| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-24页 |
| ·肝硬化 | 第11-12页 |
| ·基因芯片 | 第12-15页 |
| ·基因表达谱的生物信息学分析 | 第15-24页 |
| 第二章 Agilent human genome 4×44 microarrays研究肝硬化及正常肝组织的差异基因表达谱 | 第24-37页 |
| ·材料与方法 | 第24-32页 |
| ·实验材料 | 第24-26页 |
| ·实验方法 | 第26-32页 |
| ·结果与分析 | 第32-36页 |
| ·总RNA的电泳检测结果 | 第32-33页 |
| ·芯片实验结果 | 第33-36页 |
| ·讨论 | 第36-37页 |
| 第三章 BRB ArrayTools、GSEA及DAVID、PANTHER等多种生物信息学工具的综合分析 | 第37-73页 |
| ·材料与方法 | 第38-41页 |
| ·BRB-ArrayTools分析肝硬化基因表达谱数据 | 第38-39页 |
| ·肝硬化差异表达基因的生物信息学分析 | 第39页 |
| ·GSEA分析肝硬化基因表达谱数据 | 第39-41页 |
| ·实验结果 | 第41-71页 |
| ·BRB-ArrayTools分析后得到的差异基因数 | 第41页 |
| ·肝硬化及正常肝组织差异表达基因列表 | 第41-53页 |
| ·差异基因的GATHER分析 | 第53-57页 |
| ·PANTHER分析肝硬化差异基因 | 第57-60页 |
| ·DAVID分析肝硬化的差异基因 | 第60-64页 |
| ·GSEA分析肝硬化表达谱数据结果 | 第64-71页 |
| ·讨论 | 第71-73页 |
| 第四章 Cytoscape构建肝硬化蛋白相互作用网络 | 第73-82页 |
| ·材料与方法 | 第73-75页 |
| ·实验材料 | 第73-74页 |
| ·实验方法 | 第74-75页 |
| ·实验结果 | 第75-79页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第75-79页 |
| ·讨论 | 第79-82页 |
| 结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-87页 |
| 附录 | 第87-89页 |
| 附录1 英文缩写词表 | 第87-89页 |
| 成果 | 第89-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
