中文摘要 | 第1-11页 |
ABSTRACT | 第11-13页 |
缩略词表(ABBREVIATIONS) | 第13-14页 |
1 前言 | 第14-33页 |
·研究问题的由来 | 第14页 |
·文献综述 | 第14-32页 |
·骨骼肌生长发育过程及其分子调控机理研究现状 | 第14-16页 |
·猪骨骼肌组织中差异表达EST及基因的鉴定现状 | 第16-20页 |
·本论文研究的几个猪新基因的研究进展 | 第20-24页 |
·PP2A全酶及PPP2R5A基因的研究进展 | 第20-22页 |
·CSRP家族三个基因的研究进展 | 第22-23页 |
·LDB1基因的研究进展 | 第23-24页 |
·基于EST的新基因克隆策略 | 第24-26页 |
·基因转录调控的研究方法 | 第26-29页 |
·顺式作用元件的研究方法 | 第26-27页 |
·反式作用因子的研究方法 | 第27-29页 |
·基因的选择性剪接机制研究 | 第29-32页 |
·选择性剪接的概述 | 第29-30页 |
·顺式作用元件对选择性剪接的调节 | 第30-31页 |
·反式作用因子对选择性剪接的调节 | 第31-32页 |
·本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
2 材料与方法 | 第33-55页 |
·材料 | 第33-39页 |
·样品 | 第33-34页 |
·猪基因组DNA样品 | 第33页 |
·用于基因染色体定位的DNA样品 | 第33页 |
·基因表达分析的组织样品 | 第33-34页 |
·菌株、细胞系及质粒 | 第34-36页 |
·主要试剂与耗材 | 第36-38页 |
·主要试剂及耗材来源 | 第36页 |
·试剂及缓冲液配制 | 第36-38页 |
·主要仪器设备 | 第38页 |
·主要分子生物学网站及所用软件 | 第38-39页 |
·方法 | 第39-55页 |
·候选基因的cDNA克隆 | 第39-44页 |
·目标基因的生物信息学分析 | 第39页 |
·引物设计 | 第39页 |
·总RNA的提取、质量检测与纯化 | 第39-41页 |
·cDNA样品的准备 | 第41-42页 |
·RT-PCR和RACE扩增 | 第42-44页 |
·产物的纯化、克隆与测序 | 第44页 |
·cDNA序列分析 | 第44页 |
·候选基因基因组序列的克隆与分析 | 第44-46页 |
·基因染色体定位的SCHP和RH方法 | 第46-47页 |
·基因定位的引物设计 | 第46-47页 |
·PCR分型方法 | 第47页 |
·数据分析方法 | 第47页 |
·基因的表达谱研究 | 第47-49页 |
·半定量RT-PCR(Semi-quantitative PCR) | 第47页 |
·实时定量PCR技术(Real-time quantitative PCR) | 第47-49页 |
·候选基因启动子的克隆与转录活性分析 | 第49-52页 |
·候选基因启动子克隆与分析 | 第49页 |
·转录因子结合位点预测 | 第49页 |
·猪LDB1基因启动子荧光素酶报告基因载体的构建 | 第49-51页 |
·细胞培养和转染 | 第51-52页 |
·目标基因启动子转录活性分析 | 第52页 |
·LDB1基因的亚细胞定位 | 第52-53页 |
·引物设计与载体构建 | 第52-53页 |
·细胞培养与转染 | 第53页 |
·转染后的细胞染色和融合蛋白的观察 | 第53页 |
·基因的SNP扫描及其多态性检测 | 第53-55页 |
·目标基因SNPs扫描方法 | 第53-54页 |
·利用PCR-RFLP方法检测CSRP3基因的多态性 | 第54-55页 |
3 结果 | 第55-85页 |
·总RNA的甲醛凝胶检测结果 | 第55页 |
·猪PP2A相关基因的克隆、定位与表达分析 | 第55-62页 |
·猪PPP2R5A基因的cDNA克隆及序列分析 | 第55-57页 |
·猪PPP2R5A基因的表达分析 | 第57-58页 |
·猪PPP2R5A基因的染色体定位 | 第58-60页 |
·猪PPP2R5B和PPP2R5D基因的表达谱分析 | 第60-61页 |
·猪PP2A其它相关基因的染色体定位结果 | 第61-62页 |
·猪CSRP家族基因的克隆、定位与表达分析 | 第62-72页 |
·猪CSRP家族基因的克隆与序列分析 | 第62-65页 |
·猪CSRP3基因的克隆及序列分析 | 第62-64页 |
·猪CSRP1和CSRP2基因的cDNA克隆 | 第64-65页 |
·猪CSRP家族基因编码蛋白的多序列比对及系统发生树分析 | 第65-66页 |
·猪CSRP家族基因的表达模式分析 | 第66-68页 |
·猪CSRP家族基因mRNA的组织分布 | 第66-67页 |
·猪CSRP3基因在肌肉组织中的时空表达模式分析 | 第67-68页 |
·猪CSRP家族基因的染色体定位 | 第68页 |
·猪CSRP3基因的启动子克隆与转录因子结合位点预测 | 第68-69页 |
·猪CSRP3基因的SNP扫描及其分析 | 第69-72页 |
·猪LDB1基因的克隆及其功能的初步研究 | 第72-85页 |
·猪LDB1基因的cDNA克隆与序列分析 | 第72-76页 |
·猪LDB1基因的DNA克隆、基因组结构分析及染色体定位 | 第76-79页 |
·LDB1基因CDS区选择性剪接体的进一步验证 | 第79-80页 |
·猪LDB1基因两种选择性剪接体的亚细胞定位研究 | 第80-81页 |
·猪LDB1基因的启动子克隆与活性分析 | 第81-85页 |
·荧光素酶pGL3报告基因载体的构建 | 第81-82页 |
·启动子活性检测与分析 | 第82-83页 |
·转录因子结合位点预测结果 | 第83-85页 |
4 讨论 | 第85-95页 |
·关于实验方法的讨论 | 第85-88页 |
·关于基于EST的新基因cDNA克隆 | 第85-86页 |
·关于基因mRNA表达分析的方法 | 第86-87页 |
·关于表达载体的构建 | 第87-88页 |
·关于研究结果的讨论 | 第88-95页 |
·关于猪PPP2R5A基因 | 第88-89页 |
·关于猪CSRP家族的基因 | 第89-91页 |
·CSRP家族三个基因的进化关系分析 | 第89-90页 |
·CSRP3基因的结构与功能初步分析 | 第90-91页 |
·关于猪LDB1基因的结构与功能分析 | 第91-94页 |
·关于猪LDB1基因的结构 | 第91页 |
·关于猪LDB1基因CDS区的选择性剪接及其亚细胞定位 | 第91-92页 |
·关于猪LDB1基因的转录调控 | 第92-94页 |
·关于重复序列与基因的选择性剪接 | 第94-95页 |
5 小结 | 第95-97页 |
·主要研究结果 | 第95-96页 |
·本研究的特色与创新点 | 第96页 |
·本研究的不足和值得进一步研究的问题 | 第96-97页 |
参考文献 | 第97-109页 |
已发表(投稿)文章 | 第109-110页 |
致谢 | 第110页 |