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实时荧光RT-PCR和杂交诱捕RT-PCR-ELISA检测李坏死环斑病毒的研究

前言第1-21页
 1 李坏死环斑病毒概述第9-12页
  1.1 李坏死环斑病毒的生物学第9-10页
  1.2 李坏死环斑病毒的分子结构第10-11页
  1.3 李坏死环斑病毒的检测方法第11-12页
 2 病原物的分子生物学检测技术进展第12-20页
  2.1 模板扩增的技术第12页
   2.1.1 PCR扩增技术第12页
   2.1.2 NASBA扩增技术第12页
  2.2 信号放大的技术第12-13页
   2.2.1 分支探针技术第13页
   2.2.2 肽核酸探针技术第13页
  2.3 模板扩增和信号放大相结合的技术第13-14页
   2.3.1 PCR-基因扫描检测PCR产物第13页
   2.3.2 PCR产物的安吉伦芯片检测第13-14页
   2.3.3 SYBRGREEN荧光检测技术第14页
  2.4 模板扩增和杂交及信号放大相结合的技术第14-19页
   2.4.1 PCR-ELISA技术第14页
   2.4.2 PCR-ELISA技术的种类第14-16页
   2.4.3 实时荧光PCR检测技术第16-17页
   2.4.4 实时荧光PCR技术的种类第17-19页
  2.5 生物芯片检测技术第19-20页
 3 本研究的目的和意义第20-21页
材料和方法第21-31页
 1 试验材料第21-22页
  1.1 毒源第21页
  1.2 繁殖寄主第21页
  1.3 供试健康寄主第21页
  1.4 供试载体宿主菌株及载体第21页
  1.5 供试酶类及试剂盒第21页
  1.6 供试分子量标准第21页
  1.7 供试生化及分子生物学试剂第21-22页
  1.8 主要仪器第22页
  1.9 引物及探针第22页
 2 试验方法第22-31页
  2.1 毒原的接种第22页
  2.2 PNRSV和ToRSV的DAS-ELISA检测第22页
  2.3 核酸的提取第22-23页
  2.4 引物设计第23-24页
  2.5 RT-PCR反应第24-25页
   2.5.1 RNA反转DNA第24页
   2.5.2 PCR扩增第24页
   2.5.3 PCR产物电泳第24-25页
  2.6 PCR产物的克隆第25-27页
   2.6.1 PCR产物的回收第25页
   2.6.2 PCR产物与载体的连接第25页
   2.6.3 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第25页
   2.6.4 克隆的筛选第25-27页
  2.7 诱捕PCR/RT-PCR-ELISA检测方法的建立第27-28页
   2.7.1 诱捕探针与杂交探针的设计第27页
   2.7.2 诱捕PCR管的制备第27页
   2.7.3 核酸的诱捕第27页
   2.7.4 PCR或RT-PCR第27-28页
   2.7.5 液相产物电泳检测第28页
   2.7.6 固相产物的分子杂交和ELISA检测第28页
  2.8 实时荧光PCR和实时荧光RT-PCR检测方法的建立第28-31页
   2.8.1 样品的制备核酸的提取同前第29页
   2.8.2 荧光探针的设计第29页
   2.8.3 实时荧光PCR/RT-PCR检测第29-30页
   2.8.4 7700SDS软件的设置第30页
   2.8.5 数据分析和结果输出第30-31页
结果与分析第31-45页
 1.1 接种后观察症状第31页
 1.2 PNRSV和ToRSV的DAS-ELISA检测第31页
 1.3 总RNA提取结果第31-33页
  1.3.1 RT-PCR扩增结果第32-33页
 1.4 PNRSV的RT-PCR产物的克隆和测序第33-35页
  1.4.1 重组质粒PCR和酶切鉴定第33-34页
  1.4.2 核酸序列测定和分析第34-35页
 1.5 诱捕参数的优化第35-36页
  1.5.1 诱捕的温度确定第35页
  1.5.2 诱捕时间的确定第35-36页
 1.6 确定不同引物比对ELISA检测的影响第36页
 1.7 探针杂交参数的优化第36-38页
  1.7.1 杂交温度的确定第36-37页
  1.7.2 杂交时间的确定第37页
  1.7.3 不同探针浓度的确定第37-38页
 1.8 诱捕PCR-ELISA的特异性第38页
 1.9 诱捕PCR的敏感性第38-39页
 1.10 对诱捕PCR管有效期试验第39页
 1.11 实时荧光PCR的条件的优化第39-41页
  1.11.1 优化引物浓度第39-40页
  1.11.2 探针浓度的优化第40页
  1.11.3 最佳Mg~(2+)离子浓度第40-41页
  1.11.4 最佳DNTP的浓度第41页
 1.13 实时荧光RT-PCR一步检测的特异性第41-42页
 1.14 灵敏度的确定第42-43页
  1.14.1 绝对灵敏度第42-43页
  1.14.2 相对灵敏灵第43页
 1.15 诱捕PCR-ELISA和实时荧光PCR检测梨火疫细菌第43-45页
  1.15.1 诱捕诱捕PCR-ELISA检测第43-44页
  1.15.2 实时荧光PCR检测第44-45页
讨论第45-50页
 1.1 植物总RNA的提取第45-46页
 1.2 关于非特异性PCR扩增的问题第46页
 1.3 核酸的杂交第46-47页
 1.4 诱捕PCR-ELISA管的问题第47页
 1.5 实时荧光PCR的探针和退火温度第47-48页
 1.6 PCR检测污染的问题第48-49页
 1.7 几种检测方法在检验检疫中的应用第49-50页
小结第50-51页
参考文献第51-59页
缩写词第59-60页
致谢第60-61页
个人简历第61页

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