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理性设计改造荧光素酶的热稳定性

摘要第3-4页
ABSTRACT第4页
第一章 绪论第8-21页
    1.1 生物催化剂的热稳定性第8-10页
        1.1.1 蛋白质热稳定性的类型及常用测定方法第8-9页
        1.1.2 提高生物酶热稳定性的对策第9-10页
    1.2 预测蛋白质柔性的方法第10-12页
        1.2.1 分子动力学模拟第10-11页
        1.2.2 B-FITTER第11-12页
    1.3 刚化柔性位点的方法第12-15页
        1.3.1 重跌往复饱和突变(ISM)第12-14页
        1.3.2 结构引领的一致性突变第14页
        1.3.3 引入二硫键和脯氨酸第14-15页
        1.3.4 增加盐桥第15页
    1.4 荧光素酶的热稳定性第15-17页
        1.4.1 北美萤火虫荧光素酶第15-16页
        1.4.2 荧光素酶的热稳定性改造第16-17页
    1.5 本研究的设计思路及意义第17-21页
        1.5.1 RFS 策略第17-19页
        1.5.2 RFSP 理性设计方法第19-21页
第二章 荧光素酶内柔性区域的预测及改造第21-33页
    2.1 实验材料第21-22页
        2.1.1 计算机硬件配置第21页
        2.1.2 分析软件第21-22页
    2.2 实验方法第22-25页
        2.2.1 分子动力学模拟软件 Gromacs v4.5.5 的应用第22-23页
        2.2.2 计算机软件 FRODA 及 B-FITTER 的应用第23-24页
        2.2.3 同源建模软件 MODELLER 的应用第24-25页
    2.3 实验结果及讨论第25-31页
        2.3.1 柔性区域的预测第25-28页
        2.3.2 柔性区域的改造第28-31页
    2.4 本章小结第31-33页
第三章 荧光素酶突变体的载体构建及蛋白质分离纯化第33-46页
    3.1 实验材料第33-36页
        3.1.1 菌株与质粒第33页
        3.1.2 工具酶、试剂盒及主要生化试剂第33-34页
        3.1.3 培养基及溶液的配制第34-35页
        3.1.4 主要实验仪器第35-36页
    3.2 实验方法第36-42页
        3.2.1 野生型萤火虫荧光素酶重组载体的构建第36-37页
        3.2.2 荧光素酶突变体载体的构建第37-40页
        3.2.3 野生酶及突变酶基因的原核表达及蛋白质分离纯化第40-42页
    3.3 实验结果及讨论第42-45页
        3.3.1 野生型及突变型萤火虫荧光素酶突变载体的构建第42-43页
        3.3.2 野生型与突变型萤火虫荧光素酶的原核表达及分离纯化第43-45页
    3.4 本章小结第45-46页
第四章 野生型与突变型荧光素酶结构及功能的研究比较第46-60页
    4.1 实验材料第46-47页
        4.1.1 主要实验试剂及仪器第46-47页
        4.1.2 溶液的配制第47页
    4.2 实验方法第47-49页
        4.2.1 荧光素酶活性检测及动力学参数的测定第47-48页
        4.2.2 荧光素酶动力学稳定性的测定第48页
        4.2.3 荧光素酶热动力学稳定性的测定第48-49页
        4.2.4 荧光素酶发光光谱扫描第49页
    4.3 实验结果与讨论第49-59页
        4.3.1 野生型和突变型荧光素酶的动力学稳定性第49-52页
        4.3.2 野生型及突变型荧光素酶的热动力学稳定性第52-53页
        4.3.3 野生型荧光素酶及最优突变型的动力学常数测定第53页
        4.3.4 野生型及突变型荧光素酶的发光光谱扫描第53-54页
        4.3.5 突变型荧光素酶分子水平的构象变化第54-59页
    4.4 本章小结第59-60页
第五章 结论与展望第60-62页
    5.1 主要结论第60-61页
    5.2 展望第61-62页
参考文献第62-67页
发表论文和参加科研情况第67-68页
附录第68-73页
致谢第73页

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