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马MHC-Ⅱ类分子遗传多样性的研究

1 文献综述第1-40页
   ·七个马品种的简要介绍第10-19页
     ·地方品种蒙古马的概况第10-16页
     ·培育品种三河马的概况第16-17页
     ·引入品种纯血马的概况第17-18页
     ·特有地方品种广西矮马的概况第18-19页
   ·MHC 分子的研究进展第19-27页
     ·MHC-Ⅰ类分子第19-21页
     ·MHC-Ⅱ类分子第21-23页
     ·MHC 等位基因多态性的产生与保持机制第23-25页
     ·MHC 基因的遗传特点第25-27页
     ·MHC 与疾病相关的机制第27页
   ·马的 MHC 研究进展第27-32页
     ·ELA 的遗传组成第28页
     ·ELA-Ⅰ和Ⅲ类分子的研究进展第28-29页
     ·ELA-Ⅱ类分子的研究进展第29-31页
     ·ELA 检测方法的研究进展第31-32页
     ·ELA 与疾病的关系第32页
   ·分子标记的研究进展第32-37页
     ·限制性片段长度多态性技术(RFLP)第32-33页
     ·微卫星标记技术(SSR)和DNA 指纹技术(DFP)第33-34页
     ·随机扩增多态性 DNA 技术(RAPD)第34-35页
     ·扩增片段长度多态性技术(AFLP)第35页
     ·聚合酶链式反应-单链构象多态技术(PCR-SSCP)第35-36页
     ·DNA 芯片生物技术第36-37页
     ·其他分子标记检测技术第37页
   ·本课题的研究目的及意义第37-39页
   ·本课题的特色与创新之处第39-40页
2 材料与方法第40-51页
   ·实验材料第40-43页
     ·实验样品第40页
     ·主要试剂及来源第40-41页
     ·常用溶液及试剂的配制第41-42页
     ·主要仪器设备第42页
     ·主要分子生物学软件第42-43页
   ·实验方法第43-48页
     ·马血液基因组DNA 的提取及检测第43-44页
     ·PCR 扩增第44-46页
     ·ELA-DRA 和DQA*exon2 基因的单链构象多态电泳(SSCP)分析第46-47页
     ·ELA-DRA,DQA,DRB 和DQB*exon2 基因的PCR 产物纯化和测序第47-48页
   ·数据分析方法第48-51页
     ·群体遗传学数据分析第48-49页
     ·等位基因的确定及序列同源性分析第49页
     ·突变位点分析第49-50页
     ·遗传距离统计方法第50-51页
3 结果与分析第51-101页
   ·ELA-DRA*exon2 位点的多态性分析第51-62页
     ·ELA-DRA*exon2 位点的PCR-SSCP 分析第51-53页
     ·ELA-DRA*exon2 位点的核苷酸分析第53-56页
     ·ELA-DRA*exon2 位点的群体遗传学分析第56-58页
     ·ELA-DRA*exon2 位点的氨基酸序列分析第58-59页
     ·ELA-DRA*exon2 位点的进化分析第59-62页
   ·ELA-DQA*exon2 位点的多态性分析第62-80页
     ·ELA-DQA*exon2 位点的PCR-SSCP 分析第62-65页
     ·ELA-DQA*exon2 位点的核苷酸分析第65-69页
     ·ELA-DQA*exon2 位点的群体遗传学分析第69-73页
     ·ELA-DQA*exon2 位点的氨基酸序列分析第73-78页
     ·ELA-DQA*exon2 位点的进化分析第78-80页
   ·ELA-DRB*exon2 位点的多态性分析第80-90页
     ·ELA-DRB*exon2 位点的核苷酸分析第80-84页
     ·ELA-DRB*exon2 位点的氨基酸分析第84-85页
     ·ELA-DRB*exon2 位点的进化分析第85-90页
   ·ELA-DQB*exon2 位点的多态性分析第90-98页
     ·ELA-DQB*exon2 位点的核苷酸分析第90-94页
     ·ELA-DQB*exon2 位点的氨基酸分析第94-96页
     ·ELA-DQB*exon2 位点的进化分析第96-98页
   ·DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 位点多态性的综合分析第98-101页
     ·DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 位点氨基酸成分的使用一致性分析第98-99页
     ·DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 位点优势密码子及其相对使用频率的不均一性分析第99-101页
4 讨论第101-112页
   ·关于采样及实验方法的讨论第101-105页
     ·关于采样方法和样本含量第101页
     ·基因组DNA的提取第101-102页
     ·PCR 扩增的主要影响因素第102-103页
     ·PCR-SSCP 技术的主要影响因素第103-105页
   ·关于ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点核苷酸变异的讨论第105-106页
     ·ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点的多态性第105页
     ·ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点的核苷酸变异模式第105-106页
   ·关于ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点密码子及其使用偏性的讨论第106-107页
     ·关于密码子碱基使用频率第106页
     ·关于密码子使用偏倚性第106-107页
   ·关于ELA-DRA和DQA*exon2位点的群体遗传学分析第107-108页
     ·ELA-DRA 和DQA*exon2 位点等位基因的分布第107页
     ·群体遗传多样性分析第107-108页
   ·关于ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点氨基酸变异的讨论第108-109页
     ·突变位点氨基酸变异的随机性第108页
     ·突变位点氨基酸变异率的不一致性第108页
     ·突变位点氨基酸变异位置的随意性第108-109页
     ·四个位点氨基酸组成的一致性第109页
     ·四个位点氨基酸变异程度的不一致性第109页
   ·关于ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点进化关系的讨论第109-110页
     ·分子系统发育分析基本原理第109-110页
     ·对七个马品种ELA-DRA、DQA、DRB 和DQB*exon2 四个位点的进化及亲缘关系分析第110页
   ·关于马的 MHC 在保护遗传学中的应用第110-112页
5 结论第112-114页
致谢第114-115页
参考文献第115-123页
附图第123-131页
作者简介第131页

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