| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第15-17页 |
| 第一篇 文献综述 | 第17-57页 |
| 第一章 植物遗传图谱构建研究 | 第17-36页 |
| 1、植物遗传图谱 | 第18-28页 |
| ·遗传作图的理论基础 | 第18页 |
| ·图谱构建 | 第18-28页 |
| ·作图群体的建立 | 第18-21页 |
| ·遗传作图中的分子标记 | 第21-27页 |
| ·遗传连锁群的构建 | 第27-28页 |
| 2、比较基因组作图研究 | 第28-30页 |
| 3、棉花的遗传图谱构建及发展研究 | 第30-36页 |
| ·棉花的经典遗传图谱 | 第30页 |
| ·棉花的分子遗传图谱 | 第30-36页 |
| 第二章 荧光原位杂交技术及其在植物基因组研究中的应用 | 第36-57页 |
| 1、原位杂交技术的发展 | 第36-37页 |
| 2、荧光原位杂交技术 | 第37-46页 |
| ·探针的制备 | 第37-40页 |
| ·探针类型 | 第38-39页 |
| ·探针的标记 | 第39-40页 |
| ·靶染色体制备 | 第40-44页 |
| ·有丝分裂相 | 第40-43页 |
| ·减数分裂相 | 第43-44页 |
| ·染色体原位杂交基本程序 | 第44-45页 |
| ·荧光显微镜检测 | 第45-46页 |
| 3、基于FISH的衍生技术简介 | 第46-47页 |
| 4、荧光原位杂交技术在植物基因组研究中的应用 | 第47-50页 |
| ·异源染色质的鉴定 | 第47-48页 |
| ·染色体物理图谱的构建 | 第48-49页 |
| ·染色体RNA和基因组进化的研究 | 第49-50页 |
| 5、BAC-FISH在植物基因组研究中的应用 | 第50-57页 |
| ·BAC-FISH技术简介 | 第50-52页 |
| ·BAC-FISH在植物及棉花基因组研究中的应用 | 第52-55页 |
| ·染色体识别及核型分析 | 第52-53页 |
| ·基因的物理定位 | 第53-54页 |
| ·BAC-FISH在图谱构建及比较作图中的应用 | 第54-55页 |
| ·BAC-FISH在棉花中的应用及现状 | 第55-57页 |
| 第二篇 试验研究 | 第57-137页 |
| 第三章 异源四倍体栽培棉分子连锁图谱的构建及比较作图分析 | 第57-88页 |
| 1、材料与方法 | 第59-62页 |
| ·研究材料 | 第59-60页 |
| ·群体构建 | 第60页 |
| ·DH群体的构建 | 第60页 |
| ·回交群体构建 | 第60页 |
| ·分子标记多态性位点的确定及分子标记连锁群的构建 | 第60-62页 |
| ·棉花基因组DNA的分离纯化及微卫星的PCR扩增与PAGE/银染分析 | 第60页 |
| ·分子标记多态性位点的确定 | 第60-62页 |
| ·分子标记连锁群的构建及染色体定位 | 第62页 |
| 2、结果与分析 | 第62-80页 |
| ·作图群体的构建 | 第62-63页 |
| ·分子标记位点的分析及连锁群的构建 | 第63-79页 |
| ·标记位点的分析 | 第63-64页 |
| ·连锁群的构建及染色体定位 | 第64-79页 |
| ·利用重复SSR标记位点研究四倍体棉不同染色体亚组间的同源关系 | 第79-80页 |
| ·两图谱标记共线性分析 | 第80页 |
| 3、讨论 | 第80-87页 |
| ·DH作图群体的构建 | 第80-82页 |
| ·微卫星标记在棉花遗传图谱构建中的分布及应用 | 第82-84页 |
| ·比较遗传作图分析及应用 | 第84-86页 |
| ·不同群体对遗传图谱构建的影响 | 第84页 |
| ·不同图谱偏分离标记的比较分析 | 第84-85页 |
| ·两图谱标记共线性分析 | 第85-86页 |
| ·分子连锁图谱在棉花遗传改良中的意义 | 第86-87页 |
| 4、总结与展望 | 第87-88页 |
| 第四章 棉花细菌人工染色体原位杂交(BAC-FISH)技术体系的建立 | 第88-99页 |
| 1、材料和方法 | 第89-91页 |
| ·材料 | 第89页 |
