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东北虎肾cDNA文库的构建及ESTs分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 绪论第10-15页
    1.1 种质资源保存的目的与意义第10-11页
        1.1.1 东北虎资源的概况与保护第10-11页
    1.2 cDNA文库的研究进展第11-12页
        1.2.1 构建cDNA文库的方法第11页
        1.2.2 cDNA文库的载体系统第11-12页
        1.2.3 cDNA文库的质量评估第12页
        1.2.4 cDNA文库的意义及用途第12页
    1.3 EST技术及其应用第12-13页
        1.3.1 EST概念及其研究概况第12页
        1.3.2 EST的特点与应用第12页
        1.3.3 EST拼接前的处理第12-13页
        1.3.4 EST的聚类和拼接第13页
        1.3.5 基因注释及功能分类第13页
        1.3.6 EST代谢途径分析第13页
    1.4 生物信息学及其应用第13-14页
        1.4.1 序列分析第13-14页
        1.4.2 基因及蛋白质表达第14页
    1.5 研究的目的与意义第14-15页
2 材料与方法第15-27页
    2.1 东北虎肾组织cDNA文库的构建第15-23页
        2.1.1 实验材料第15-16页
        2.1.2 实验方法第16-23页
    2.2 ESTs测序及生物信息学分析第23-24页
        2.2.1 实验材料第23-24页
        2.2.2 实验方法第24页
        2.2.3 EST序列初步质量监控第24页
        2.2.4 EST序列的分析第24页
        2.2.5 序列功能分类第24页
    2.3 小结与讨论第24-27页
        2.3.1 总RNA的提取第24页
        2.3.2 建库方法的选择第24-25页
        2.3.3 构建SMART cDNA文库出现的技术问题第25页
        2.3.4 cDNA文库质量的评估第25-27页
3 结果与讨论第27-43页
    3.1 东北虎肾组织cDNA文库的构建第27-29页
        3.1.1 总RNA的提取第27页
        3.1.2 cDNA文库的构建第27-28页
        3.1.3 cDNA文库质量检测第28-29页
    3.2 EST序列测序及生物信息学分析第29-40页
        3.2.1 序列质量分析第29页
        3.2.2 BLAST基因检索分析第29-31页
        3.2.3 EST序列的功能性分析及分类第31-38页
        3.2.4 KEGG pathway分析基因代谢途径第38-39页
        3.2.5 Interpro检索分析第39-40页
    3.3 讨论第40-42页
        3.3.1 EST片段统计分析第40页
        3.3.2 基因功能分析第40-41页
        3.3.3 功能基因的选取第41-42页
    3.4 小结第42-43页
结论第43-44页
参考文献第44-48页
攻读学位期间发表的学术论文第48-49页
致谢第49-50页

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