应及实时定量PCR反应第27-29页
        3.5.3 细胞培养第29-30页
        3.5.4 向小细胞肺癌细胞中转染含有mi R-30a-3p的重组GV251质粒第30页
        3.5.5 MTT检测细胞增殖情况第30-31页
        3.5.6 流式细胞术检测细胞周期第31页
        3.5.7 流式细胞仪检测细胞凋亡(Annexin V/PI双染法)第31-32页
        3.5.8 石蜡包埋及切片第32页
        3.5.9 石蜡组织切片HE染色第32-33页
        3.5.10 二步法免疫组化染色步骤第33页
        3.5.11 逆转录合成总c DNA第33-34页
        3.5.12 裸鼠小细胞肺癌皮下移植瘤模型的建立第34页
    3.6 结果判定及分析方法第34-35页
    3.7 数据处理及统计学分析第35-37页
        3.7.1 miRNA表达差异的生物信息学分析第35-36页
        3.7.2 生物学实验数据的统计分析第36-37页
4、结果第37-54页
    4.1 人小细胞肺癌组织学实验结第37-38页
        4.1.1 solexa深度测序结果第37页
        4.1.2 miRNA对小细胞肺癌的作用第37页
        4.1.3 miRNA在小细胞肺癌组织表达的验证第37-38页
    4.2 人小细胞肺癌细胞系实验第38-54页
        4.2.1 人小细胞肺癌细胞系的miRNA-30a-3p的表达及 5-AZA-DC和TSA对其表达的影响第38页
        4.2.2 miR-30a-3p转染NCI-H449细胞第38-45页
        4.2.3 miR-30a-3p对NCI-H449细胞体外增殖的影第45-46页
        4.2.4 miR-30a-3p对NCI-H449细胞凋亡的影第46-47页
        4.2.5 miR-30a-3p对NCI-H449细胞周期的影响第47-50页
        4.2.6 miR-30a-3p对裸鼠移植瘤的影响第50-51页
        4.2.7 miR-30a-3p对裸鼠移植瘤血管、淋巴管数量及血管淋巴管生成因子表达水平的影响第51-54页
5、讨论第54-64页
    5.1 solexa深度测序在小细胞肺癌miRNA研究中的应用第54-55页
    5.2 小细胞肺癌相关的miRNA靶基因的注释第55-59页
    5.3 DNA甲基化与肺癌第59-60页
    5.4 miRNA-30a-3p对肺癌的影响第60-64页
6、结论第64-65页
7、致谢第65-66页
8、参考文献第66-87页
9、个人简历第87页

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