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节旋藻染色体外DNA的分布和相关基因的结构及功能探究

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
符号说明第7-12页
1 绪论第12-28页
   ·节旋藻基因组学和系统分类学的研究第13-21页
     ·节旋藻全基因组测序研究进展第13-18页
     ·节旋藻分子系统学研究进展第18-21页
   ·节旋藻染色体外DNA的研究第21-26页
     ·蓝藻染色体外DNA的研究进展第21-23页
     ·节旋藻染色体外DNA的研究进展第23-25页
     ·节旋藻染色体外DNA的研究方法及应用第25-26页
   ·本文的研究内容与意义第26-28页
     ·研究目的与意义第26页
     ·研究内容和方法第26-28页
2 节旋藻藻株的分离与鉴定第28-50页
   ·前言第28页
   ·材料与方法第28-32页
     ·实验藻株第28-29页
     ·实验试剂第29-31页
     ·仪器与设备第31-32页
   ·节旋藻藻种的分离纯化与形态学观察第32-33页
     ·藻体的收集与富集培养第32页
     ·藻体的分离纯化与扩大培养第32-33页
     ·藻种的形态学观察第33页
   ·节旋藻的生长曲线第33页
   ·节旋藻全基因组提取方法的比较研究第33-36页
     ·藻株及提取样品处理第33-34页
     ·全基因组提取第34-36页
   ·DNA的定量与纯化分析第36页
   ·PCR引物设计与扩增第36-37页
     ·16S rRNA基因PCR扩增第36页
     ·ITS基因PCR扩增第36-37页
   ·PCR产物的克隆及序列测定第37-38页
     ·琼脂糖凝胶回收第37页
     ·感受态细胞的制备第37页
     ·目的基因的连接转化及测序第37-38页
   ·序列分析及系统进化树的构建第38页
   ·结果与讨论第38-48页
     ·节旋藻的形态观察第38-39页
     ·节旋藻的生长曲线第39-40页
     ·节旋藻全基因组提取方法的比较研究第40-45页
     ·基于16S rRNA-ITS区基因序列的节旋藻分子鉴定第45-48页
   ·小结第48-50页
3 节旋藻染色体外DNA分布的研究第50-60页
   ·前言第50-51页
   ·实验材料第51页
     ·实验藻种第51页
     ·试剂与仪器第51页
   ·节旋藻染色体外DNA的提取第51页
     ·藻株样品的制备第51页
     ·染色体外DNA提取与琼脂糖凝胶电泳第51页
   ·节旋藻染色体外DNA的回收与纯化第51-52页
     ·节旋藻染色体外DNA的回收第51-52页
     ·节旋藻染色体外DNA的纯化第52页
   ·节旋藻染色体外DNA分子形状研究第52页
   ·节旋藻染色体外DNA的扫描电子显微镜观察第52-53页
     ·材料、试剂和仪器第52-53页
     ·操作步骤第53页
   ·结果与讨论第53-59页
     ·节旋藻染色体外DNA的分布第53-56页
     ·节旋藻染色体外DNA的分布与特点第56页
     ·不同生长阶段节旋藻染色体外DNA的分布情况第56-57页
     ·节旋藻染色体外DNA的回收第57-58页
     ·节旋藻染色体外DNA的扫描电镜观察第58-59页
   ·小结第59-60页
4 节旋藻染色体外DNA相关基因的功能探究第60-73页
   ·引言第60页
   ·实验材料第60-61页
     ·藻种第60页
     ·培养基及藻体培养第60页
     ·主要试剂与耗材第60页
     ·主要使用仪器及软件第60-61页
   ·研究方法第61-63页
     ·荧光定量Real-time PCR技术平台第61-62页
     ·不同形态突变藻丝体钝顶节旋藻染色体外DNA的研究第62页
     ·不同生长阶段钝顶节旋藻染色体外DNA的研究第62页
     ·重金属胁迫条件下钝顶节旋藻exDNA的研究第62-63页
     ·低温处理情况下的钝顶节旋藻染色体外DNA的研究第63页
   ·结果与讨论第63-71页
     ·Real-time PCR可靠性评估第63-68页
     ·不同突变形态藻丝体的节旋藻染色体外DNA分布情况第68页
     ·不同生长阶段节旋藻J12的染色体外DNA相关基因的相对定量第68-70页
     ·不同Pb~(2+)浓度条件下节旋藻CG的染色体外DNA相关基因相对定量第70-71页
     ·低温冻融条件下节旋藻染色体外DNA的分布情况第71页
   ·小结第71-73页
5 节旋藻染色体外DNA相关基因的结构研究第73-86页
   ·前言第73页
   ·节旋藻染色体外DNA相关基因的比较基因组学分析第73-75页
     ·节旋藻染色体外DNA相关基因的挖掘第73-75页
     ·多序列联配与系统发育分析第75页
     ·假定节旋藻染色体外DNA相关基因及其保守基序的鉴定第75页
   ·节旋藻染色体外DNA相关基因的同源克隆第75-76页
     ·引物设计第75-76页
     ·同源克隆PCR扩增反应体系与反应程序第76页
   ·结果与讨论第76-85页
     ·比较基因组学挖掘节旋藻染色体外DNA相关基因第76-78页
     ·节旋藻染色体外DNA假定相关基因的相似性比较和保守结构域分析第78-84页
     ·节旋藻染色体外DNA相关基因的同源克隆第84-85页
   ·小结第85-86页
第六章 结论第86-87页
参考文献第87-95页
攻读学位期间主要的研究成果第95-96页
致谢第96页

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