| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-28页 |
| 1 引言 | 第10页 |
| 2 肢蹄结实度 | 第10-14页 |
| ·肢蹄结实度的定义 | 第10页 |
| ·肢蹄软弱的危害 | 第10-11页 |
| ·肢蹄软弱给种猪带来的危害 | 第10-11页 |
| ·肢蹄软弱给商品猪带来的危害 | 第11页 |
| ·影响肢蹄结实度因素 | 第11-13页 |
| ·品种和人为选育 | 第11-12页 |
| ·疾病 | 第12页 |
| ·繁殖因素 | 第12页 |
| ·营养因素 | 第12-13页 |
| ·饲养管理方式 | 第13页 |
| ·运动缺乏 | 第13页 |
| ·肢蹄结实度的遗传力 | 第13页 |
| ·肢蹄结实度的评估手段 | 第13-14页 |
| 3 软骨病 | 第14-16页 |
| ·软骨病的简介 | 第14-15页 |
| ·软骨病的生理生化 | 第15页 |
| ·肢蹄软弱和软骨病相关性研究 | 第15-16页 |
| ·软骨病的评定方法 | 第16页 |
| ·软骨病的研究进展 | 第16页 |
| 4 肢蹄结实度的研究进展 | 第16-18页 |
| ·QTL 定位结果 | 第16-18页 |
| ·全基因组关联分析的研究结果 | 第18页 |
| ·候选基因法的研究 | 第18页 |
| 5 基因型填补 | 第18-20页 |
| ·基因型填补的主要作用 | 第19页 |
| ·基因型填补的主要原理 | 第19页 |
| ·基因型填补的在其他物种中的主要运用 | 第19-20页 |
| 6 候选基因法的原理 | 第20页 |
| 7 软骨发育调节通路 | 第20-21页 |
| 8 本研究的前期工作基础 | 第21-24页 |
| ·QTL 定位结果 | 第21页 |
| ·全基因组关联分析结果 | 第21页 |
| ·2.15 Mb 中的候选基因介绍 | 第21-24页 |
| ·HMGA1 基因的研究进展 | 第22-23页 |
| ·C6orf106 基因的研究进展 | 第23页 |
| ·ENSSSCG00000023160 基因的研究进展 | 第23-24页 |
| 9 本研究的目的 | 第24页 |
| 参考文献 | 第24-28页 |
| 第二章 实验内容 | 第28-45页 |
| 1 实验材料和方法 | 第28-30页 |
| ·实验材料 | 第28页 |
| ·资源群体 | 第28页 |
| ·苏太群体 | 第28页 |
| ·杜长大商业群体 | 第28页 |
| ·表型性状测定 | 第28-29页 |
| ·DNA 的提取 | 第29页 |
| ·候选基因多态位点的搜寻 | 第29-30页 |
| ·引物设计 | 第29页 |
| ·PCR 扩增 | 第29页 |
| ·测序 | 第29页 |
| ·多态位点的鉴别 | 第29-30页 |
| ·基因多态位点基因型判定 | 第30页 |
| ·C6orf106 基因 | 第30页 |
| ·HMGA1 基因 | 第30页 |
| 2 统计分析方法 | 第30-32页 |
| ·基因型填补 | 第30-31页 |
| ·ENSSSCG00000023160 基因型填补 | 第30-31页 |
| ·基因型填补准确性评估 | 第31页 |
| ·简单统计量的计算 | 第31页 |
| ·关联分析模型的确定 | 第31页 |
| ·关联分析 | 第31-32页 |
| 3 实验结果 | 第32-39页 |
| ·多态位点搜寻结果 | 第32页 |
| ·C6orf106 基因 | 第32页 |
| ·ENSSSCG00000023160 基因 | 第32页 |
| ·肢蹄结实度相关性状的简单统计量 | 第32-34页 |
| ·C6orf106 基因与关节和蹄趾评分关联分析结果 | 第34-35页 |
| ·11 个多态位点与肱二头肌长度和重量关联分析结果 | 第35-36页 |
| ·11 个多态位点与肢步态评分关联分析结果 | 第36-37页 |
| ·11 个多态位点与肢蹄评分关联分析结果 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-43页 |
| ·杜长大商品猪表型性状分析 | 第40页 |
| ·基因型检测位点的筛选 | 第40页 |
| ·HMGA1 基因 | 第40页 |
| ·C6orf106 基因 | 第40页 |
| ·ENSSSCG00000023160 基因 | 第40页 |
| ·基因填补 | 第40-41页 |
| ·基因填补的准确性 | 第40-41页 |
| ·基因填补程序的选择 | 第41页 |
| ·关联分析的临界值 | 第41-42页 |
| ·关联分析结果讨论 | 第42-43页 |
| ·HMGA1 基因 | 第42页 |
| ·C6orf106 基因 | 第42-43页 |
| ·ENSSSCG00000023160 基因 | 第43页 |
| 小结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-45页 |
| 附录 | 第45-50页 |
| 论文发表情况 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |