摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 绪论 | 第10-15页 |
1.1 种质资源保存的目的与意义 | 第10-11页 |
1.1.1 东北虎资源的概况与保护 | 第10-11页 |
1.2 cDNA文库的研究进展 | 第11-12页 |
1.2.1 构建cDNA文库的方法 | 第11页 |
1.2.2 cDNA文库的载体系统 | 第11-12页 |
1.2.3 cDNA文库的质量评估 | 第12页 |
1.2.4 cDNA文库的意义及用途 | 第12页 |
1.3 EST技术及其应用 | 第12-13页 |
1.3.1 EST概念及其研究概况 | 第12页 |
1.3.2 EST的特点与应用 | 第12页 |
1.3.3 EST拼接前的处理 | 第12-13页 |
1.3.4 EST的聚类和拼接 | 第13页 |
1.3.5 基因注释及功能分类 | 第13页 |
1.3.6 EST代谢途径分析 | 第13页 |
1.4 生物信息学及其应用 | 第13-14页 |
1.4.1 序列分析 | 第13-14页 |
1.4.2 基因及蛋白质表达 | 第14页 |
1.5 研究的目的与意义 | 第14-15页 |
2 材料与方法 | 第15-27页 |
2.1 东北虎肾组织cDNA文库的构建 | 第15-23页 |
2.1.1 实验材料 | 第15-16页 |
2.1.2 实验方法 | 第16-23页 |
2.2 ESTs测序及生物信息学分析 | 第23-24页 |
2.2.1 实验材料 | 第23-24页 |
2.2.2 实验方法 | 第24页 |
2.2.3 EST序列初步质量监控 | 第24页 |
2.2.4 EST序列的分析 | 第24页 |
2.2.5 序列功能分类 | 第24页 |
2.3 小结与讨论 | 第24-27页 |
2.3.1 总RNA的提取 | 第24页 |
2.3.2 建库方法的选择 | 第24-25页 |
2.3.3 构建SMART cDNA文库出现的技术问题 | 第25页 |
2.3.4 cDNA文库质量的评估 | 第25-27页 |
3 结果与讨论 | 第27-43页 |
3.1 东北虎肾组织cDNA文库的构建 | 第27-29页 |
3.1.1 总RNA的提取 | 第27页 |
3.1.2 cDNA文库的构建 | 第27-28页 |
3.1.3 cDNA文库质量检测 | 第28-29页 |
3.2 EST序列测序及生物信息学分析 | 第29-40页 |
3.2.1 序列质量分析 | 第29页 |
3.2.2 BLAST基因检索分析 | 第29-31页 |
3.2.3 EST序列的功能性分析及分类 | 第31-38页 |
3.2.4 KEGG pathway分析基因代谢途径 | 第38-39页 |
3.2.5 Interpro检索分析 | 第39-40页 |
3.3 讨论 | 第40-42页 |
3.3.1 EST片段统计分析 | 第40页 |
3.3.2 基因功能分析 | 第40-41页 |
3.3.3 功能基因的选取 | 第41-42页 |
3.4 小结 | 第42-43页 |
结论 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第48-49页 |
致谢 | 第49-50页 |