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斜纹夜蛾诱导大豆抗虫防御反应转录谱分析和分子功能研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
缩略词第14-15页
第一部分 文献综述第15-49页
 第一章 植物诱导型抗虫性研究进展第15-31页
  1 植物与昆虫的关系概述第15-16页
  2 植物抗虫性及其分类第16-20页
   ·组成抗虫性第17-18页
   ·诱导抗虫性第18-20页
  3 诱导抗虫防御理化机制第20-27页
   ·直接防御第20-22页
     ·物理防御的形态特征第20-21页
     ·化学防御相关的代谢物和酶第21-22页
   ·间接防御第22-23页
   ·诱导防御中的信号分子及途径第23-27页
     ·系统素第23-24页
     ·茉莉酸第24-26页
     ·乙烯第26页
     ·信号途径和分子互作第26-27页
  4 大豆诱导抗虫研究进展第27-31页
   ·大豆抗食叶性害虫概述第27-28页
   ·大豆诱导抗虫相关研究第28-31页
 第二章 转录组学及其在植物抗虫研究中的应用第31-47页
  1 转录组学概念及研究内容第31页
  2 转录组学研究技术第31-44页
   ·基因芯片表达谱技术及应用第32-36页
     ·基因芯片技术的概念和方法第32-33页
     ·基因芯片的应用第33-34页
     ·基因芯片技术的特点和前景展望第34-36页
   ·RNA-Seq转录谱技术及应用第36-42页
     ·RNA-Seq概念和方法第36-38页
     ·RNA-Seq的应用第38-40页
     ·RNA-Seq的特点及前景展望第40-42页
   ·转录谱生物信息学分析第42-44页
  3 植物防御转录组研究进展第44-47页
 本研究的目的与意义第47-49页
第二部分 研究报告第49-127页
 第三章 斜纹夜蛾诱导大豆的抗性水平动态分析第49-55页
  1 材料与方法第49-51页
   ·实验材料第49页
   ·材料种植与诱导处理第49-50页
   ·抗虫生物鉴定第50-51页
     ·斜纹夜蛾对寄主的双向选择实验第50-51页
     ·斜纹夜蛾强迫饲喂实验第51页
  2 结果与分析第51-53页
   ·诱导抗性方差分析第51页
   ·抗感品种诱导抗性变化趋势第51-52页
   ·最高时间点诱导抗性比较第52-53页
  3 讨论第53-55页
 第四章 大豆诱导抗虫转录谱分析第55-79页
  1 材料与方法第55-64页
   ·实验材料第55-56页
   ·大豆叶片总RNA的提取第56页
   ·RNA的纯化第56-57页
   ·芯片实验步骤及数据分析第57-59页
     ·RNA浓度和质量检测第57页
     ·cDNA合成第57-58页
     ·体外转录合成生物素标记cRNA及其片段化第58页
     ·芯片杂交及后期扫描第58-59页
     ·数据处理及分析第59页
   ·RNA-Seq实验步骤及数据分析第59-62页
     ·RNA浓度和质量检测第59-60页
     ·测序文库的构建第60页
     ·测序序列拼接和组装第60-61页
     ·Unigene表达差异分析第61页
     ·数据功能注释分析第61-62页
   ·荧光定量PCR及数据分析第62-64页
  2 结果与分析第64-75页
   ·转录谱质量及差异基因表达分析第64-66页
     ·芯片表达谱质量分析第64-65页
     ·RNA-Seq转录谱质量分析第65-66页
   ·抗感品种差异基因表达谱功能分析第66-71页
     ·芯片表达谱差异基因功能分类第66-67页
     ·RNA-Seq转录谱差异基因功能分类第67-69页
     ·表达谱鉴定一致的差异基因分析第69-71页
   ·荧光定量PCR验证结果第71-73页
   ·关键基因时空表达分析第73-75页
  3 讨论第75-79页
   ·基因芯片和RNA-Seq表达谱比较分析第75-76页
   ·大豆诱导抗虫反应的分子机理初探第76-78页
   ·候选基因时空表达与诱导抗虫动态反应之间的联系第78-79页
 第五章 大豆GmVSPβ和GmN:IFR的克隆及功能分析第79-101页
  1 材料与方法第79-86页
   ·实验材料第79-80页
   ·主要仪器及试剂第80页
     ·主要仪器第80页
     ·主要试剂第80页
   ·宿主菌与质粒载体第80页
   ·引物合成及测序第80页
   ·植物基因组DNA的提取方法第80-81页
   ·植物总RNA的提取、纯化及cDNA第一链的合成第81页
     ·植物总RNA的提取(TRIZOL法)第81页
     ·RNA的纯化第81页
     ·cDNA第一链的合成第81页
   ·GmVSPβ和GmN:IFR基因的克隆第81-82页
   ·GmVSPβ和GmN:IFR基因序列及氨基酸序列分析第82页
   ·植物表达载体的构建第82-83页
     ·入门载体pDONOR221-GmVSPβ和pDONOR221-GmN:IFR的获得第83页
     ·目的载体pMDC83-GmVSPβ和pMDC83-GmN:IFR的构建第83页
   ·农杆菌介导叶盘法转化烟草第83-84页
     ·受体材料的准备第83-84页
     ·农杆菌介导法转化烟草第84页
   ·转基因烟草阳性植株的鉴定第84-85页
   ·转基因烟草的抗虫性实验第85页
     ·双向选择实验第85页
     ·活体强迫饲养实验第85页
   ·转基因烟草抗虫相关基因表达的分析第85-86页
  2 结果与分析第86-96页
   ·GmVSPβ和GmN:IFR基因的克隆及序列分析第86-87页
   ·大豆GmVSPβ基因的生物信息学分析第87-88页
   ·大豆GmN:IFR基因的生物信息学分析第88-90页
   ·植物过表达载体的构建第90-91页
   ·转基因烟草阳性苗鉴定及表达量分析第91-93页
   ·转基因烟草抗虫性的鉴定和分析第93-94页
   ·转基因烟草抗虫相关基因的表达分析第94-96页
  3 讨论第96-101页
 第六章 大豆诱导抗虫转录调控机制探索第101-127页
  1 材料与方法第102-111页
   ·实验材料第102页
   ·主要仪器和主要试剂第102-103页
   ·宿主菌与质粒载体第103页
   ·引物合成及测序第103页
   ·GmVSPβ和GmN:IFR基因启动子的克隆和序列分析第103-104页
   ·启动子报告载体的构建第104-106页
   ·12个转录因子的克隆和序列分析第106-107页
   ·转录因子效应载体的构建第107-108页
   ·拟南芥原生质体制备液的配置第108-109页
   ·拟南芥原生质体的分离纯化第109-110页
   ·PEG-Ca~(2+)介导的质粒转染和培养第110-111页
   ·LUC报告基因表达活性检测第111页
  2 结果与分析第111-123页
   ·GmVSPs和GmN:IFR基因启动子的克隆及序列分析第111-114页
   ·转录因子cDNA克隆和序列分析第114-118页
   ·报告载体和效应载体的构建第118-120页
   ·拟南芥原生质体提取第120-121页
   ·瞬时表达转录调控活性分析第121-123页
  3 讨论第123-127页
全文结论第127-129页
本研究创新之处第129-131页
参考文献第131-153页
附录第153-157页
攻读学位期间发表与待发表的论文第157-159页
致谢第159页

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