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位置候选基因HMGA1、C6orf106和ENSSSCG00000023160与猪肢蹄结实度的关联性研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第10-28页
 1 引言第10页
 2 肢蹄结实度第10-14页
   ·肢蹄结实度的定义第10页
   ·肢蹄软弱的危害第10-11页
     ·肢蹄软弱给种猪带来的危害第10-11页
     ·肢蹄软弱给商品猪带来的危害第11页
   ·影响肢蹄结实度因素第11-13页
     ·品种和人为选育第11-12页
     ·疾病第12页
     ·繁殖因素第12页
     ·营养因素第12-13页
     ·饲养管理方式第13页
     ·运动缺乏第13页
   ·肢蹄结实度的遗传力第13页
   ·肢蹄结实度的评估手段第13-14页
 3 软骨病第14-16页
   ·软骨病的简介第14-15页
   ·软骨病的生理生化第15页
   ·肢蹄软弱和软骨病相关性研究第15-16页
   ·软骨病的评定方法第16页
   ·软骨病的研究进展第16页
 4 肢蹄结实度的研究进展第16-18页
   ·QTL 定位结果第16-18页
   ·全基因组关联分析的研究结果第18页
   ·候选基因法的研究第18页
 5 基因型填补第18-20页
   ·基因型填补的主要作用第19页
   ·基因型填补的主要原理第19页
   ·基因型填补的在其他物种中的主要运用第19-20页
 6 候选基因法的原理第20页
 7 软骨发育调节通路第20-21页
 8 本研究的前期工作基础第21-24页
   ·QTL 定位结果第21页
   ·全基因组关联分析结果第21页
   ·2.15 Mb 中的候选基因介绍第21-24页
     ·HMGA1 基因的研究进展第22-23页
     ·C6orf106 基因的研究进展第23页
     ·ENSSSCG00000023160 基因的研究进展第23-24页
 9 本研究的目的第24页
 参考文献第24-28页
第二章 实验内容第28-45页
 1 实验材料和方法第28-30页
   ·实验材料第28页
     ·资源群体第28页
     ·苏太群体第28页
     ·杜长大商业群体第28页
   ·表型性状测定第28-29页
   ·DNA 的提取第29页
   ·候选基因多态位点的搜寻第29-30页
     ·引物设计第29页
     ·PCR 扩增第29页
     ·测序第29页
     ·多态位点的鉴别第29-30页
   ·基因多态位点基因型判定第30页
     ·C6orf106 基因第30页
     ·HMGA1 基因第30页
 2 统计分析方法第30-32页
   ·基因型填补第30-31页
     ·ENSSSCG00000023160 基因型填补第30-31页
     ·基因型填补准确性评估第31页
   ·简单统计量的计算第31页
   ·关联分析模型的确定第31页
   ·关联分析第31-32页
 3 实验结果第32-39页
   ·多态位点搜寻结果第32页
     ·C6orf106 基因第32页
     ·ENSSSCG00000023160 基因第32页
   ·肢蹄结实度相关性状的简单统计量第32-34页
   ·C6orf106 基因与关节和蹄趾评分关联分析结果第34-35页
   ·11 个多态位点与肱二头肌长度和重量关联分析结果第35-36页
   ·11 个多态位点与肢步态评分关联分析结果第36-37页
   ·11 个多态位点与肢蹄评分关联分析结果第37-39页
 4 讨论第39-43页
   ·杜长大商品猪表型性状分析第40页
   ·基因型检测位点的筛选第40页
     ·HMGA1 基因第40页
     ·C6orf106 基因第40页
     ·ENSSSCG00000023160 基因第40页
   ·基因填补第40-41页
     ·基因填补的准确性第40-41页
     ·基因填补程序的选择第41页
   ·关联分析的临界值第41-42页
   ·关联分析结果讨论第42-43页
     ·HMGA1 基因第42页
     ·C6orf106 基因第42-43页
     ·ENSSSCG00000023160 基因第43页
 小结第43-44页
 参考文献第44-45页
附录第45-50页
论文发表情况第50-51页
致谢第51页

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