| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-18页 |
| 插图与附表清单 | 第18-23页 |
| 英文缩写词表 | 第23-25页 |
| 第一章 绪论 | 第25-49页 |
| ·庚型肝炎病毒 | 第25-39页 |
| ·庚型肝炎病毒的发现和命名 | 第25页 |
| ·庚型肝炎病毒的结构及其基因组特征 | 第25-28页 |
| ·庚型肝炎病毒的诊断 | 第28-30页 |
| ·庚型肝炎病毒的基因型的分布及分型方法 | 第30-35页 |
| ·庚型肝炎病毒的起源与进化 | 第35-39页 |
| ·庚型肝炎病毒传播和流行 | 第39-41页 |
| ·庚型肝炎病毒的传播途径 | 第39-40页 |
| ·庚型肝炎病毒的流行 | 第40-41页 |
| ·庚型肝炎病毒的生物学特性 | 第41-45页 |
| ·庚型肝炎病毒的致病性 | 第41-42页 |
| ·庚型肝炎病毒与艾滋病病毒 | 第42-45页 |
| ·研究云南地区病毒分子流行病学的意义 | 第45-47页 |
| ·云南省特殊的地理位置 | 第45页 |
| ·云南地区病毒传播对我国病毒流行的影响 | 第45-47页 |
| ·本论文研究的目的和意义 | 第47-48页 |
| ·本论文的创新点 | 第48-49页 |
| 第二章 云南省GBV-C的流行及其与临床指标的相关性分析 | 第49-66页 |
| ·引言 | 第49-50页 |
| ·本章技术路线 | 第50页 |
| ·实验材料和方法 | 第50-52页 |
| ·实验材料 | 第50页 |
| ·主要试剂 | 第50-51页 |
| ·仪器设备 | 第51页 |
| ·实验方法 | 第51-52页 |
| ·实验结果 | 第52-62页 |
| ·本研究样本临床指标统计 | 第52-53页 |
| ·云南地区不同人群中GBV-C RT-PCR检测结果 | 第53-54页 |
| ·云南省GBV-C的流行 | 第54页 |
| ·云南省静脉吸毒人群中不同病原体的感染率分析 | 第54-55页 |
| ·云南省非静脉吸毒人群中不同病原体的感染率分析 | 第55-56页 |
| ·云南省不同地州和不同人群的GBV-C感染情况 | 第56-57页 |
| ·云南省静脉吸毒人群HIV患者不同病程中GBV-C的流行 | 第57-58页 |
| ·云南省静脉吸毒人群中GBV-C对HIV/HCV共感染患者影响 | 第58-59页 |
| ·云南省静脉吸毒人群中GBV-C对HCV患者的影响 | 第59-60页 |
| ·云南省非静脉吸毒人群中GBV-C对HCV患者的影响 | 第60页 |
| ·云南省不同人群中GBV-C与HCV基因型和亚型的相关性分析 | 第60-62页 |
| ·讨论 | 第62-65页 |
| ·云南省不同地区不同人群中GBV-C的感染率 | 第62页 |
| ·本研究中GBV-C诊断指标的选择 | 第62-63页 |
| ·本研究中GBV-C感染的偏好性 | 第63-64页 |
| ·本研究中GBV-C的感染与HIV患者临床指标的相关性 | 第64页 |
| ·GBV-C影响HIV患者临床指标的研究 | 第64-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 第三章 云南地区GBV-C基因型分布与新基因型的发现 | 第66-90页 |
| ·引言 | 第66-67页 |
| ·本章技术路线 | 第67-68页 |
| ·实验材料和方法 | 第68-72页 |
| ·实验材料 | 第68页 |
| ·主要试剂 | 第68页 |
| ·仪器设备 | 第68页 |
| ·实验方法 | 第68-72页 |
| ·实验结果 | 第72-83页 |
| ·GBV-C 5'NCR和E2区RT-PCR的扩增 | 第72-73页 |
| ·GBV-C 5'NCR和E2区扩增片段测序结果 | 第73-74页 |
| ·GBV-C 5'NCR和E2区序列基因分型的能力分析 | 第74-75页 |
| ·基于GBV-C 5'NCR区序列对GBV-C的基因分型 | 第75-76页 |
| ·基于GBV-C E2区序列对GBV-C的基因分型 | 第76-77页 |
| ·GBV-C全基因组序列的扩增 | 第77-78页 |
| ·GBV-C全基因组序列片段测序和序列拼接 | 第78页 |
| ·GBV-C 7型与其它基因型间核苷酸序列相似性比较 | 第78-79页 |
