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三种石首鱼紧密连锁的α-和β-珠蛋白基因的克隆及其顺式调控元件的分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
第一部分 文献综述第13-44页
 第一章 人类血红蛋白的结构和功能简介第14-20页
  1 正常人类血红蛋白的种类第14页
  2 人类血红蛋白的分子结构第14-17页
   ·珠蛋白链的一级结构第14-15页
   ·珠蛋白链的空间结构第15-16页
   ·珠蛋白链与血红素的结合第16-17页
   ·血红蛋白的四级结构第17页
  3 影响血红蛋白功能的效应物第17-20页
   ·质子第18页
   ·氨甲酰基加合体第18-19页
   ·二磷酸甘油酸第19-20页
 第二章 人类珠蛋白基因结构及其表达调控第20-29页
  1 珠蛋白基因簇的结构特点第20-21页
  2 珠蛋白基因簇的基因表达调控第21-29页
   ·基因座控制区第22-23页
   ·顺式作用元件第23-26页
   ·转录调控因子第26-27页
   ·珠蛋白基因表达调控研究的模型第27-29页
 第三章 鱼类血红蛋白研究进展第29-36页
  1 无Hb的南极冰鱼第29-30页
  2 只表达1条珠蛋白链的七鳃鳗第30页
  3 黄尾平口石首鱼和蓝鳍金枪鱼具Root效应的Hb第30-33页
   ·黄尾平口石首鱼具Root效应的Hb第31页
   ·蓝鳍金枪鱼具Root效应的Hb第31-33页
  4 鳗鲡目阴性和阳性Hb第33页
  5 虹鳟鱼HbⅠ—Ⅳ第33-36页
   ·虹鳟鱼HbⅠ第34页
   ·虹鳟鱼Hb的多样性第34-36页
 第四章 鱼类珠蛋白基因研究进展第36-44页
  1 鲤形目的鲤鱼与斑马鱼第37-39页
   ·鲤鱼第37-38页
   ·斑马鱼第38-39页
  2 红鳍东方豚第39-40页
  3 青鳉第40-41页
  4 南极鱼类第41-44页
第二部分 研究内容第44-98页
 第五章 大黄鱼α-和β-珠蛋白基因的克隆及其链接方式的初步分析第45-65页
  1 材料第46页
   ·实验鱼第46页
   ·菌株和质粒第46页
   ·工具酶与试剂第46页
  2 方法第46-52页
   ·引物设计第46-47页
   ·大黄鱼脾脏总RNA的提取第47页
   ·反转录第47-48页
   ·大黄鱼β_1-珠蛋白基因cDNA部分序列的克隆第48页
   ·3′-RACE PCR第48-49页
   ·珠蛋白基因cDNA的T-A克隆第49-51页
   ·大黄鱼肝脏基因组提取第51页
   ·α-和β-珠蛋白基因的扩增第51-52页
   ·α-和β-珠蛋白基因链接分析第52页
   ·序列测定及分析第52页
  3 结果第52-61页
   ·β_1-珠蛋白基因cDNA核苷酸和推导的氨基酸序列第52-56页
   ·α-珠蛋白基因cDNA核苷酸和推导的氨基酸序列第56-60页
   ·大黄鱼α-和β_2-珠蛋白基因核苷酸序列第60-61页
   ·大黄鱼α-和β-珠蛋白基因的链接方向第61页
  4 讨论第61-65页
   ·大黄鱼α-和β_1-珠蛋白的特点第61-62页
   ·大黄鱼珠蛋白基因的多态性第62-63页
   ·大黄鱼α-和β-珠蛋白基因的链接分析第63-65页
 第六章 美国红鱼珠蛋白链的分离及其α-和β-珠蛋白基因的克隆第65-77页
  1 材料与方法第66-67页
   ·实验材料第66页
   ·质粒、菌株和生化试剂第66页
   ·常用缓冲液及培养基试剂配制第66-67页
  2 方法第67-69页
   ·血红蛋白的提取第67页
   ·珠蛋白链的分离第67页
   ·总RNA的提取与反转录第67页
   ·扩增美国红鱼α-和β-珠蛋白基因cDNA第67-68页
   ·美国红鱼肝脏基因组提取第68页
   ·扩增美国红鱼β-珠蛋白基因第68页
