| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-12页 |
| 1.2.1 PPI网络中的功能模块挖掘 | 第10-11页 |
| 1.2.2 PPI网络中的关键蛋白质识别 | 第11-12页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第12-13页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第13-14页 |
| 第二章 PPI网络中相关分析算法的研究 | 第14-21页 |
| 2.1 PPI网络 | 第14-16页 |
| 2.2 PPI网络中的功能模块挖掘方法 | 第16-17页 |
| 2.3 PPI网络中的关键蛋白质识别方法 | 第17-20页 |
| 2.4 本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 基于PPI网络层次结构分析的功能模块挖掘算法 | 第21-33页 |
| 3.1 引言 | 第21页 |
| 3.2 层次结构树及其似然 | 第21-23页 |
| 3.2.1 层次结构树 | 第21-22页 |
| 3.2.2 层次树的似然 | 第22-23页 |
| 3.3 用遗传算法寻找最大似然的层次树 | 第23-27页 |
| 3.3.1 解的编码 | 第23-25页 |
| 3.3.2 最大似然层次树 | 第25-26页 |
| 3.3.3 适应度计算 | 第26-27页 |
| 3.4 功能模块挖掘及作用预测 | 第27-29页 |
| 3.5 实验结果和分析 | 第29-32页 |
| 3.5.1 实验数据 | 第29页 |
| 3.5.2 结果与分析 | 第29-32页 |
| 3.6 本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 基于Markov随机游走的关键蛋白质识别算法 | 第33-43页 |
| 4.1 引言 | 第33页 |
| 4.2 基于Markov随机游走的关键蛋白质识别方法 | 第33-39页 |
| 4.2.1 相关定义 | 第33-36页 |
| 4.2.2 算法框架 | 第36-39页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第39-42页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第39页 |
| 4.3.2 结果与分析 | 第39-42页 |
| 4.4 本章小结 | 第42-43页 |
| 第五章 基于遗传算法的关键蛋白质识别算法 | 第43-54页 |
| 5.1 引言 | 第43页 |
| 5.2 基于遗传算法的关键蛋白质的识别方法 | 第43-49页 |
| 5.2.1 相关定义 | 第43-44页 |
| 5.2.2 蛋白质之间的相似度评估 | 第44-45页 |
| 5.2.3 算法框架 | 第45-49页 |
| 5.3 实验结果和分析 | 第49-53页 |
| 5.3.1 实验数据集 | 第49页 |
| 5.3.2 结果与分析 | 第49-53页 |
| 5.4 本章小结 | 第53-54页 |
| 第六章 总结与展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 攻读硕士期间研究成果 | 第62-63页 |
