| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第1章 引言 | 第9-14页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·研究意义 | 第10-11页 |
| ·国内外研究现状 | 第11-12页 |
| ·研究内容与研究目标 | 第12-13页 |
| ·论文结构 | 第13-14页 |
| 第2章 GPU 通用计算与 GPU 并行编程 | 第14-26页 |
| ·GPU 通用计算 | 第14-17页 |
| ·GPU 通用计算简介 | 第14-15页 |
| ·GPU 通用计算的优势 | 第15-17页 |
| ·CUDA 并行计算平台和 CUDA 编程模型 | 第17-22页 |
| ·CUDA 并行计算平台 | 第18页 |
| ·CUDA 线程执行模型 | 第18-19页 |
| ·CUDA 内存模型 | 第19-22页 |
| ·CUDA 常用开发工具 | 第22页 |
| ·MPI 并行编程模型 | 第22-24页 |
| ·MPI 和 CUDA 混合编程模型 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 球谐变换快速展开算法 | 第26-38页 |
| ·球谐变换 | 第26-32页 |
| ·球谐变换数学基础 | 第26-28页 |
| ·快速傅里叶变换的数学基础 | 第28-30页 |
| ·切比雪夫—勒让德变换数学基础 | 第30-32页 |
| ·球谐变换展开算法 | 第32-37页 |
| ·球谐变换的超定方程组展开算法 | 第32页 |
| ·球谐变换快速展开算法 | 第32-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 球谐变换展开算法的程序设计 | 第38-53页 |
| ·球谐函数快速展开算法优化策略 | 第38-45页 |
| ·矩阵乘法优化策略 | 第38-39页 |
| ·矩阵转置优化策略 | 第39-41页 |
| ·程序显存池设计 | 第41-44页 |
| ·数据访问优化策略 | 第44-45页 |
| ·CUDA 开发库 | 第45-47页 |
| ·CUBLAS | 第45页 |
| ·CUFFT | 第45-47页 |
| ·球谐变换展开算法程序设计 | 第47-49页 |
| ·球谐变换快速展开算法串行程序设计 | 第47页 |
| ·球谐变换快速展开算法 CUDA 并行程序设计 | 第47-48页 |
| ·球谐变换快速展开算法 CUDA+MPI 并行程序设计 | 第48-49页 |
| ·球谐变换展开算法实验 | 第49-50页 |
| ·实验 Ⅰ | 第49页 |
| ·实验 Ⅱ | 第49-50页 |
| ·实验 Ⅲ | 第50页 |
| ·实验总结及分析 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第5章 GPU 球谐变换加速分子模拟 | 第53-59页 |
| ·基于球谐变换的分子结构相似性比较模型 | 第53-55页 |
| ·基于 GPU 的球谐变换的分子结构相似性模拟 | 第55-56页 |
| ·实验结果与实验分析 | 第56-59页 |
| 第6章 结论与展望 | 第59-61页 |
| ·结论 | 第59-60页 |
| ·展望 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-64页 |