| 摘要 | 第1-14页 |
| Abstract | 第14-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-34页 |
| ·低能电子诱导DNA螺旋的断裂 | 第17-23页 |
| ·实验研究的进展 | 第18-21页 |
| ·理论计算的进展 | 第21-23页 |
| ·金属酶的催化机理研究 | 第23-25页 |
| ·本论文拟开展的工作 | 第25-28页 |
| ·低能电子附着诱导DNA螺旋断裂的理论研究 | 第25-26页 |
| ·金属酶催化过程的反应机理研究 | 第26-28页 |
| 参考文献 | 第28-34页 |
| 第二章 计算方法 | 第34-50页 |
| ·密度泛函理论(Density Functional Theory) | 第34-39页 |
| ·Thomas-Fermi理论和Hohenberg-Kohn-Sham理论 | 第35-36页 |
| ·局域密度近似 | 第36-37页 |
| ·广义梯度近似 | 第37-38页 |
| ·杂化泛函 | 第38-39页 |
| ·量子力学/分子力学组合方法(Combined QM/MM Methods) | 第39-45页 |
| ·QM/MM组合方法的能量表达式 | 第40页 |
| ·静电势项 | 第40-42页 |
| ·机械嵌入(Mechanical Embedding) | 第40-41页 |
| ·静电场嵌入(Electrostatic Embedding) | 第41页 |
| ·极化嵌入(Polarized Embedding) | 第41-42页 |
| ·其它的非键和成键相互作用 | 第42页 |
| ·QM/MM边界原子的处理 | 第42-43页 |
| ·QM/MM计算方法的架构 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 第三章 嘌呤碱基脱氢过程的密度泛函研究 | 第50-63页 |
| ·前言 | 第50-51页 |
| ·计算方法 | 第51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-58页 |
| ·腺嘌呤和鸟嘌呤的几何构型和自然布居分析 | 第51-52页 |
| ·脱氢的自由基和阴离子的稳定性研究 | 第52-53页 |
| ·电子亲合能和热力学性质的研究 | 第53-55页 |
| ·势能面 | 第55-57页 |
| ·电子结构性质 | 第57-58页 |
| ·结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |
| 第四章 腺嘌呤-胸腺嘧啶碱基对脱氢过程的密度泛函研究 | 第63-80页 |
| ·前言 | 第63-64页 |
| ·计算方法 | 第64-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-74页 |
| ·脱氢化自由基和阴离子的几何构型和相对能量 | 第65-69页 |
| ·自然布居分析 | 第69页 |
| ·电子亲合能和热力学性质 | 第69-71页 |
| ·脱氢分解能 | 第71-72页 |
| ·脱氢碎片化的势能面曲线和电子结构性质 | 第72-74页 |
| ·结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-80页 |
| 第五章 电子附着诱导嘧啶核苷C-O和C-N键断裂的理论研究 | 第80-94页 |
| ·前言 | 第80-81页 |
| ·计算方法 | 第81页 |
| ·结果与讨论 | 第81-88页 |
| ·几何构型和电荷分布 | 第81-83页 |
| ·电子亲合能 | 第83-84页 |
| ·C_(5′)-O_(5′)和C_(1′)-N_1键的分解能 | 第84-86页 |
| ·C_(5′)-O_(5′)和C_(1′)-N_1键的活化能垒 | 第86-88页 |
| ·结论 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-94页 |
| 第六章 固氮酶活性位铁钼辅酶中空隙原子的理论探索 | 第94-106页 |
| ·前言 | 第94页 |
| ·计算方法 | 第94-95页 |
| ·结果和讨论 | 第95-100页 |
| ·几何构型 | 第96-97页 |
| ·FeMoco(μ_6-X)簇中CO和N_2的配位 #8 | 第97-100页 |
| ·FeMoco(μ_6-X)簇的氧化还原势 | 第100页 |
| ·结论 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-106页 |
| 第七章 CO脱氢酶反应中间体的计算表征 | 第106-117页 |
| ·前言 | 第106-107页 |
| ·计算方法 | 第107-108页 |
| ·结果和讨论 | 第108-113页 |
| ·结论 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-117页 |
| 第八章 硝酸根还原酶反应机理的密度泛函研究 | 第117-129页 |
| ·前言 | 第117-118页 |
| ·计算方法 | 第118-119页 |
| ·结果和讨论 | 第119-125页 |
| ·几何构型 | 第119-120页 |
| ·反应机理 | 第120-125页 |
| ·质子化和电子还原步骤 | 第125页 |
| ·结论 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-129页 |
| 发表论文 | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130页 |
