| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 绪论 | 第14-25页 |
| 第一节 选题背景与意义 | 第14-16页 |
| 一、选题背景与研究目的 | 第14-16页 |
| 二、研究意义 | 第16页 |
| 第二节 国内外研究进展 | 第16-22页 |
| 一、蓝藻病毒psbA基因多样性 | 第16-18页 |
| 二、蓝藻病毒DNA pol基因多样性 | 第18-19页 |
| 三、蓝藻病毒phoH基因多样性 | 第19-20页 |
| 四、病毒宏基因组学 | 第20-22页 |
| 第三节 研究内容、技术路线和创新点 | 第22-25页 |
| 一、研究内容 | 第22-23页 |
| 二、技术路线 | 第23-24页 |
| 三、论文创新点 | 第24-25页 |
| 第二章 东北稻田水体蓝藻病毒psbA基因多样性研究 | 第25-39页 |
| 第一节 材料与方法 | 第26-29页 |
| 一、样品的采集与处理 | 第26-27页 |
| 二、病毒DNA的提取 | 第27页 |
| 三、psbA基因的PCR扩增与胶回收 | 第27-28页 |
| 四、psbA基因的克隆与测序 | 第28-29页 |
| 五、psbA基因系统发育分析 | 第29页 |
| 第二节 结果与分析 | 第29-36页 |
| 一、病毒DNA的提取 | 第29-30页 |
| 二、psbA基因的PCR扩增与阳性克隆检测 | 第30-32页 |
| 三、psbA基因的同源序列分析 | 第32-33页 |
| 四、psbA基因的系统发育分析 | 第33-36页 |
| 第三节 讨论 | 第36-38页 |
| 一、蓝藻病毒psbA基因与寄主psbA基因分析 | 第36-37页 |
| 二、不同环境蓝藻病毒psbA基因多样性 | 第37-38页 |
| 第四节 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 东北稻田水体蓝藻病毒DNA pol基因多样性研究 | 第39-59页 |
| 第一节 材料与方法 | 第40-43页 |
| 一、样品的采集与处理 | 第40-41页 |
| 二、病毒DNA的提取 | 第41页 |
| 三、DNA pol基因的PCR扩增与胶回收 | 第41-42页 |
| 四、DNA pol基因的克隆与测序 | 第42页 |
| 五、DNA pol基因的系统发育分析 | 第42页 |
| 六、DNA pol基因克隆文库分析 | 第42-43页 |
| 七、非度量多维尺度（NMDS）分析 | 第43页 |
| 第二节 结果与分析 | 第43-54页 |
| 一、DNA pol基因的PCR扩增与阳性克隆检测 | 第43-45页 |
| 二、DNA pol基因的同源序列分析 | 第45-47页 |
| 三、稻田DNA pol基因的系统发育分析 | 第47页 |
| 四、蓝藻病毒DNA pol基因与非蓝藻病毒DNA pol基因分析 | 第47-50页 |
| 五、稻田蓝藻病毒DNA pol基因克隆文库分析 | 第50页 |
| 六、稻田蓝藻病毒DNA pol基因的空间分布 | 第50-53页 |
| 七、不同环境蓝藻病毒DNA pol基因集群的比较 | 第53-54页 |
| 第三节 讨论 | 第54-57页 |
| 一、简并引物CP-DNAP-349F/CP-DNAP-533Ra/b | 第54-55页 |
| 二、稻田蓝藻病毒DNA pol基因的空间分布 | 第55-56页 |
| 三、不同环境蓝藻病毒DNA pol基因多样性 | 第56-57页 |
| 第四节 小结 | 第57-59页 |
| 第四章 东北稻田水体蓝藻病毒phoH基因多样性研究 | 第59-74页 |
| 第一节 材料与方法 | 第59-61页 |
| 一、样品的采集与处理 | 第59-60页 |
| 二、病毒DNA的提取 | 第60页 |
| 三、phoH基因的PCR扩增与胶回收 | 第60页 |
| 四、phoH基因的克隆与测序 | 第60-61页 |
| 五、蓝藻病毒phoH基因的系统发育分析 | 第61页 |
| 六、非度量多维尺度（NMDS）分析 | 第61页 |
| 第二节 结果与分析 | 第61-70页 |
| 一、phoH基因的PCR扩增与阳性克隆检测 | 第61-62页 |
| 二、phoH基因的同源序列分析 | 第62-63页 |
| 三、phoH基因的系统发育分析 | 第63-67页 |
| 四、稻田细菌病毒/蓝藻病毒phoH基因的空间分布 | 第67页 |
| 五、不同环境细菌病毒/蓝藻病毒phoH基因集群的比较 | 第67-70页 |
| 第三节 讨论 | 第70-73页 |
| 一、稻田细菌病毒/蓝藻病毒phoH基因的PCR扩增 | 第70页 |
| 二、蓝藻病毒phoH基因与异养细菌病毒phoH基因分析 | 第70-72页 |
| 三、不同环境细菌病毒/蓝藻病毒phoH基因多样性 | 第72-73页 |
| 第四节 小结 | 第73-74页 |
| 第五章 东北稻田水体病毒宏基因组学研究 | 第74-90页 |
| 第一节 材料与方法 | 第74-77页 |
| 一、样品的采集与处理 | 第74-75页 |
| 二、病毒颗粒的超离富集 | 第75页 |
| 三、病毒颗粒的纯化 | 第75-76页 |
| 四、病毒宏基因组的提取、扩增与测序 | 第76页 |
| 五、病毒宏基因组测序数据的分析 | 第76-77页 |
| 第二节 结果与分析 | 第77-87页 |
| 一、病毒颗粒的纯化检测与荧光显微镜观察 | 第77-79页 |
| 二、病毒宏基因组DNA质量检测 | 第79-80页 |
| 三、病毒宏基因组测序数据统计 | 第80-82页 |
| 四、病毒宏基因组物种组成与相对丰度 | 第82-85页 |
| 五、病毒宏基因组功能基因分类与相对丰度 | 第85-87页 |
| 第三节 讨论 | 第87-89页 |
| 一、环境病毒宏基因组DNA的提取 | 第87-88页 |
| 二、东北稻田水体病毒物种组成多样性与相对丰度 | 第88-89页 |
| 第四节 小结 | 第89-90页 |
| 第六章 结论与展望 | 第90-92页 |
| 一、研究结论 | 第90-91页 |
| 二、本研究的不足之处 | 第91页 |
| 三、研究展望 | 第91-92页 |
| 附表 | 第92-111页 |
| 试剂与培养基配方 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-123页 |
| 发表文章情况 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
