| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 图表清单 | 第9-11页 |
| 缩略词 | 第11-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-33页 |
| ·生物固氮 | 第13-14页 |
| ·根瘤菌与豆科植物共生体系 | 第14-17页 |
| ·根瘤菌与豆科植物的进化 | 第14-15页 |
| ·根瘤菌与宿主植物共生体系的建立过程 | 第15-17页 |
| ·种群遗传学研究 | 第17-19页 |
| ·大豆根瘤菌研究进展 | 第19-30页 |
| ·大豆根瘤菌基因组研究 | 第20-22页 |
| ·大豆根瘤菌遗传多样性研究进展 | 第22-25页 |
| ·大豆根瘤菌生物地理学研究 | 第25-30页 |
| ·研究目的及意义 | 第30-31页 |
| ·项目资助 | 第31-33页 |
| 第二章 大豆慢生根瘤菌分子进化学分析 | 第33-67页 |
| ·引言 | 第33-34页 |
| ·材料与方法 | 第34-45页 |
| ·供试菌株 | 第34页 |
| ·选取代表菌株 | 第34-41页 |
| ·选择扩增基因 | 第41-42页 |
| ·扩增基因 | 第42-43页 |
| ·计算SMc00019-truA-thrA的ANI值 | 第43-44页 |
| ·核心基因和共生基因的系统发育分析 | 第44页 |
| ·序列多态性分析及种群学分析 | 第44页 |
| ·计算基因及不同种群的基因重组 | 第44-45页 |
| ·种群结构分析 | 第45页 |
| ·结果与分析 | 第45-62页 |
| ·代表菌株和12个基因扩增 | 第45-47页 |
| ·根据核心基因(SMc00019-truA-thrA)的ANI值划分种群 | 第47-48页 |
| ·核苷酸多态性研究 | 第48-50页 |
| ·大豆慢生根瘤菌的系统发育分析 | 第50-54页 |
| ·遗传重组在大豆慢生根瘤菌进化中的作用 | 第54-56页 |
| ·Bradyrhizobium种群的遗传分化和基因流研究 | 第56-62页 |
| ·讨论 | 第62-67页 |
| ·大豆慢生根瘤菌遗传多样性 | 第63页 |
| ·大豆慢生根瘤菌遗传分化 | 第63-64页 |
| ·大豆慢生根瘤菌共生岛独特的进化历程 | 第64-67页 |
| 第三章 土著大豆根瘤菌生物地理分布的高通量研究 | 第67-121页 |
| ·引言 | 第67页 |
| ·试验材料及方法 | 第67-77页 |
| ·全国三个生态区采样点概述 | 第67-69页 |
| ·土壤DNA提取 | 第69-70页 |
| ·根瘤菌的分离、纯化和保存 | 第70页 |
| ·根瘤菌DNA提取 | 第70页 |
| ·根瘤菌的IGS PCR-RFLP | 第70-71页 |
| ·根瘤菌BOX-PCR指纹图谱 | 第71-72页 |
| ·四个根瘤菌属参比菌株的rpoB基因扩增 | 第72页 |
| ·采样点土壤性质测定 | 第72-75页 |
| ·测序结果分析方法 | 第75-77页 |
| ·结果与分析 | 第77-110页 |
| ·不同生态区大豆非根际土壤微生物的α多样性分析 | 第77-81页 |
| ·不同生态区大豆非根际土壤微生物的群落组成分析 | 第81-90页 |
| ·不同生态区大豆非根际土壤微生物的β多样性分析 | 第90-91页 |
| ·代表属的多样性研究 | 第91-100页 |
| ·土壤微生物的生物地理分布特征与土壤理化性质的相关性研究 | 第100-106页 |
| ·与大豆结瘤的根瘤菌多样性研究 | 第106-110页 |
| ·讨论 | 第110-121页 |
| ·土壤微生物生物地理分布特征及形成机制 | 第111-117页 |
| ·根瘤菌的生物地理分布特征 | 第117-121页 |
| 结论与展望 | 第121-123页 |
| 结论 | 第121-122页 |
| 展望 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-141页 |
| 致谢 | 第141-143页 |
| 附录 | 第143-145页 |
| 个人简历 | 第145页 |
