| 中文摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| ·人类基因组计划和模式生物基因组计划 | 第8-10页 |
| ·非编码区及其功能简介 | 第10页 |
| ·生物学数据库简介 | 第10-11页 |
| ·生物信息学及其主要研究内容 | 第11-14页 |
| ·本文的研究工作 | 第14-16页 |
| 第二章 DNA 序列的Z 曲线理论及其应用 | 第16-28页 |
| ·DNA 序列的Z 曲线理论 | 第16-19页 |
| ·考虑DNA 序列内部相邻碱基相关性的Z 曲线理论 | 第17-18页 |
| ·描述基因组GC 含量沿序列分布的Z′曲线 | 第18-19页 |
| ·Z 曲线理论的应用 | 第19-26页 |
| ·基于可视化的Z 曲线分析和比较基因组 | 第20页 |
| ·细菌、古细菌复制起始位点识别 | 第20-23页 |
| ·冠状病毒酶切位点预测及进化关系分析 | 第23-25页 |
| ·利用相位特异性的Z 曲线进行基因识别 | 第25-26页 |
| ·Z 曲线方法的优势 | 第26-28页 |
| ·与Glimmer 2.02 对比 | 第27页 |
| ·与马尔科夫链模型比较 | 第27-28页 |
| 第三章 Z 曲线对禽流感病毒编码序列的分析 | 第28-34页 |
| ·引言 | 第28-29页 |
| ·禽流感病毒简介 | 第29-30页 |
| ·材料与方法 | 第30页 |
| ·结果与讨论 | 第30-34页 |
| 第四章 Ｚ曲线方法对非编码RNA 序列分析 | 第34-42页 |
| ·引言 | 第34-35页 |
| ·材料及方法 | 第35页 |
| ·Ｚ曲线方法对非编码RNA 序列的分析 | 第35-40页 |
| ·与两类疾病相关的ncRNA 序列Z 曲线 | 第35-38页 |
| ·几类功能不同的ncRNA 序列Z 曲线的统计分析 | 第38-40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-42页 |
| 第五章 Z 曲线方法对非编码区基因的识别 | 第42-48页 |
| ·引言 | 第42-43页 |
| ·材料与方法 | 第43-44页 |
| ·数据库 | 第43页 |
| ·相位特异性的Ｚ曲线 | 第43-44页 |
| ·主成分分析 | 第44页 |
| ·K-means 聚类方法 | 第44页 |
| ·对AEROPYRUM PERNIX K1 非编码基因的Z 曲线识别 | 第44-46页 |
| ·结果与讨论 | 第46-48页 |
| 第六章 结论 | 第48-50页 |
| 附录I 核苷酸代码 | 第50-51页 |
| 附录II 遗传密码表 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及科研情况 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
