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大肠杆菌DNA错配修复机理研究

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
英文缩写表第10-11页
第一章 DNA错配修复机理研究进展第11-31页
   ·简介第11-12页
     ·DNA复制、基因突变和错配修复第11-12页
     ·错配修复的生物学意义第12页
   ·大肠杆菌中甲基化介导的错配修复系统第12-15页
     ·大肠杆菌错配修复系统的组成第12-13页
     ·大肠杆菌甲基化介导的错配修复第13-15页
   ·真核生物的错配修复第15-21页
     ·真核生物MutS和MutL的功能第16-17页
     ·真核生物中错配修复途径的其它成分第17-18页
     ·由纯化蛋白组建的真核生物中错配引起的切除系统第18-21页
   ·MutS蛋白和MutL蛋白的结构第21-23页
   ·错配修复过程中DNA上不同位置分子事件的偶联第23-26页
   ·错配修复的其它生物学功能第26-30页
     ·错配修复蛋白在DNA烷基化损伤中的作用第26-28页
     ·错配修复蛋白在抗体分化中的作用第28-30页
   ·本课题的研究意义和目的第30-31页
第二章 BIAcore技术及其在生命科学中的应用第31-37页
   ·BIAcore技术简介第31-32页
   ·蛋白质组学第32-33页
   ·信号转导第33-34页
   ·新药开发第34-36页
     ·前景展望第36-37页
第三章 大肠杆菌错配修复蛋白MutL和DNA聚合酶Ⅲ clamp loader的相互作用第37-62页
   ·前言第37-39页
   ·材料与方法第39-49页
     ·实验材料第39-42页
     ·实验方法第42-49页
   ·结果与分析第49-59页
     ·holA,holB,dnaX,mutlsbp等基因的克隆和蛋白的表达纯化第49-51页
     ·Clamp loader的组装第51页
     ·MutL系列缺失突变体的构建和纯化第51-52页
     ·MutL-SBP能够弥补mutl基因缺陷的大肠杆菌第52-53页
     ·Far western分析MutL和Clamp loader之间的相互作用第53-54页
     ·SPR确定和量化了新发现的蛋白质间的相互作用第54-56页
     ·MutL和δ,γ和clamp loader之间的相互作用受到ATP的调控第56-57页
     ·不同的MutL缺失突变体和聚合酶clamp loader亚基之间的相互作用第57-59页
   ·讨论第59-62页
第四章 大肠杆菌MutS,MutL蛋白和β clamp相互作用的分子机制和功能研究第62-93页
   ·前言第62-65页
   ·材料与方法第65-75页
     ·实验材料第65-68页
     ·实验方法第68-75页
   ·结果与分析第75-91页
     ·大肠杆菌MutS蛋白突变体的构建第75页
     ·从大肠杆菌基因组中扩增β clamp第75-76页
     ·β-clamp和β-clampSBP的表达纯化第76-77页
     ·MutS突变体蛋白的表达纯化第77页
     ·原子力显微镜观察β clamp第77-78页
     ·β clamp阻止MutS结合错配第78-80页
     ·β-clamp和MutS之间的相互作用受到ATP的调控第80-81页
     ·β-clamp不能结合MutS-DNA符合物第81-82页
     ·MutS和β-clamp相互作用的Motif和关键氨基酸第82-83页
     ·所有的MutS突变体都和野生型一样能和MutL相互作用第83页
     ·MutSC △812-815能够完全互补MutS缺陷的大肠杆菌,但是在2-AP的存在显示出了突变型特征第83-85页
     ·MutS~N△15-19不能恢复大肠杆菌mutS缺陷菌株的错配修复功能,表现为缺陷型第85-86页
     ·MutS~N △15-19的圆二色谱分析第86-87页
     ·MutS~N △15-19结合错配DNA能力和ATPase活性分析第87-89页
     ·MutL能够直接与β-clamp相互作用第89页
     ·β-clamp能够和MutL相互作用并且阻止MutL去结合ssDNA第89-91页
   ·讨论第91-93页
第五章 大肠杆菌错配修复蛋白MutL结合DNA以及不同DNA错配结合蛋白的初步研究第93-110页
   ·前言第93-95页
   ·材料与方法第95-103页
     ·实验材料第95-97页
     ·实验方法第97-103页
   ·结果与分析第103-109页
     ·菌体PCR扩增大肠杆菌mutM基因第103页
     ·人源p53基因的扩增第103-104页
     ·人源p53的表达和纯化第104页
     ·不同MutL突变体蛋白的纯化第104-105页
       ·p53与不同错配DNA的结合第105-106页
     ·MutM与不同错配DNA的结合第106-107页
     ·MutL与3'overhang DNA,5'overhang DNA以及ssDNA的结合第107-109页
   ·讨论第109-110页
参考文献第110-122页
致谢第122-123页
附录第123页

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