基因组岛数据库及分析平台构建
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第10页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-15页 |
| 1.2.1 基因组岛简介 | 第11页 |
| 1.2.2 基因组岛分类 | 第11-15页 |
| 1.3 论文的主要工作与组织结构 | 第15-16页 |
| 2 基因组岛数据的整理 | 第16-25页 |
| 2.1 基因组岛的数据库 | 第16-19页 |
| 2.1.1 基因组岛的数据库简介 | 第16-18页 |
| 2.1.2 本论文数据的收集与处理 | 第18-19页 |
| 2.2 基因组岛的识别方法 | 第19-22页 |
| 2.2.1 基因组岛的识别方法简介 | 第19-22页 |
| 2.2.2 本论文预测结果的整理 | 第22页 |
| 2.3 基因组岛注释数据集的整理 | 第22-24页 |
| 2.3.1 注释数据集的构建流程 | 第22-23页 |
| 2.3.2 注释数据集的结果分析 | 第23-24页 |
| 2.4 本章小结 | 第24-25页 |
| 3 基因组岛数据库的设计与实现 | 第25-38页 |
| 3.1 基因组岛数据的功能设计 | 第25-27页 |
| 3.1.1 功能模块设计 | 第25-26页 |
| 3.1.2 数据查询设计 | 第26页 |
| 3.1.3 存储方式设计 | 第26-27页 |
| 3.2 基因组岛数据的存储结构设计 | 第27-29页 |
| 3.2.1 实体模型设计 | 第27-28页 |
| 3.2.2 建立实体关系 | 第28页 |
| 3.2.3 建立全局实体视图模型 | 第28页 |
| 3.2.4 转化为关系模型 | 第28-29页 |
| 3.3 基因组岛数据查询处理 | 第29-30页 |
| 3.4 基因组岛数据的存储模型优化 | 第30-32页 |
| 3.4.1 逻辑结构优化 | 第30-31页 |
| 3.4.2 物理结构优化 | 第31页 |
| 3.4.3 数据库查询优化 | 第31-32页 |
| 3.5 存储模型的扩展性研究 | 第32-37页 |
| 3.5.1 存储模型的扩展性问题 | 第32页 |
| 3.5.2 扩展性问题的解决方案 | 第32-36页 |
| 3.5.3 测试结果分析 | 第36-37页 |
| 3.6 本章小结 | 第37-38页 |
| 4 基因组岛分析平台的设计与实现 | 第38-51页 |
| 4.1 分析平台的总体设计 | 第38-39页 |
| 4.2 基因组岛数据可视化的设计与实现 | 第39-46页 |
| 4.2.1 展示内容设计 | 第39-40页 |
| 4.2.2 展示方案设计 | 第40-42页 |
| 4.2.3 用户交互接口设计 | 第42-43页 |
| 4.2.4 图形生成模块实现 | 第43-45页 |
| 4.2.5 用户交互模块实现 | 第45-46页 |
| 4.3 基因组岛识别平台的设计与实现 | 第46-50页 |
| 4.3.1 BLAST分析工具的设计 | 第47页 |
| 4.3.2 在线识别平台的设计 | 第47-48页 |
| 4.3.3 BLAST分析工具的实现 | 第48-49页 |
| 4.3.4 在线识别平台的实现 | 第49-50页 |
| 4.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 5 总结与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
