摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第9-15页 |
1.1 高尔基体的结构与功能 | 第9-10页 |
1.1.1 顺面膜囊或顺面网状结构 | 第10页 |
1.1.2 中间膜囊 | 第10页 |
1.1.3 反面膜囊或反面网状结构 | 第10页 |
1.2 研究背景及意义 | 第10-11页 |
1.3 国内外研究现状及分析 | 第11-13页 |
1.4 论文研究内容和安排 | 第13-15页 |
第二章 特征提取和预测算法 | 第15-24页 |
2.1 引言 | 第15页 |
2.2 特征提取 | 第15-22页 |
2.2.1 氨基酸组分信息 | 第15页 |
2.2.2 蛋白质骨架信息 | 第15-16页 |
2.2.3 平均化学位移(Autocovarianceaveragechemicalshifts,acACS) | 第16-17页 |
2.2.4 同源序列GO信息 | 第17-18页 |
2.2.5 进化信息 | 第18-19页 |
2.2.6 氨基酸黏性信息 | 第19-20页 |
2.2.7 结构域信息 | 第20页 |
2.2.8 氨基酸物理化学性质 | 第20-22页 |
2.3 支持向量机算法(SupportVectorMachine,SVM) | 第22页 |
2.4 算法评价 | 第22-24页 |
第三章 亚高尔基体蛋白质的结构分析 | 第24-33页 |
3.1 引言 | 第24页 |
3.2 数据集 | 第24-25页 |
3.3 亚高尔基体蛋白质结构域分析 | 第25-31页 |
3.3.1 顺面膜囊(cis-Golgi)蛋白质结构域分析 | 第25-27页 |
3.3.2 反面膜囊(trans-Golgi)蛋白质结构域分析 | 第27-30页 |
3.3.3 顺面膜囊(cis-Golgi)和反面膜囊(trans-Golgi)蛋白质共有结构域分析 | 第30-31页 |
3.4 小结 | 第31-33页 |
第四章 亚高尔基体蛋白质分类预测分析 | 第33-41页 |
4.1 引言 | 第33页 |
4.2 不同特征参数对预测结果的影响 | 第33-37页 |
4.2.1 分段氨基酸组分信息(AAC) | 第33-34页 |
4.2.2 平均化学位移(acACS) | 第34页 |
4.2.3 分段蛋白质骨架信息(PB) | 第34-35页 |
4.2.4 同源序列GO信息 | 第35页 |
4.2.5 进化信息(PSSM) | 第35-36页 |
4.2.6 氨基酸黏性信息(stickiness) | 第36页 |
4.2.7 结构域信息(Domain) | 第36页 |
4.2.8 物理化学性质(AAindex) | 第36-37页 |
4.3 结果与讨论 | 第37-41页 |
4.3.1 单特征信息对预测结果的影响 | 第37-38页 |
4.3.2 融合特征信息对预测结果的影响 | 第38-39页 |
4.3.3 与他人预测结果的比较 | 第39页 |
4.3.4 融合特征信息对Ding’s数据集的预测结果 | 第39-40页 |
4.3.5 融合特征信息的独立检验的预测结果 | 第40-41页 |
第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
5.1 工作总结 | 第41页 |
5.2 工作展望 | 第41-43页 |
参考文献 | 第43-49页 |
附录 | 第49-51页 |
致谢 | 第51-52页 |
作者攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录 | 第52页 |