   ·紧密链锁的α-和β-珠蛋白基因间序列的扩增第68页
   ·PCR产物序列测定第68-69页
   ·测序结果分析和与其它物种序列的比较第69页
  3 结果第69-73页
   ·珠蛋白链分离第69页
   ·α-珠蛋白基因cDNA核菅酸和推导的氨基酸序列分析第69-71页
   ·β_1-珠蛋白基因cDNA核苷酸和推导的氨基酸序列第71-72页
   ·β-珠蛋白基因核苷酸序列第72-73页
   ·紧密链锁的α-和β-珠蛋白基因间序列第73页
  4 讨论第73-77页
   ·美国红鱼珠蛋白肽链的分离第73-74页
   ·美国红鱼和大黄鱼珠蛋白氨基酸序列比较分析第74页
   ·美国红鱼β_1-和β_2-珠蛋白基因核苷酸序列比较分析第74-75页
   ·紧密链接的α-和β-珠蛋白基因间序列分析第75-77页
 第七章 三种石首鱼珠蛋白基因复合体序列比较及大黄鱼基因间序列调控功能的初步鉴定第77-87页
  1 材料第78页
   ·实验材料第78页
   ·菌株和质粒第78页
   ·工具酶与试剂第78页
  2 方法第78-82页
   ·肌肉基因组提取第78页
   ·珠蛋白基因复合体的扩增第78-80页
   ·表达载体pInter/EGFP的构建第80页
   ·转染级超纯度真核表达质粒的制备第80-81页
   ·脂质体介导质粒转染Vero细胞第81-82页
   ·PCR产物序列测定第82页
   ·测序结果分析和与其它物种序列的比较第82页
  3 结果第82-85页
   ·大黄鱼、美国红鱼、鮸状黄姑鱼珠蛋白基因复合体序列第82-84页
   ·报告基因载体pInter/EGFP的构建第84-85页
   ·荧光检测第85页
  4 讨论第85-87页
   ·石首鱼珠蛋白基因复合体序列的特点第85-86页
   ·大黄鱼紧密连锁的α-和β_2-珠蛋白基因间序列启动子功能的初步鉴定第86-87页
 第八章 三种石首鱼珠蛋白基因复合体基因间序列启动子活性比较和大黄鱼B_2-珠蛋白基因内含子1的调控功能鉴定第87-98页
  1 材料第88页
   ·实验鱼第88页
   ·菌株和质粒第88页
   ·工具酶与试剂第88页
   ·主要仪器第88页
  2 方法第88-91页
   ·表达载体pCroaker,pCuneate和pRedrum的构建第88-89页
   ·表达载体pIntergene的构建第89页
   ·表达载体pIntronInter的构建第89页
   ·表达载体pInterIntron的构建第89-90页
   ·转染级超纯度真核表达质粒的制备第90页
   ·鲫鱼红细胞的提取第90页
   ·脂质体介导重组质粒转染鲫鱼红细胞第90页
   ·荧光素酶活性测定法第90-91页
  3 结果第91-95页
   ·真核表达载体pCroaker,pCuneate和pRedrum的构建及鉴定第91-92页
   ·重组载体转染Vero细胞后荧光素酶的相对活性分析第92-93页
   ·真核表达载体pIntergene的构建及鉴定第93-94页
   ·真核表达载体pIntronInter的构建及鉴定第94页
   ·真核表达载体pInterIntron的构建及鉴定第94-95页
   ·重组载体转染红细胞后荧光素酶的相对活性分析第95页
  4 讨论第95-98页
   ·三种石首鱼紧密连锁的α-和β-珠蛋白基因间序列启动子活性强弱比较第95-96页
   ·大黄鱼β_2-珠蛋白基因内含子1调控活性分析第96-98页
第三部分 总结与展望第98-100页
 1 结论与主要创新点第99页
 2 不足与展望第99-100页
参考文献第100-109页
第四部分 附录第109-113页
 附录1 常用试剂及缓冲液第110-112页
 附录2 攻读博士学位期间发表和录用的学术论文第112-113页
致谢第113页

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