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低温胁迫下金针菇差异蛋白组学研究

摘要第8-10页
第一章 绪论第10-16页
    1 金针菇第10页
        1.1 概况第10页
    2 蛋白质组学第10-12页
        2.1 蛋白质组学概述第10-12页
            2.1.1 蛋白质组学的产生及意义第10-11页
            2.1.2 蛋白质组学的研究现状和前景第11页
            2.1.3 差异蛋白组学研究第11-12页
    3 食用菌蛋白质组学研究进展第12-14页
        3.1 差异蛋白质组学在食用真菌中的研究进展第12-14页
            3.1.1 非生物胁迫条件下差异蛋白的研究第12-13页
            3.1.2 不同组织形态中差异蛋白组学研究第13页
            3.1.3 食用菌不同生长阶段差异蛋白研究第13-14页
    4 本课题研究背景与研究意义第14-16页
第二章 优良菌株的筛选第16-21页
    1 材料第16页
        1.1 供试菌株第16页
        1.2 培养基配方第16页
    2 方法第16-19页
        2.1 出发菌株出菇试验第16-17页
        2.2 出发菌株的单孢分离第17页
        2.3 出发菌株的细胞核纯化第17-18页
        2.4 出发菌株的细胞质纯化第18页
        2.5 样品收集第18-19页
    3 结果第19页
    4 讨论第19-20页
    5 小结第20-21页
第三章 基于ITRAQ分析低温胁迫下金针菇菌丝蛋白质组第21-36页
    1 材料第21-22页
        1.1 仪器设备第21-22页
        1.2 主要试剂第22页
    2 实验方法第22-26页
        2.1 蛋白提取与检测第22页
        2.2 iTRAQ结合2D LC-MS/MS分析第22-24页
            2.2.1 肽段酶解与定量第22-23页
            2.2.2 iTRAQ标记第23页
            2.2.3 液相色谱分离一第23页
            2.2.4 液相色谱分离二第23-24页
            2.2.5 质谱鉴定第24页
        2.3 质谱数据全局分析第24-25页
        2.4 差异蛋白质筛选第25页
        2.5 差异蛋白质生物信息学分析第25-26页
            2.5.1 差异蛋白质GO分析第25页
            2.5.2 差异蛋白质KEGG富集分析第25-26页
    3 结果与分析第26-34页
        3.1 电泳检测结果第26页
        3.2 iTRAQ结合2D LC-MS/MS鉴定结果第26-27页
        3.3 质谱数据全局分析第27-29页
            3.3.1 鉴定蛋白质的主成分分析第27页
            3.3.2 鉴定蛋白质的表达量分布范围分析第27-28页
            3.3.3 鉴定蛋白质的表达量特异性分析第28-29页
            3.3.4 鉴定蛋白质的层次聚类分析第29页
        3.4 差异蛋白质筛选第29-31页
        3.5 差异蛋白质生物信息学分析第31-34页
            3.5.1 差异蛋白质GO分析第31-33页
            3.5.2 差异蛋白质KEGG通路分析第33-34页
    4 讨论第34-35页
    5 小结第35-36页
第四章 QRT-PCR分析低温胁迫下金针菇蛋白基因的差异表达第36-47页
    1 主要试剂与仪器第36-37页
        1.1 仪器设备第36页
        1.2 主要试剂第36页
        1.3 材料第36-37页
    2 实验方法第37-41页
        2.1 金针菇总RNA的提取与检测第37页
        2.2 总RNA反转录成cDNA第37-38页
        2.3 RT-PCR引物序列设计与合成第38-39页
        2.4 引物退火温度的验证第39-40页
        2.5 RT-PCR反应第40-41页
    3 结果与分析第41-46页
        3.1 总RNA的提取与检测第41页
        3.2 引物退火温度确定第41-42页
        3.3 RT-PCR第42-46页
            3.3.1 荧光定量PCR检测引物特异性第42-43页
            3.3.2 qRT-PCR第43-46页
    4 讨论第46页
    5 小结第46-47页
第五章 结论第47-48页
参考文献第48-54页
Abstract第54-55页
附录第56-74页
致谢第74页

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