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上游序列转录复合物(USTC)调控piRNA转录的机制研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第1章 绪论第12-29页
    1.1 秀丽隐杆线虫简介第12-14页
    1.2 线虫中的RNA干扰现象第14-23页
        1.2.1 线虫中的小RNA第14-18页
        1.2.2 线虫中的细胞核内RNA干扰通路第18-20页
        1.2.3 线虫中RNA干扰的代际遗传第20-23页
    1.3 piRNA通路第23-28页
        1.3.1 piRNA的功能第23-25页
        1.3.2 piRNA的生成第25-28页
    1.4 本课题的目的与意义第28-29页
第2章 实验材料与方法第29-62页
    2.1 线虫品系第29-31页
    2.2 实验相关仪器第31-33页
    2.3 实验相关试剂第33-34页
    2.4 线虫的培养、传代与杂交第34-36页
    2.5 线虫的冻存与复苏第36-37页
    2.6 线虫中的RNAi第37-41页
        2.6.1 线虫RNA干扰菌的构建第37-40页
        2.6.2 线虫RNA干扰实验第40-41页
    2.7 线虫的显微观察第41-42页
    2.8 线虫的免疫荧光染色第42-43页
    2.9 正向遗传筛选第43-44页
    2.10 SNP遗传定位第44-45页
    2.11 线虫DNA的提取第45页
    2.12 线虫的显微注射第45-47页
    2.13 利用MosSCI技术构建转基因线虫第47-50页
    2.14 线虫中的染色质免疫共沉淀第50-53页
        2.14.1 线虫染色质免疫共沉淀实验第50-53页
        2.14.2 线虫染色质免疫共沉淀测序分析第53页
    2.15 荧光定量PCR第53-54页
    2.16 线虫RNA的提取与处理第54-56页
        2.16.1 线虫RNA的提取第54-55页
        2.16.2 线虫RNA的处理第55-56页
        2.16.3 RNA测序分析第56页
    2.17 线虫蛋白质的提取与免疫印迹实验第56-58页
    2.18 线虫后代数量的统计第58-59页
    2.19 线虫生长速率的统计第59页
    2.20 利用CRISPR技术构建线虫突变体第59-62页
第3章 实验结果与讨论第62-96页
    3.1 TOFU蛋白在线虫生殖腺细胞中的亚细胞定位第62-66页
    3.2 tofu-3,-4,-5参与piRNA的转录第66-82页
        3.2.1 tofu-3,-4,-5的缺失导致piRNA量降低第66-68页
        3.2.2 TOFU-3,-4,-5与PRDE-1在生殖腺细胞核内共定位第68-69页
        3.2.3 细胞核中TOFU-5的亚细胞定位依赖于TOFU-4和PRDE-1第69-70页
        3.2.4 TOFU-5结合在piRNA启动子处并依赖于TOFU-4和PRDE-1第70-72页
        3.2.5 TOFU-5核内定位依赖于SANT结构域和SNPC-4第72-74页
        3.2.6 细胞核中TOFU-4的亚细胞定位依赖于PRDE-1,TOFU-5和SNPC-4第74-76页
        3.2.7 TOFU-4结合在piRNA启动子处并依赖于PRDE-1第76-77页
        3.2.8 TOFU-4 TOFU-5,PRDE-1和SNPC-4蛋白富集在四号染色体的piRNA基因簇第77-78页
        3.2.9 PRDE-1, SNPC-4, TOFU-4和TOFU-5结合在Ruby motif第78-80页
        3.2.10 SNPC-4和TOFU-5结合二类piRNA基因启动子第80-82页
    3.3 tofu-6参与piRNA的加工第82-85页
        3.3.1 tofu-6突变导致piRNA量降低第82-84页
        3.3.2 TOFU-6定位在生殖腺细胞质和P-Granule中第84-85页
    3.4 基于TOFU-5的亚细胞定位遗传筛选piRNA的调控因子第85-92页
        3.4.1 TBP-1参与piRNA的生成第85-87页
        3.4.2 MES-2,-3,-6影响TOFU-5的亚细胞定位第87-88页
        3.4.3 正向遗传筛选参与piRNA转录的调控基因第88-92页
    3.5 总结与讨论第92-96页
        3.5.1 piRNA的命运决定第92页
        3.5.2 TOFU-5和SNPC-4的其他功能第92-94页
        3.5.3 tbp-1基因的功能研究第94页
        3.5.4 组蛋白甲基化与piRNA之间的关联第94-95页
        3.5.5 pfd-l基因的功能研究第95-96页
参考文献第96-106页
致谢第106-108页
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果第108页

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