| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-25页 |
| ·研究背景与意义 | 第11-16页 |
| ·研究背景 | 第11-15页 |
| ·研究意义 | 第15-16页 |
| ·研究现状与存在的问题 | 第16-21页 |
| ·生物序列比对算法研究现状 | 第16-20页 |
| ·普遍存在的问题 | 第20-21页 |
| ·主要研究内容与创新点 | 第21-23页 |
| ·课题来源与主要研究内容 | 第21-23页 |
| ·创新点 | 第23页 |
| ·论文章节结构 | 第23-25页 |
| 第二章 生物序列比对的过程与基本算法 | 第25-39页 |
| ·生物序列比对概述 | 第25-30页 |
| ·生物序列及比对的基本概念 | 第25-26页 |
| ·序列比对打分 | 第26-30页 |
| ·生物序列比对基本算法 | 第30-38页 |
| ·序列全局比对 | 第30-33页 |
| ·序列局部比对 | 第33-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第三章 基于LCNN和自适应的最优化生物序列比对方法 | 第39-52页 |
| ·引言 | 第39-40页 |
| ·生物序列转换为数字信号 | 第40-44页 |
| ·数学特性映射方法 | 第40-42页 |
| ·生物特性映射方法 | 第42-44页 |
| ·基于LCNN和自适应的最优化生物序列比对 | 第44-48页 |
| ·问题描述 | 第44-45页 |
| ·LCNN与自适应序列比对方法 | 第45-48页 |
| ·实验 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 空位种子及其最优发现方法 | 第52-81页 |
| ·引言 | 第52-53页 |
| ·空位种子的基本概念 | 第53-56页 |
| ·空位种子相关定义 | 第53-55页 |
| ·空位种子的问题 | 第55-56页 |
| ·种子灵敏度计算模型 | 第56-59页 |
| ·连续种子的灵敏度 | 第56-57页 |
| ·空位种子的灵敏度 | 第57-59页 |
| ·基于最优搜索的空位种子计算 | 第59-68页 |
| ·最优搜索简介 | 第59-60页 |
| ·候选种子初判法则 | 第60页 |
| ·基于最优搜索方法寻找最优空位种子 | 第60-63页 |
| ·实验 | 第63-68页 |
| ·基于重叠有向图的最优空位种子 | 第68-80页 |
| ·空位种子重叠有向图的基本结构 | 第69-73页 |
| ·基于重叠有向图的空位种子比较 | 第73-76页 |
| ·实验 | 第76-80页 |
| ·本章小结 | 第80-81页 |
| 第五章 插入-删除种子及其最优计算方法 | 第81-98页 |
| ·引言 | 第81-82页 |
| ·插入-删除种子模型 | 第82-87页 |
| ·插入-删除种子的定义 | 第82-84页 |
| ·插入-删除种子的灵敏度 | 第84-87页 |
| ·基于种子重叠的最优插入-删除种子计算模型 | 第87-92页 |
| ·重叠复杂度模型 | 第87-90页 |
| ·基于重叠复杂度的插入-删除种子设计 | 第90-92页 |
| ·实验 | 第92-97页 |
| ·本章小结 | 第97-98页 |
| 第六章 总结与展望 | 第98-100页 |
| ·总结 | 第98-99页 |
| ·展望 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-107页 |
| 攻博期间取得的研究成果 | 第107-108页 |