| 英文缩略词表 | 第7-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 第一部分 百岁老人队列情况 | 第14-21页 |
| 一、实验对象 | 第14-15页 |
| 1. 试验对象的选择 | 第14页 |
| 2. 样本量估计 | 第14-15页 |
| 3. 纳入和排除标准 | 第15页 |
| 4. 研究资料收集 | 第15页 |
| 二、实验样本采集及保存 | 第15-16页 |
| 1. 粪便标本的采集 | 第15-16页 |
| 2. 粪便标本命名 | 第16页 |
| 三、结果 | 第16-18页 |
| 1. 队列完成情况 | 第16页 |
| 2. 百岁老人生存情况分析 | 第16-18页 |
| 四、讨论 | 第18-21页 |
| 第二部分 百岁老人肠道菌群分析结果 | 第21-58页 |
| 一、分析方法 | 第21-24页 |
| 1. 材料 | 第21-22页 |
| 1.1 实验试剂及耗材明细 | 第21-22页 |
| 1.2 主要试验仪器明细 | 第22页 |
| 2. 建库 | 第22-23页 |
| 3. 生物信息分析 | 第23-24页 |
| 二、结果及讨论 | 第24-45页 |
| 1. 长队列百岁老人基本信息 | 第24-25页 |
| 2. 数据质控 | 第25-27页 |
| 2.1 原始数据统计 | 第25页 |
| 2.2 单个样品的单次测序Reads各位置碱基分布与质量分布 | 第25-27页 |
| 3. 物种注释与差异物种分析 | 第27-44页 |
| 3.1 物种注释统计 | 第27页 |
| 3.2 各水平物种丰度表 | 第27-29页 |
| 3.3 单样品物种组成分析 | 第29-31页 |
| 3.4 多样品物种分析 | 第31-32页 |
| 3.5 核心物种统计分析 | 第32页 |
| 3.6 物种累积曲线 | 第32页 |
| 3.7 优势物种分析 | 第32-34页 |
| 3.8 三角Ternary图 | 第34-35页 |
| 3.9 优势物种聚类分析 | 第35-36页 |
| 3.10 主成分分析(PCA) | 第36-37页 |
| 3.11 主坐标分析(PCoA) | 第37-38页 |
| 3.12 NMDS分析 | 第38-39页 |
| 3.13 物种Anosim分析 | 第39-41页 |
| 3.14 物种MRPP分析 | 第41页 |
| 3.15 组内组间显著差异物种 | 第41-44页 |
| 3.16 物种LEfSe差异分析 | 第44页 |
| 4. 随机森林模型预测显著差异菌 | 第44-45页 |
| 三、小结 | 第45-47页 |
| 四、讨论 | 第47-56页 |
| 五、全文总结 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 文献综述 | 第62-70页 |
| 参考文献 | 第68-70页 |
| 附录 | 第70-72页 |
| 附表一 | 第70-71页 |
| 附表二 | 第71-72页 |
| 攻读学位期间发表文章情况 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |