| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 目录 | 第10-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-33页 |
| ·统计模拟 | 第14-21页 |
| ·定量构效关系的概述 | 第15-18页 |
| ·定量构效关系研究中的关键因素 | 第18-21页 |
| ·理论计算 | 第21-25页 |
| ·分子力学计算 | 第21-22页 |
| ·分子动力学计算 | 第22-24页 |
| ·量子化学计算 | 第24-25页 |
| ·本文研究提要 | 第25-27页 |
| 参考文献 | 第27-33页 |
| 第二章 原理和方法 | 第33-59页 |
| ·统计模拟方法及模型的评价 | 第33-42页 |
| ·变量筛选方法 | 第33-34页 |
| ·统计模拟方法 | 第34-41页 |
| ·统计模型验证 | 第41-42页 |
| ·量子化学方法 | 第42-50页 |
| ·从头计算方法 | 第42-43页 |
| ·半经验计算方法 | 第43-44页 |
| ·密度泛函理论 | 第44-48页 |
| ·量子化学/分子力学杂化计算 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-59页 |
| 第三章 肽在离子迁移谱中的离子迁移时间的统计模拟 | 第59-87页 |
| ·前言 | 第59-62页 |
| ·材料和方法 | 第62-64页 |
| ·数据来源 | 第62页 |
| ·肽的结构表征 | 第62-63页 |
| ·变量筛选 | 第63页 |
| ·变量预处理 | 第63页 |
| ·模型验证 | 第63页 |
| ·软件实现 | 第63-64页 |
| ·结果与讨论 | 第64-79页 |
| ·统计建模及分析 | 第64-76页 |
| ·GA-GP模型分析 | 第76-77页 |
| ·GP模型中的变量重要性分析 | 第77-79页 |
| ·本章小结 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-87页 |
| 第四章 蛋白质中~(13)C~α NMR化学位移的统计模拟 | 第87-121页 |
| ·前言 | 第87-90页 |
| ·材料和方法 | 第90-94页 |
| ·样本集 | 第90-91页 |
| ·~(13)C~α NMR化学位移的统计模拟 | 第91-92页 |
| ·~(13)C~α NMR化学位移的量子化学计算 | 第92-94页 |
| ·软件实现 | 第94页 |
| ·结果与讨论 | 第94-109页 |
| ·蛋白质二级结构对~(13)C~α NMR化学位移的影响 | 第94-97页 |
| ·QSPR模拟 | 第97-104页 |
| ·~(13)C~α NMR化学位移的量化分析 | 第104-109页 |
| ·本章小结 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-121页 |
| 第五章 蛋白质与卤素离子相互作用能的量化研究 | 第121-162页 |
| ·前言 | 第121-124页 |
| ·材料和方法 | 第124-129页 |
| ·模型的几何结构 | 第124-125页 |
| ·理论计算 | 第125-127页 |
| ·PDB数据库检索 | 第127-128页 |
| ·杂化QM/MM计算 | 第128-129页 |
| ·软件 | 第129页 |
| ·结果与讨论 | 第129-151页 |
| ·卤素离子与蛋白质基团模型物的相互作用 | 第129-131页 |
| ·相互作用能的分析 | 第131-134页 |
| ·DFT方法重现MP2理论水平的能力 | 第134-148页 |
| ·DFT方法对静电力和色散力的描述 | 第148-149页 |
| ·真实系统分析 | 第149-151页 |
| ·本章小结 | 第151-153页 |
| 参考文献 | 第153-162页 |
| 第六章 总结与展望 | 第162-167页 |
| ·研究总结 | 第162-165页 |
| ·前景展望 | 第165-167页 |
| 附录:攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第167-169页 |
| 致谢 | 第169-173页 |