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应用ABEEM/MM模型和量子化学方法研究Mg2+/Ca2+与DNA碱基的相互作用

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
引言第9-10页
1 基本理论第10-22页
   ·经典的电负性标度第10-13页
     ·Pauling 电负性第10页
     ·Mulliken 电负性第10-11页
     ·Allred-Rochow 电负性第11-12页
     ·Gordy 电负性第12页
     ·Sanderson 电负性第12-13页
     ·小结第13页
   ·原子-键电负性均衡模型第13-20页
   ·原子-键电负性均衡融合进分子力学第20-22页
     ·分子力场作用项的一般形式第20页
     ·键长的伸缩振动第20页
     ·键角的弯曲振动第20-21页
     ·二面角扭曲相互作用能第21页
     ·Van der Waals 相互作用第21页
     ·静电相互作用第21-22页
2 应用原子—键电负性均衡方法和从头计算方法研究镁、钙离子与 DNA 碱基单体的相互作用第22-39页
   ·前言第22-23页
   ·从头计算方法第23-25页
     ·位点的选取第23-24页
     ·基组和方法的选择第24-25页
   ·原子-键电负性均衡模型(ABEEM)第25-30页
     ·ABEEM/MM 方法的表达式第25-29页
     ·模型电荷的精度第29-30页
   ·结果与讨论第30-38页
     ·几何构型第30-33页
     ·结合能第33-36页
     ·电荷分布第36-38页
   ·结论第38-39页
3 应用从头计算方法计算镁、钙离子与DNA 碱基对的相互作用第39-48页
   ·前言第39-40页
   ·从头算方法第40-41页
     ·位点的选取第40-41页
     ·方法和基组的选取第41页
   ·结果与讨论第41-47页
     ·镁、钙离子与碱基对的距离第41-44页
     ·镁、钙离子对碱基对氢键键长的影响第44-46页
     ·结合能第46-47页
   ·结论第47-48页
4 碱金属离子在汞金属界面吸附作用的量子化学研究第48-52页
   ·前言第48页
   ·计算方法第48页
   ·模型的构建第48-49页
   ·结果与讨论第49-51页
   ·结论第51-52页
5 结论与展望第52-53页
参考文献第53-58页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第58-59页
致谢第59页

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