| ·BAC文库 | 第89页 |
| ·方法 | 第89-91页 |
| ·高通量的BAC-DNA提取方法 | 第89-90页 |
| ·SSR标记PCR法筛选文库 | 第90页 |
| ·原位杂交程序 | 第90-91页 |
| 2、结果与讨论 | 第91-99页 |
| ·细菌在96孔板中培养条件的优化 | 第91-92页 |
| ·BAC-DNA的提取 | 第92-93页 |
| ·PCR法筛选文库 | 第93-95页 |
| ·原位杂交 | 第95-96页 |
| ·染色体制片 | 第95页 |
| ·制片变性 | 第95页 |
| ·洗脱及信号分析 | 第95-96页 |
| ·BAC克隆探针的筛选 | 第96-99页 |
| 第五章 利用BAC-FISH进行连锁群与染色体的完全对应 | 第99-113页 |
| 1、材料和方法 | 第100-102页 |
| ·SSR标记的选择及连锁群特异BAC克隆的鉴定 | 第100页 |
| ·易位杂合体材料的构建及染色体制片 | 第100-101页 |
| ·荧光原位杂交 | 第101页 |
| ·连锁群的BAC-FISH定位 | 第101-102页 |
| 2、结果与分析 | 第102-110页 |
| ·SSR标记的选择及连锁群特异克隆的确定 | 第102页 |
| ·连锁群的BAC-FISH染色体定位 | 第102-109页 |
| ·染色体3和6的BAC-FISH验证 | 第102-104页 |
| ·LGA01是染色体13的连锁群 | 第104页 |
| ·LGA02是染色体8的连锁群 | 第104页 |
| ·LGA03是染色体11的连锁群 | 第104-105页 |
| ·LGD02是染色体21的连锁群 | 第105页 |
| ·LGD03是染色体24的连锁群 | 第105页 |
| ·LGD08是染色体19的连锁群 | 第105-109页 |
| ·杂交位点的亚染色体定位 | 第109-110页 |
| 3、讨论 | 第110-113页 |
| 第六章 四倍体棉花一套完整染色体特异BAC克隆的开发及应用 | 第113-126页 |
| 1、材料与方法 | 第114-116页 |
| ·材料 | 第114页 |
| ·SSR标记的确定及文库筛选 | 第114-115页 |
| ·染色体的命名 | 第115页 |
| ·染色体制备及荧光原位杂交 | 第115-116页 |
| ·杂交液的配置 | 第115页 |
| ·杂交及信号检测 | 第115页 |
| ·重复荧光原位杂交 | 第115-116页 |
| 2、结果与分析 | 第116-124页 |
| ·一套完整棉花染色体特异SSR标记及克隆的鉴定 | 第116-117页 |
| ·物理图谱与遗传图谱的比较作图分析 | 第117-122页 |
| ·染色体特异BAC克隆在物理定位中的应用 | 第122-124页 |
| 3、讨论 | 第124-126页 |
| ·四倍体棉花一套完整的染色体特异BAC克隆的开发及其应用 | 第124页 |
| ·遗传图谱与物理图谱的比较分析 | 第124-126页 |
| 第七章 棉花部分同源转化群大片段DNA共线性差异的发现及鉴定 | 第126-137页 |
| 1、材料与方法 | 第127-128页 |
| ·BAC克隆 | 第127页 |
| ·荧光原位杂交 | 第127页 |
| ·BAC末端测序、标记开发及定位 | 第127-128页 |
| 2、结果与分析 | 第128-132页 |
| ·部分同源BAC克隆的发现与分析 | 第128-130页 |
| ·部分同源染色体上含有大片段同源DNA的BAC克隆的发现与分析 | 第130-132页 |
| 3、讨论 | 第132-137页 |
| ·部分同源BAC克隆的分析 | 第132-135页 |
| ·部分同源染色体大片段同源BAC的分析 | 第135-137页 |
| 全文总结 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-156页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第156-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
