| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| Chapter 1 Introduction | 第10-25页 |
| ·Overview of acid mine drainage | 第10-14页 |
| ·Dissolution of sulfide minerals and microbial effects | 第10-11页 |
| ·Factors impacts AMD generation | 第11-12页 |
| ·The damage and treatment of the acid mine drainage | 第12-14页 |
| ·Microbial diversity in acid mine drainage in acid mine drainage | 第14-19页 |
| ·Bacteria | 第15-18页 |
| ·Archaea | 第18页 |
| ·Eucarya | 第18-19页 |
| ·Molecular-based techniques to study microbial diversity | 第19-22页 |
| ·The significance and contents of our research | 第22-25页 |
| ·The significance of our research | 第22-23页 |
| ·Choosing genes | 第23-24页 |
| ·Contents of our research | 第24-25页 |
| Chapter 2 Materials and methods | 第25-31页 |
| ·Study site, sample collection and physicochemical analyses | 第25页 |
| ·DNA extraction and purification | 第25-26页 |
| ·Gene amplification and cloning | 第26-27页 |
| ·Primers | 第26页 |
| ·PCR mixtures | 第26-27页 |
| ·Thermocycler programs | 第27页 |
| ·Cloning | 第27-28页 |
| ·Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA)/ Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) | 第28页 |
| ·Sequencing and phylogenetic analysis | 第28页 |
| ·Statistical analysis | 第28-29页 |
| ·Experiment condition of succession | 第29-31页 |
| Chapter 3 Microbial diversity and community structure defined by 16S rRNA in acid mine drainage from Dabaoshan Mine | 第31-51页 |
| ·Biogeochemical properties of stations | 第31-32页 |
| ·ARDRA analysis of bacterial 16S rRNA clone libraries | 第32-34页 |
| ·Bacterial phylogenetic analysis | 第34-40页 |
| ·Acidobacteria | 第39页 |
| ·Actinobacteria | 第39页 |
| ·Leptospirillum | 第39页 |
| ·Alphaproteobacteria | 第39-40页 |
| ·Gammaproteobacteria | 第40页 |
| ·Structure of bacterial communities | 第40-41页 |
| ·ARDRA analysis of archaeal 16S rRNA clone libraries | 第41-42页 |
| ·Archaeal phylogenetic analysis and community structure | 第42-44页 |
| ·Nucleotide sequence accession numbers | 第44页 |
| ·Statistical analysis | 第44-46页 |
| ·Discussion | 第46-51页 |
| ·Bacteria | 第46-49页 |
| ·Archaea | 第49-51页 |
| Chapter 4 Bacterial diversity and community structure defined by gyrB gene in acid mine drainage from Dabaoshan Mine | 第51-60页 |
| ·RFLP analysis of bacterial gyrB clone libraries | 第51-53页 |
| ·Bacterial phylogenetic analysis | 第53-55页 |
| ·Structure of bacterial communities | 第55-56页 |
| ·Nucleotide sequence accession numbers | 第56页 |
| ·Statistical analysis | 第56-57页 |
| ·Discussion | 第57-60页 |
| Chapter 5 Succession of bacterial communities under the selective stress of ferrous iron | 第60-68页 |
| ·ARDRA analysis of 16S rRNA clone libraries | 第60-62页 |
| ·Phylogenetic analysis | 第62-64页 |
| ·Shift of community structures | 第64-66页 |
| ·Discussion | 第66-68页 |
| Chapter 6 Conclusions | 第68-69页 |
| Reference | 第69-78页 |
| Acknowledgements | 第78-79页 |
| Main achievements | 第79页 |