| ·基于GBV-C全长基因序列对GBV-C的基因型的分析 | 第79-80页 |
| ·GBV-C 7型重组位点的分析 | 第80-81页 |
| ·云南省GBV-C基因型的流行特点 | 第81-82页 |
| ·GBV-C E2区与HIV相互作用的氨基酸位点的分析 | 第82-83页 |
| ·讨论 | 第83-88页 |
| ·GBV-C基因型的命名 | 第83页 |
| ·GBV-C基因分型的标准 | 第83-86页 |
| ·我国GBV-C基因型流行特点 | 第86-87页 |
| ·云南省GBV-C基因型流行及其分析 | 第87-88页 |
| ·GBV-C与HIV间的相互作用 | 第88页 |
| ·小结 | 第88-90页 |
| 第四章 庚型肝炎病毒的起源与进化 | 第90-119页 |
| ·引言 | 第90-91页 |
| ·技术路线图 | 第91-92页 |
| ·材料与方法 | 第92-94页 |
| ·实验材料 | 第92页 |
| ·主要软件 | 第92页 |
| ·实验方法 | 第92-94页 |
| ·实验结果 | 第94-111页 |
| ·GBV-C的进化速率 | 第94-95页 |
| ·GBV-C的起源 | 第95-96页 |
| ·GBV-C的基因组序列的变异特征 | 第96-97页 |
| ·基于高变区序列进行GBV-C的基因分型 | 第97-98页 |
| ·基于E1/E2高变区序列进行GBV-C的基因分型 | 第98-99页 |
| ·不同基因型GBV-C的分子进化速率 | 第99-100页 |
| ·GBV-C五种基因型流行及其进化特征 | 第100-109页 |
| ·南省GBV-C主要基因型的流行及其进化特征 | 第109-111页 |
| ·讨论 | 第111-118页 |
| ·GBV-C的分子进化速率 | 第111-114页 |
| ·GBV-C进化速率的选择 | 第114页 |
| ·GBV-C各基因型起源进化的比较 | 第114-115页 |
| ·中国GBV-C主要流行株的传播 | 第115-117页 |
| ·研究病毒起源及其进化动力学的意义 | 第117-118页 |
| ·小结 | 第118-119页 |
| 第五章 庚型肝炎病毒自身高清除率与机体microRNA的相关性 | 第119-143页 |
| ·引言 | 第119-120页 |
| ·技术路线 | 第120-121页 |
| ·实验材料与方法 | 第121-125页 |
| ·实验材料 | 第121-122页 |
| ·主要试剂 | 第122-123页 |
| ·仪器设备 | 第123页 |
| ·实验方法 | 第123-125页 |
| ·实验结果 | 第125-134页 |
| ·与GBV-C 3'NCR区序列相关的microRNA预测 | 第125-127页 |
| ·GBV-C 3'NCR区序列相关microRNA的筛选 | 第127页 |
| ·GBV-C3'NCR和microRNA基因定性PCR检测 | 第127-128页 |
| ·GBV-C 3'NCR和microRNA基因的测序结果 | 第128-129页 |
| ·GBV-C 3'NCR和microRNA基因荧光定量PCR检测方法的建立 | 第129-130页 |
| ·GBV-C 3'NCR与microRNA基因真核表达体系的建立 | 第130-132页 |
| ·microRNA与GBV-C 3'NCR间的相互作用 | 第132页 |
| ·Has-mir-148a与GBV-C 3'NCR间的相互作用 | 第132-134页 |
| ·讨论 | 第134-141页 |
| ·MicroRNA的检测方法的选择 | 第134-136页 |
| ·本研究检测体系中参照基因的选择 | 第136-137页 |
| ·Has-miR-148a与GBV-C 3'NCR间的相互作用 | 第137-138页 |
| ·Has-miR-148a与GBV-C 3'NCR作用位点的分析 | 第138-139页 |
| ·Has-miR-148a的其它生物学功能 | 第139-140页 |
| ·GBV-C的高清除率与Has-miR-148a的相关性 | 第140-141页 |
| ·小结 | 第141-143页 |
| 第六章 结论与展望 | 第143-147页 |
| 致谢 | 第147-148页 |
| 参考文献 | 第148-161页 |
| 附录A 攻读硕士期间发表论文目录 | 第161页 |
