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海洋细菌Shewanella sp.Kz7的寡褐藻胶裂解酶研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
0 前言第14-29页
    0.1 褐藻胶第14-16页
        0.1.1 褐藻胶的来源及结构第14-15页
        0.1.2 褐藻胶的应用第15页
        0.1.3 乙酰化褐藻胶与铜绿假单胞菌生物被膜第15-16页
        0.1.4 褐藻胶的生物降解过程第16页
    0.2 褐藻胶寡糖和单糖第16-20页
        0.2.1 褐藻寡糖和单糖的制备第16-17页
        0.2.2 褐藻胶寡糖和单糖的分离纯化第17-18页
        0.2.3 褐藻寡糖和单糖的应用第18-20页
    0.3 褐藻胶裂解酶第20-27页
        0.3.1 褐藻胶裂解酶的来源第20页
        0.3.2 褐藻胶裂解酶的作用机制第20-21页
        0.3.3 褐藻胶裂解酶的分类第21-22页
        0.3.4 褐藻胶裂解酶活性检测方法第22页
        0.3.5 褐藻胶裂解酶的生物学功能第22-23页
        0.3.6 褐藻胶裂解酶的应用第23-24页
        0.3.7 寡褐藻胶裂解酶第24-27页
    0.4 本论文的研究内容第27-29页
第一章 寡褐藻胶裂解酶产生菌株的筛选及鉴定第29-40页
    1.1 实验材料第29-30页
        1.1.1 实验仪器第29-30页
        1.1.2 实验试剂第30页
        1.1.3 常用培养基第30页
    1.2 实验方法第30-32页
        1.2.1 样品采集第30-31页
        1.2.2 酶活力测定方法第31页
        1.2.3 初筛方法第31页
        1.2.4 复筛方法第31页
        1.2.5 16S rDNA 的克隆与鉴定第31-32页
        1.2.6 阳性克隆鉴定第32页
        1.2.7 16S rDNA 序列测定及分析第32页
        1.2.8 生物信息学分析第32页
    1.3 结果与讨论第32-39页
        1.3.1 菌株筛选结果第32-33页
        1.3.2 菌株种属鉴定第33-39页
    1.4 小结第39-40页
第二章 寡褐藻胶裂解酶基因克隆及序列分析第40-68页
    2.1 材料与方法第40-43页
        2.1.1 实验材料第40-41页
        2.1.2 实验方法第41-43页
    2.2 实验结果第43-66页
        2.2.1 设计简并 PCR 引物第43页
        2.2.2 梯度 PCR 法克隆寡褐藻胶裂解酶的部分基因第43-45页
        2.2.3 序列测定及分析第45-47页
        2.2.4 扩增已知序列两端的序列第47-52页
        2.2.5 寡褐藻胶裂解酶基因序列较正和产物序列分析第52-66页
    2.3 讨论第66页
    2.4 小结第66-68页
第三章 寡褐藻胶裂解酶 OalS6 和 OalS17 的重组表达第68-93页
    3.1 实验材料第68-70页
        3.1.1 实验仪器第68-69页
        3.1.2 试剂盒、工具酶和生化试剂第69-70页
        3.1.3 菌株与质粒第70页
        3.1.4 常用培养基第70页
        3.1.5 引物合成第70页
    3.2 实验方法第70-76页
        3.2.1 Shewanella sp. Kz7 基因组提取第70页
        3.2.2 引物设计与合成第70-71页
        3.2.3 目的片断的 PCR 扩增第71-72页
        3.2.4 目的基因片段的制备第72页
        3.2.5 pET 载体质粒的制备第72-76页
        3.2.6 重组表达载体的构建第76页
        3.2.7 表达产物的检测第76页
    3.3 实验结果第76-92页
        3.3.1 重组表达体系的构建第76-88页
            3.3.1.1 oalS6 目的基因的获得第76-80页
            3.3.1.2 oalS17 目的基因的获得第80-83页
            3.3.1.3 pET 质粒载体的制备第83-84页
            3.3.1.4 寡褐藻胶裂解酶 OalS6 重组表达载体的构建第84-87页
            3.3.1.5 寡褐藻胶裂解酶 OalS17 重组表达载体的构建第87-88页
        3.3.2 寡褐藻胶裂解酶的重组表达第88-92页
            3.3.2.1 oalS6 基因在大肠杆菌中的表达以及表达产物的检测第88-91页
            3.3.2.2 oalS17 基因在大肠杆菌中的表达以及表达产物的检测第91-92页
            3.3.2.3 酶活力测定第92页
    3.4 讨论第92页
    3.5 小结第92-93页
第四章 重组寡褐藻胶裂解酶分离纯化与酶学性质研究第93-120页
    4.1 实验材料第93-94页
        4.1.1 实验仪器第93-94页
        4.1.2 试剂盒和生化试剂第94页
        4.1.3 菌株与质粒第94页
        4.1.4 常用培养基第94页
    4.2 实验方法第94-97页
        4.2.1 亲和层析第94-95页
        4.2.2 重组酶纯度分析第95页
        4.2.3 重组蛋白质浓度及比活力测定第95页
        4.2.4 SDS、EDTA 及金属离子对重组酶活性的影响第95页
        4.2.5 重组酶的最适反应温度第95-96页
        4.2.6 温度对重组酶稳定性的影响第96页
        4.2.7 重组酶的最适 pH第96页
        4.2.8 pH 对重组酶稳定性的影响第96页
        4.2.9 底物偏好性研究第96页
        4.2.10 最终降解产物 TLC 分析第96-97页
        4.2.11 重组酶 OalS6 降解方式的研究第97页
        4.2.12 重组酶 OalS6 降解 polyG 底物的主产物的 MS 和 NMR 波谱解析第97页
    4.3 实验结果第97-118页
        4.3.1 亲和层析第97页
        4.3.2 SDS-PAGE 分析第97-99页
        4.3.3 蛋白含量及比活力测定第99-100页
        4.3.4 重组酶的酶学性质研究第100-118页
            4.3.4.1 SDS、EDTA、金属离子对重组酶活性的影响第100-102页
            4.3.4.2 重组酶的最适反应温度第102-103页
            4.3.4.3 温度对重组酶稳定性的影响第103-104页
            4.3.4.4 重组酶的最适反应 pH第104-105页
            4.3.4.5 pH 对重组酶稳定性的影响第105-106页
            4.3.4.6 底物偏好性的测定第106-107页
            4.3.4.7 重组酶对底物的最终降解产物 TLC 分析第107-108页
            4.3.4.8 重组酶 OalS6 降解方式的研究第108-112页
            4.3.4.9 重组酶 OalS6 降解 polyG 底物的主产物的 MS 和 NMR 波谱解析第112-118页
    4.4 讨论第118-119页
    4.5 小结第119-120页
展望第120-121页
参考文献第121-125页
附录第125-142页
    附录1 培养基、试剂及溶液的配制第125-131页
    附录2 常用分子生物学实验方法第131-135页
    附录3 缩略词第135-136页
    附录4 OalS6基因及氨基酸序列第136-138页
    附录5 OalS17基因及氨基酸序列第138-142页
致谢第142-143页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第143-144页

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