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原发性高血压病患者全线粒体基因变异扫描分析研究

1. 中文摘要第1-8页
2. 英文摘要第8-10页
3. 英文缩写第10-12页
4. 主要仪器设备和试剂第12-13页
5. 前言第13-16页
6. 材料与方法第16-32页
 6.1 样本来源与制备第16-18页
  6.1.1 标本来源与保存第16页
  6.1.2 全血样本总DNA制备第16-17页
   红细胞裂解及去除第16页
   DNA抽提第16页
   DNA沉淀第16-17页
   DNA溶解第17页
   DNA定量第17页
  6.1.3 聚合酶链反应第17-18页
   基本原理第17页
   引物设计第17-18页
   聚合酶链反应(PCR)第18页
   PCR产物的电泳检测第18页
 6.2 全线粒体基因组的变异筛选第18-26页
  6.2.1 时相温度梯度变性凝胶电泳第18-24页
   基本原理第18-19页
   电泳起始温度和终止温度的选择第19-20页
   凝胶的制备第20-23页
   胶板的安装与封闭第23页
   D-Code突变检测系统凝胶电泳第23-24页
   染色与显影第24页
   阳性结果的判定第24页
  6.2.2 缺失突变的检测第24-26页
   常见4977bp缺失突变的检查第24-25页
   缺失突变的复合检测第25-26页
  6.2.3 微卫星不稳定的检测第26页
 6.3 DNA序列测定第26-29页
  6.3.1 基本原理第26-27页
  6.3.2 测序样本的制备第27页
  6.3.3 PCR 反应物的纯化第27页
  6.3.4 测序反应第27-28页
  6.3.5 去盐纯化法去除多余的寡核苷酸第28页
  6.3.6 测序过程第28-29页
   测序变性胶的制备第28页
   电泳与信号的采集第28-29页
  6.3.7 图像分析第29页
 6.4 全线粒体基因组的变异分析第29-31页
  6.4.1 基因序列比对分析 (BLAST)第29-30页
   分析程序第29页
   分析参数和运算法则第29-30页
   标准序列第30页
  6.4.2 亲缘关系树(Neighbor-Joining Tree)分析第30页
   基本原理第30页
   分析方法第30页
  6.4.3 进化过程中保留序列的判定第30-31页
   分析程序第30-31页
   对比序列来源第31页
 6.5 数据统计第31-32页
7. 结果第32-50页
 7.1 TTGE对基因变异的初步筛选第32-33页
 7.2 线粒体基因变异的频率、分布和密度第33-40页
  7.2.1 线粒体基因组变异发生总频率第33-35页
  7.2.2 全基因组中各基因区域的变异频率和密度第35-36页
  7.2.3 D环各功能区域突变分析第36页
  7.2.4 编码呼吸链氧化磷酸化各复合体的mtDNA变异频率和密度第36-38页
  7.2.5 全基因组中各区域的变异分布特点第38-40页
 7.3 线粒体基因变异的碱基替换的类型和异质状态第40-41页
  7.3.1 基因突变状态第40页
  7.3.2 mRNA基因突变类型第40页
  7.3.3 碱基替换类型第40-41页
 7.4 高风险位点的判别和错义突变位点分析第41-46页
  7.4.1 高风险位点第41-42页
  7.4.2 突变对tRNA结构影响第42-43页
  7.4.3 错义突变位点分析第43-45页
  7.4.4 突变位点的进化保留分析第45-46页
 7.5 线粒体基因微卫星不稳定分析第46页
 7.6 邻接关系结构树分析第46-48页
 7.7 缺失突变检测第48-50页
8. 讨论第50-73页
 8.1 线粒体基因的基本特点与基因变异特征第50-55页
  8.1.1 线粒体基因研究的发展史及其基本结构特点第50-53页
  8.1.2 线粒体基因突变的概念与类型第53-54页
  8.1.3 线粒体基因突变的机制与特点第54-55页
 8.2 TTGE在线粒体基因变异筛选中的优势第55-57页
 8.3 高血压患者线粒体基因变异特点与疾病发生风险第57-67页
  8.3.1 线粒体基因突变的分布第57-63页
   基因变异在D环区的分布第57-58页
   基因变异在OXPHOS复合物中的分布第58-60页
   基因变异在各RNA区域的分布和变异第60-62页
   高血压病相关的线粒体基因突变风险位点评估第62-63页
  8.3.2 线粒体基因变异的碱基替换的类型与错义突变第63-64页
  8.3.3 高血压病的线粒体基因微卫星不稳定第64-66页
  8.3.4 线粒体基因树结构重建分析第66-67页
 8.4 线粒体基因突变在高血压病发生中的可能作用第67-72页
  8.4.1 血管内皮功能失调与高血压病第67-68页
  8.4.2 活性氧物质与血管内皮功能失调第68-70页
   ROS概况第68-69页
   ROS与血管内皮的损伤第69页
   ROS与高血压病第69-70页
  8.4.3 活性氧物质与mtDNA突变第70-71页
  8.4.4 mtDNA突变与高血压病第71-72页
 8.5 小结与前景展望第72-73页
9. 结论第73-74页
10. 参考文献第74-84页
11. 综述(线粒体基因突变与心血管疾病)第84-94页
 11.1 线粒体基因的结构与特征第84-85页
 11.2 线粒体基因突变与疾病第85-86页
 11.3 线粒体基因突变与心血管疾病第86-91页
  11.3.1 原发性心肌病第86-88页
  11.3.2 冠心病第88-89页
  11.3.3 心力衰竭第89页
  11.3.4 高血压病第89-90页
  11.3.5 其它第90-91页
 11.4 前景及展望第91页
 11.5 参考文献第91-94页
12. 致谢第94-95页
13. 在读期间发表及待发表论文第95-96页

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