| 摘要 | 第7-9页 |
| 主要中英文术语缩写对照 | 第9-10页 |
| 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 介绍 | 第10页 |
| 1.2 基因组选择的实施 | 第10-12页 |
| 1.3 用于基因组预测的统计方法 | 第12-18页 |
| 1.3.1 逐步回归 | 第13页 |
| 1.3.2 BLUP | 第13-14页 |
| 1.3.3 岭回归 | 第14页 |
| 1.3.4 贝叶斯A | 第14-16页 |
| 1.3.5 贝叶斯B和贝叶斯CPi | 第16-17页 |
| 1.3.6 贝叶斯Lasso | 第17-18页 |
| 1.4 小结 | 第18-21页 |
| 1 前言 | 第21-24页 |
| 2 材料和方法 | 第24-37页 |
| 2.1 贝叶斯方法要点 | 第24-29页 |
| 2.1.1 贝叶斯推断 | 第24-25页 |
| 2.1.2 马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)抽样算法 | 第25页 |
| 2.1.3 点估计和优选准则 | 第25-26页 |
| 2.1.4 先验分布 | 第26-29页 |
| 2.2 群体模拟 | 第29-32页 |
| 2.2.1 QMsim软件及群体模拟 | 第29-31页 |
| 2.2.2 群体数据的整理 | 第31页 |
| 2.2.3 建立训练群和验证群 | 第31-32页 |
| 2.3 基因组预测方法的实施 | 第32-37页 |
| 2.3.1 可用的基因组预测模型 | 第32-33页 |
| 2.3.2 GS3软件及其模型假设 | 第33-34页 |
| 2.3.3 各预测模型和方法参数文件的设置 | 第34-36页 |
| 2.3.4 MCMC后验分布抽样的参数设置 | 第36页 |
| 2.3.5 其他输入文件及GS3运行 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-53页 |
| 3.1 QMsim群体模拟结果 | 第37-43页 |
| 3.2 不同信息来源、模型和预测方法的研究结果 | 第43-49页 |
| 3.3 不同训练群规模的研究结果 | 第49-52页 |
| 3.5 不同MCMC后验抽样次数及残差校正间隔的分析结果 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-58页 |
| 4.1 总体性能 | 第53页 |
| 4.2 预测模型对GEBV预测准确度的影响 | 第53页 |
| 4.3 训练群信息来源对GEBV预测准确度的影响 | 第53-54页 |
| 4.4 预测方法对GEBV预测准确度的影响 | 第54-56页 |
| 4.5 抽样次数和校正间隔对GEBV预测准确度的影响 | 第56页 |
| 4.6 训练群规模对GEBV预测准确度的影响 | 第56-57页 |
| 4.7 影响基因组选择的其他因素 | 第57页 |
| 4.8 交叉验证在遗传改良上的应用 | 第57-58页 |
| 5 结论 | 第58-59页 |
| 创新与特色 | 第59-60页 |
| 进一步的研究内容 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| ABSTRACT | 第67-68页 |
| 致谢 | 第69页 |
