| 摘要 | 第1-17页 |
| ABSTRACT | 第17-22页 |
| 缩略词表 | 第22-23页 |
| 第一章 绪论 | 第23-47页 |
| ·细菌耐药性机制 | 第24-26页 |
| ·整合子 | 第26-31页 |
| ·具有ISCR1元件的复杂1型整合子的结构 | 第31-37页 |
| ·细菌喹诺酮耐药性的机理及其传播机制 | 第37-45页 |
| ·立题依据及意义 | 第45-47页 |
| 第二章 废水中耐药性细菌的筛选及1、2、3型整合子检测 | 第47-64页 |
| 引言 | 第47页 |
| ·材料与方法 | 第47-55页 |
| ·材料 | 第47-50页 |
| ·方法 | 第50-55页 |
| ·细菌总DNA提取方法 | 第50-51页 |
| ·耐药性细菌筛选 | 第51-52页 |
| ·1型、2型和3型整合酶引物及PCR反应条件 | 第52页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳及DNA片段的回收、纯化 | 第52-53页 |
| ·琼脂纸片扩散法(K-B法)药物敏感试验 | 第53-55页 |
| ·结果与讨论 | 第55-62页 |
| ·1型、2型、3型整合酶保守区PCR及序列分析 | 第55-57页 |
| ·各水样耐药性细菌的筛选、耐药率水平分析 | 第57-61页 |
| ·整合子1型、2型及3型整合子的分布情况 | 第61-62页 |
| ·小结 | 第62-64页 |
| 第三章 1型整合子细菌基因盒多样性的检测及分析 | 第64-78页 |
| 引言 | 第64页 |
| ·材料与方法 | 第64-71页 |
| ·菌株与质粒 | 第64页 |
| ·试剂和培养基 | 第64-65页 |
| ·PCR及RFLP方法分析1型整合子可变区基因盒阵列 | 第65-66页 |
| ·整合子可变区基因盒阵列外的其他耐药基因的检测 | 第66页 |
| ·连接反应 | 第66-67页 |
| ·质粒提取 | 第67页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化反应 | 第67-70页 |
| ·重组质粒的筛选,鉴定及测序 | 第70页 |
| ·引物设计及序列分析 | 第70-71页 |
| ·结果与讨论 | 第71-77页 |
| ·1型整合子基因盒阵列排列方式检测 | 第71-74页 |
| ·具有新型1型整合子基因盒阵列菌株耐药性分析及非整合子耐药基因检测 | 第74-77页 |
| ·小结 | 第77-78页 |
| 第四章 2型整合子细菌基因盒多样性的检测及分析 | 第78-98页 |
| 引言 | 第78页 |
| ·材料与方法 | 第78-85页 |
| ·菌株与质粒 | 第78页 |
| ·试剂和仪器 | 第78-79页 |
| ·2型整合子可变区基因盒的检测 | 第79-80页 |
| ·2型整合子可变区基因盒分析及其他非整合子耐药基因的检测 | 第80页 |
| ·2型耐药性菌株Rep-PCR分型和菌株鉴定 | 第80-81页 |
| ·2型整合子基因盒阵列定位分析 | 第81-85页 |
| ·结果与讨论 | 第85-96页 |
| ·2型整合子菌株分类及药物敏感性实验分析 | 第85-86页 |
| ·3种新型2型整合子基因盒阵列分析 | 第86-87页 |
| ·新型杂合型2型整合子基因盒阵列分析 | 第87-94页 |
| ·2型整合子中1型整合子排列方式、Tn7家族及其非整合子耐药基因鉴定 | 第94-95页 |
| ·2型整合子定位分析 | 第95-96页 |
| ·小结 | 第96-98页 |
| 第五章 Aeromonas puctata中新型喹诺酮耐药性基因qnrVC4的克隆、表达及喹诺酮耐药性分析 | 第98-115页 |
| 引言 | 第98页 |
| ·材料与方法 | 第98-100页 |
| ·菌株与质粒 | 第98-99页 |
| ·试剂和培养基 | 第99页 |
| ·qnrVC4基因的克隆 | 第99页 |
| ·qnrVC4基因的表达及MIC测定 | 第99-100页 |
| ·原始菌株Aeromonas punctata 159促旋酶gyrA,gyrB及拓扑异构酶parC克隆及分析 | 第100页 |
| ·引物设计及序列分析 | 第100页 |
| ·qnrVC4基因定位分析 | 第100页 |
| ·结果与讨论 | 第100-112页 |
| ·aacA4—orfun—aacA4—catB3中qnrVC4命名 | 第100-103页 |
| ·qnrVC4基因的克隆 | 第103-104页 |
| ·pBCKS-qnrVC4、pBCKS-Pt-qnrVC4重组子的构建 | 第104-107页 |
| ·pBCKS-qnrVC4、pBCKS-Pt-qnrVC4重组子活性分析(MICs测定) | 第107-109页 |
| ·qnrVC4基因转移性分析及qnrVC4定位 | 第109页 |
| ·Aeromonas punctata 159菌株喹诺酮耐药性机制分析 | 第109-112页 |
| ·小结 | 第112-115页 |
| 第六章 水环境中耐药性细菌质粒介导的喹诺酮耐药基因调查分析 | 第115-132页 |
| 引言 | 第115页 |
| ·材料 | 第115-116页 |
| ·方法 | 第116-118页 |
| ·细菌总DNA提取、质粒提取 | 第116页 |
| ·qnrA,qnrB,qnrS,aac(6')-Ib-cr,qepA基因和ESBL、AmpC类β内酰胺酶基因的PCR反应检测 | 第116页 |
| ·qnrA,qnrB,qnrS系列变体分析 | 第116-117页 |
| ·耐药性菌株中qnrA,qnrB,qnrS基因的接合转移性分析及接合转移子验证 | 第117-118页 |
| ·接合转移子及转化子抗菌药物敏感性实验测定 | 第118页 |
| ·结果与讨论 | 第118-130页 |
| ·qnrA,qnrB,qnrS基因PCR检测 | 第118-120页 |
| ·qnrA,qnrB,qnrS基因系列变体分析 | 第120-130页 |
| ·aac(6')-Ib-cr基因,qepA基因,ESBL和AmpC类β内酰胺酶耐药基因检测及qnrA,qnrB和qnrS转移性分析 | 第130页 |
| ·小结 | 第130-132页 |
| 第七章 具有复杂结构的1型整合子及其结构分析 | 第132-145页 |
| 引言 | 第132页 |
| ·材料 | 第132页 |
| ·方法 | 第132-135页 |
| ·ISCR1元件的PCR反应检测 | 第132-133页 |
| ·ISCR1元件的下游序列扩增 | 第133-135页 |
| ·结果与讨论 | 第135-140页 |
| ·ISCR1元件的PCR反应检测结果 | 第135页 |
| ·ISCR1元件介导的耐药性基因及转移性分析 | 第135-140页 |
| ·小结 | 第140-145页 |
| 全文总结 | 第145-147页 |
| 论文的创新点和科学意义 | 第147-148页 |
| 今后的工作展望 | 第148-149页 |
| 参考文献 | 第149-161页 |
| 致谢 | 第161-162页 |
| 在读期间发表和准备发表的论文 | 第162-163页 |
| 外文写作 | 第163-201页 |
