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组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分子设计、合成与作用方式

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 绪论第11-38页
   ·组蛋白去乙酰化酶第11-21页
     ·组蛋白去乙酰化酶的分类第11-12页
     ·组蛋白去乙酰化酶的功能第12-15页
     ·得到的组蛋白去乙酰化酶晶体结构第15-21页
   ·组蛋白去乙酰化酶抑制剂第21-27页
     ·组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分类第21-26页
     ·组蛋白去乙酰化酶抑制剂研究进展第26-27页
   ·计算机辅助药物设计第27-36页
     ·计算机辅助药物设计的分类第28页
     ·分子模拟方法第28-36页
   ·本论文研究内容第36-38页
2 基于L-2 -氨基-n-溴烷酸的新型抑制剂的设计、合成与作用方式第38-60页
   ·引言第38-40页
   ·实验及分子模拟方法第40-49页
     ·实验材料第40-42页
     ·实验仪器第42-43页
     ·实验方法第43-48页
     ·化合物与HDAC2和HDAC8的分子对接第48页
     ·化合物与HDAC2和HDAC8相互作用的分子动力学模拟第48-49页
     ·化合物与HDAC2和HDAC8的结合自由能分析第49页
   ·结果与讨论第49-59页
     ·新型抑制剂的设计第49-52页
     ·新化合物的合成第52页
     ·候选抑制剂的活性第52-53页
     ·抑制剂与HDAC2和HDAC8相互作用的分子动力学模拟第53-57页
     ·抑制剂与HDAC2和HDAC8的结合自由能分析第57-59页
   ·小结第59-60页
3 基于L-2-氨基-8-溴辛酸的新型抑制剂的设计、合成与构效关系第60-77页
   ·引言第60-61页
   ·实验及分子模拟方法第61-70页
     ·实验材料第61-62页
     ·实验仪器第62-63页
     ·实验方法第63-69页
     ·化合物与HDAC2的分子对接第69页
     ·化合物与HDAC2相互作用的分子动力学模拟第69页
     ·化合物与HDAC2的结合自由能分析第69-70页
   ·结果与讨论第70-76页
     ·新型抑制剂的设计第70-72页
     ·新化合物的合成第72页
     ·候选抑制剂的活性第72-73页
     ·抑制剂与HDAC2相互作用的分子动力学模拟第73-75页
     ·抑制剂与HDAC2的结合自由能分析第75-76页
   ·小结第76-77页
4 环肽类抑制剂的设计与作用方式第77-84页
   ·引言第77-78页
   ·分子模拟方法第78页
     ·化合物与HDAC2和HDAC4的分子对接第78页
     ·化合物与HDAC2和HDAC4相互作用的分子动力学模拟第78页
   ·结果与讨论第78-83页
     ·新型环肽类抑制剂的设计第78-80页
     ·环肽类抑制剂与HDAC2和HDAC4的作用方式第80-83页
   ·小结第83-84页
5 HDAC8选择性抑制剂的作用方式与分子设计第84-99页
   ·引言第84-86页
   ·分子模拟方法第86-88页
     ·抑制剂与HDAC8的分子对接第86-87页
     ·抑制剂与HDAC8相互作用的分子动力学模拟第87-88页
   ·结果与讨论第88-98页
     ·抑制剂与HDAC8之间的作用方式第88-96页
     ·HDAC8选择性抑制剂的分子设计第96-98页
   ·小结第98-99页
结论与展望第99-101页
创新点摘要第101-102页
参考文献第102-112页
附录A 目标化合物的ESI-MS、~1H-NMR、~(13)C-NMR图谱第112-136页
附录B 部分分子模拟所用参数文件第136-141页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第141-142页
致谢第142-143页
作者简介第143-144页

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