1. 中文摘要 | 第1-8页 |
2. 英文摘要 | 第8-10页 |
3. 英文缩写 | 第10-12页 |
4. 主要仪器设备和试剂 | 第12-13页 |
5. 前言 | 第13-16页 |
6. 材料与方法 | 第16-32页 |
6.1 样本来源与制备 | 第16-18页 |
6.1.1 标本来源与保存 | 第16页 |
6.1.2 全血样本总DNA制备 | 第16-17页 |
红细胞裂解及去除 | 第16页 |
DNA抽提 | 第16页 |
DNA沉淀 | 第16-17页 |
DNA溶解 | 第17页 |
DNA定量 | 第17页 |
6.1.3 聚合酶链反应 | 第17-18页 |
基本原理 | 第17页 |
引物设计 | 第17-18页 |
聚合酶链反应(PCR) | 第18页 |
PCR产物的电泳检测 | 第18页 |
6.2 全线粒体基因组的变异筛选 | 第18-26页 |
6.2.1 时相温度梯度变性凝胶电泳 | 第18-24页 |
基本原理 | 第18-19页 |
电泳起始温度和终止温度的选择 | 第19-20页 |
凝胶的制备 | 第20-23页 |
胶板的安装与封闭 | 第23页 |
D-Code突变检测系统凝胶电泳 | 第23-24页 |
染色与显影 | 第24页 |
阳性结果的判定 | 第24页 |
6.2.2 缺失突变的检测 | 第24-26页 |
常见4977bp缺失突变的检查 | 第24-25页 |
缺失突变的复合检测 | 第25-26页 |
6.2.3 微卫星不稳定的检测 | 第26页 |
6.3 DNA序列测定 | 第26-29页 |
6.3.1 基本原理 | 第26-27页 |
6.3.2 测序样本的制备 | 第27页 |
6.3.3 PCR 反应物的纯化 | 第27页 |
6.3.4 测序反应 | 第27-28页 |
6.3.5 去盐纯化法去除多余的寡核苷酸 | 第28页 |
6.3.6 测序过程 | 第28-29页 |
测序变性胶的制备 | 第28页 |
电泳与信号的采集 | 第28-29页 |
6.3.7 图像分析 | 第29页 |
6.4 全线粒体基因组的变异分析 | 第29-31页 |
6.4.1 基因序列比对分析 (BLAST) | 第29-30页 |
分析程序 | 第29页 |
分析参数和运算法则 | 第29-30页 |
标准序列 | 第30页 |
6.4.2 亲缘关系树(Neighbor-Joining Tree)分析 | 第30页 |
基本原理 | 第30页 |
分析方法 | 第30页 |
6.4.3 进化过程中保留序列的判定 | 第30-31页 |
分析程序 | 第30-31页 |
对比序列来源 | 第31页 |
6.5 数据统计 | 第31-32页 |
7. 结果 | 第32-50页 |
7.1 TTGE对基因变异的初步筛选 | 第32-33页 |
7.2 线粒体基因变异的频率、分布和密度 | 第33-40页 |
7.2.1 线粒体基因组变异发生总频率 | 第33-35页 |
7.2.2 全基因组中各基因区域的变异频率和密度 | 第35-36页 |
7.2.3 D环各功能区域突变分析 | 第36页 |
7.2.4 编码呼吸链氧化磷酸化各复合体的mtDNA变异频率和密度 | 第36-38页 |
7.2.5 全基因组中各区域的变异分布特点 | 第38-40页 |
7.3 线粒体基因变异的碱基替换的类型和异质状态 | 第40-41页 |
7.3.1 基因突变状态 | 第40页 |
7.3.2 mRNA基因突变类型 | 第40页 |
7.3.3 碱基替换类型 | 第40-41页 |
7.4 高风险位点的判别和错义突变位点分析 | 第41-46页 |
7.4.1 高风险位点 | 第41-42页 |
7.4.2 突变对tRNA结构影响 | 第42-43页 |
7.4.3 错义突变位点分析 | 第43-45页 |
7.4.4 突变位点的进化保留分析 | 第45-46页 |
7.5 线粒体基因微卫星不稳定分析 | 第46页 |
7.6 邻接关系结构树分析 | 第46-48页 |
7.7 缺失突变检测 | 第48-50页 |
8. 讨论 | 第50-73页 |
8.1 线粒体基因的基本特点与基因变异特征 | 第50-55页 |
8.1.1 线粒体基因研究的发展史及其基本结构特点 | 第50-53页 |
8.1.2 线粒体基因突变的概念与类型 | 第53-54页 |
8.1.3 线粒体基因突变的机制与特点 | 第54-55页 |
8.2 TTGE在线粒体基因变异筛选中的优势 | 第55-57页 |
8.3 高血压患者线粒体基因变异特点与疾病发生风险 | 第57-67页 |
8.3.1 线粒体基因突变的分布 | 第57-63页 |
基因变异在D环区的分布 | 第57-58页 |
基因变异在OXPHOS复合物中的分布 | 第58-60页 |
基因变异在各RNA区域的分布和变异 | 第60-62页 |
高血压病相关的线粒体基因突变风险位点评估 | 第62-63页 |
8.3.2 线粒体基因变异的碱基替换的类型与错义突变 | 第63-64页 |
8.3.3 高血压病的线粒体基因微卫星不稳定 | 第64-66页 |
8.3.4 线粒体基因树结构重建分析 | 第66-67页 |
8.4 线粒体基因突变在高血压病发生中的可能作用 | 第67-72页 |
8.4.1 血管内皮功能失调与高血压病 | 第67-68页 |
8.4.2 活性氧物质与血管内皮功能失调 | 第68-70页 |
ROS概况 | 第68-69页 |
ROS与血管内皮的损伤 | 第69页 |
ROS与高血压病 | 第69-70页 |
8.4.3 活性氧物质与mtDNA突变 | 第70-71页 |
8.4.4 mtDNA突变与高血压病 | 第71-72页 |
8.5 小结与前景展望 | 第72-73页 |
9. 结论 | 第73-74页 |
10. 参考文献 | 第74-84页 |
11. 综述(线粒体基因突变与心血管疾病) | 第84-94页 |
11.1 线粒体基因的结构与特征 | 第84-85页 |
11.2 线粒体基因突变与疾病 | 第85-86页 |
11.3 线粒体基因突变与心血管疾病 | 第86-91页 |
11.3.1 原发性心肌病 | 第86-88页 |
11.3.2 冠心病 | 第88-89页 |
11.3.3 心力衰竭 | 第89页 |
11.3.4 高血压病 | 第89-90页 |
11.3.5 其它 | 第90-91页 |
11.4 前景及展望 | 第91页 |
11.5 参考文献 | 第91-94页 |
12. 致谢 | 第94-95页 |
13. 在读期间发表及待发表论文 | 第95-96页 |