基于细胞核核糖体DNA内转录间隔区(ITS序列)探讨广义平藓科的系统发育关系
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
略语表 | 第7-9页 |
1 前言 | 第9-28页 |
·苔藓植物分子系统学研究进展 | 第10-20页 |
·同工酶电泳技术 | 第10-11页 |
·随机扩增多态性(RAPD) | 第11-13页 |
·限制性片段长度多态性(RFLP) | 第13-14页 |
·DNA序列测定法 | 第14-18页 |
·苔藓分子系统学基因片段选择策略 | 第18-19页 |
·细胞器在系统发育中的复杂表型 | 第19-20页 |
·平藓科科内及属间的分类简史 | 第20-23页 |
·经典苔藓植物的分类简介 | 第20-21页 |
·广义平藓科分类地位 | 第21-22页 |
·平藓科内属界限的争议 | 第22-23页 |
·ITS序列在植物分子系统学的应用 | 第23-25页 |
·系统发育数据分析方法 | 第25-28页 |
·序列比对 | 第25页 |
·建立取代模型 | 第25-26页 |
·系统树构建方法 | 第26-27页 |
·系统树的检验与评估 | 第27-28页 |
2. 材料与方法 | 第28-33页 |
·实验材料 | 第28-29页 |
·标本材料 | 第28页 |
·酶和试剂 | 第28-29页 |
·实验方法 | 第29-33页 |
·总DNA提取 | 第29-30页 |
·ITS序列扩增引物 | 第30-31页 |
·PCR扩增 | 第31页 |
·PCR产物纯化与测序 | 第31-32页 |
·数据处理与分析 | 第32-33页 |
3. 结果与分析 | 第33-47页 |
·DNA提取和纯化 | 第33-35页 |
·DNA提取 | 第33页 |
·DNA纯化 | 第33页 |
·PCR反应 | 第33-35页 |
·ITS长度变异 | 第35页 |
·G + C含量变异 | 第35页 |
·同源性比较分析 | 第35-36页 |
·PAUP4.0bta(PPC)构建系统树 | 第36-47页 |
·外类群的选择 | 第36页 |
·最大简约(MP)系统树 | 第36页 |
·邻接法(NJ)构建系统树 | 第36页 |
·系统分析结果 | 第36-47页 |
4. 讨论 | 第47-52页 |
·年代久远的标本材料DNA提取条件优化 | 第47页 |
·ITS在苔藓植物系统学的研究价值 | 第47-48页 |
·不同系统树构建方法对结果的影响 | 第48页 |
·平藓科及其相关科属系统发育的探讨 | 第48-52页 |
·平藓科的系统位置 | 第48-51页 |
·平藓科与相近科间的关系 | 第51-52页 |
5. 结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-60页 |
致谢 | 第60-61页 |
附录1 ITS1序列比对 | 第61-64页 |
附录2 ITS2序列比对 | 第64-67页 |
附录3 ITS3序列比对 | 第67-82页 |
附录4 HKY85距离矩阵 | 第82-84页 |
附录5 测序报告 | 第84-109页 |