摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
第一章 生物膜及其膜界面水分子的实验和分子动力学模拟结果简介 | 第8-14页 |
·生物膜概述 | 第8-10页 |
·生物膜界面实验研究 | 第10-12页 |
·生物膜界面分子动力学模拟结果介绍 | 第12-13页 |
·本章小结 | 第13-14页 |
第二章 分子动力学模拟方法介绍 | 第14-23页 |
·分子动力学模拟及其局限性 | 第14-15页 |
·分子动力学 | 第15页 |
·基本原理 | 第15页 |
·分子动力学模拟的主要流程 | 第15页 |
·力场 | 第15-18页 |
·非键相互作用势能 | 第15-16页 |
·成键相互作用势能 | 第16-18页 |
·各种控制算法 | 第18-22页 |
·积分算法 | 第19页 |
·控温算法 | 第19-20页 |
·控压算法 | 第20-22页 |
·分子动力学软件Gromacs介绍 | 第22-23页 |
第三章 不同力场中磷脂双层膜界面水行为比较研究 | 第23-32页 |
·引言 | 第23页 |
·模拟参数和方法 | 第23-24页 |
·模拟结果分析 | 第24-30页 |
·磷脂双层膜的基本性质 | 第24-25页 |
·在Berger力场下磷脂分子的不同部位氧原子的氢键能量概率分布 | 第25-27页 |
·在不同力场下磷脂分子的不同部位的氧原子氢键能量概率分布 | 第27-30页 |
·结论 | 第30-32页 |
第四章 阳离子对磷脂膜界面附近水分子的偶极取向影响 | 第32-43页 |
·引言 | 第32-33页 |
·模拟参数和方法 | 第33-35页 |
·模拟结果分析 | 第35-41页 |
·结论 | 第41-43页 |
第五章 总结与展望 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-51页 |
读研期间发表的论文 | 第51页 |
读研期间参与的项目 | 第51-52页 |
致谢 | 第52-53页 |