| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 研究背景 | 第9-20页 |
| 1.1 乳腺癌的流行状况和疾病特点 | 第9-10页 |
| 1.2 肿瘤异质性研究的现状和肿瘤发生发展机理研究的必要性 | 第10-11页 |
| 1.3 肿瘤转移机制研究的现状及尚未解决问题 | 第11-18页 |
| 1.3.1 血管内渗步骤在肿瘤转移过程的重要性及其分子生物学研究进展 | 第11-13页 |
| 1.3.2 乳腺癌基因组学对转移相关基因的研究揭示血管转移基因研究的普适性 | 第13页 |
| 1.3.3 单细胞/微量细胞基因组研究的进展及其在肿瘤异质性和转移机制研究中的作用 | 第13-17页 |
| 1.3.4 肿瘤抱团转移机制的研究现状 | 第17-18页 |
| 1.4 基因组和转录组结合分析揭示肿瘤细胞转移机制 | 第18页 |
| 1.5 本研究意义 | 第18-20页 |
| 第二章 材料与方法 | 第20-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.1 主要仪器 | 第20页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-27页 |
| 2.2.1 冰冻组织切片的快速染色、激光捕获显微分离(LCM) | 第20-22页 |
| 2.2.2 样品gDNA和mRNA同步扩增和建库 | 第22-25页 |
| 2.2.3 上机文库的构建与质控 | 第25页 |
| 2.2.4 BGISEQ-500测序 | 第25页 |
| 2.2.5 下机数据的信息分析 | 第25-27页 |
| 第三章 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3.1 乳腺癌转移性克隆的基因组特征 | 第27-32页 |
| 3.1.1 微量细胞团DNA测序数据质控 | 第27页 |
| 3.1.2 全基因组拷贝数变异分析 | 第27-29页 |
| 3.1.3 基于拷贝数变异对样品进行亚克隆分析和进化分析 | 第29-32页 |
| 3.1.4 使用重抽样自助法(Bootstrap)评价聚类分类分析可信度 | 第32页 |
| 3.2 乳腺癌转移性克隆的转录组特征 | 第32-39页 |
| 3.2.1 微量细胞团RNA测序数据质控 | 第32-34页 |
| 3.2.2 基于表达量的转录组亚克隆分群分析 | 第34-35页 |
| 3.2.3 基因组和转录组克隆的相互比较 | 第35-36页 |
| 3.2.4 基于表达量的细胞团演化时序分析 | 第36-39页 |
| 3.3 转移性克隆抱团转移机制 | 第39-45页 |
| 3.3.1 基因富集分析 | 第39-41页 |
| 3.3.2 关键节点基因分析 | 第41-45页 |
| 第四章 结论 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 附件 | 第52页 |
