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金黄色葡萄球菌磷酸二酯酶GdpP的结构与功能研究

中文摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
符号说明第10-11页
第一章 引言第11-17页
    1.1 金黄色葡萄球菌第11-12页
        1.1.1 金黄色葡萄球菌的危害第11页
        1.1.2 c-di-AMP在金黄色葡萄球菌中的研究第11-12页
    1.2 细菌c-di-AMP相关的介绍第12-15页
        1.2.1 c-di-AMP的发现第12-13页
        1.2.2 c-di-AMP的合成第13-14页
        1.2.3 c-di-AMP的降解第14页
        1.2.4 c-di-AMP的受体第14-15页
    1.3 课题研究的意义第15-17页
第二章 GdpP蛋白的表达、纯化及结晶第17-39页
    2.1 实验材料与仪器第17-19页
        2.1.1 菌株及载体第17页
        2.1.2 材料及服务第17-18页
        2.1.3 主要仪器第18页
        2.1.4 常用试剂第18-19页
    2.2 蛋白理化性质分析第19-24页
        2.2.1 GdpP全长蛋白分析第19-22页
        2.2.2 GdpP-C蛋白的分析第22-24页
    2.3 实验方法第24-30页
        2.3.1 表达载体的构建第24-28页
        2.3.2 GdpP全长蛋白的表达纯化第28-29页
        2.3.3 GdpP-C蛋白的表达纯化第29-30页
        2.3.4 GdpP-C晶体的筛选及优化第30页
    2.4 实验结果第30-38页
        2.4.1 GdpP蛋白的表达纯化结果第30-32页
        2.4.2 GdpP-C蛋白的表达纯化结果第32-34页
        2.4.3 硒代蛋白的表达纯化结果第34-35页
        2.4.4 GdpP-C蛋白的晶体第35-38页
    2.5 本章小结第38-39页
第三章 GdpP-C蛋白晶体结构的解析第39-47页
    3.1 材料及仪器第39页
        3.1.1 实验试剂第39页
        3.1.2 实验仪器第39页
    3.2 结构的解析第39-41页
        3.2.1 衍射数据的收集第39-40页
        3.2.2 数据的处理第40页
        3.2.3 相位的确定第40页
        3.2.4 结构模型的建立第40-41页
        3.2.5 结构的修正第41页
    3.3 实验结果第41-45页
        3.3.1 GdpP-C蛋白结构修正的结果第41-42页
        3.3.2 GdpP-C硒代蛋白结构修正的结果第42-43页
        3.3.3 GdpP蛋白复合物结构的解析结果第43-45页
    3.4 本章小结第45-47页
第四章 GdpP及复合物的结构分析及酶活测定第47-59页
    4.1 材料及仪器第47页
        4.1.1 主要试剂第47页
        4.1.2 实验仪器及服务第47页
    4.2 实验方法第47-50页
        4.2.1 GdpP-C突变体的克隆表达第47-49页
        4.2.2 CD的测定第49页
        4.2.3 酶活的测定第49-50页
    4.3 实验结果第50-58页
        4.3.1 GdpP-C蛋白结构的描述第50-52页
        4.3.2 GdpP-C三种小分子复合物结构的描述第52-54页
        4.3.3 CD的测定结果第54-55页
        4.3.4 GdpP-C蛋白酶活的测定第55-58页
    4.4 本章小结第58-59页
第五章 DHH-DHHA1家族蛋白的统一催化机制第59-69页
    5.1 实验材料及方法第59页
    5.2 GdpP-C降解c-di-AMP机制的研究第59-62页
    5.3 Rv2837c和GdpP一样具有相同的翻转机制第62-64页
    5.4 DHH-DHHA1家族蛋白的G位点特异性识别环二核苷酸第64-65页
    5.5 讨论第65-69页
全文总结第69-71页
参考文献第71-75页
致谢第75-77页
硕士期间发表的学术论文第77-79页
学位论文评阅及答辩情况表第79页

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