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整合宏组学分析畜禽废弃物发酵过程中微生物群落的动态变化

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-14页
第一章 绪论第14-27页
    1.1 过量的畜禽粪污-污染还是资源第14-15页
        1.1.1 过量畜禽粪污废弃物的化学污染危害第14页
        1.1.2 过量畜禽粪污废弃物的微生物污染危害第14-15页
    1.2 堆肥生境中微生物种群及其功能的研究进展第15-18页
        1.2.1 传统微生物学技术手段跟踪分析秸秆降解等天然生境中微生物种类第15-16页
        1.2.2 天然生境微生物组研究的高效平台——整合宏组学技术第16-18页
    1.3 整合宏组学技术揭示了环境中耐药基因的分布及传播规律第18-22页
        1.3.1 宏基因组学揭示携带耐药基因的微生物第20-22页
        1.3.2 宏基因组揭示家禽养殖业中耐药基因的转移网络第22页
    1.4 整合宏组学技术揭示堆肥生境微生物区系及其酶系的动态变化第22-25页
    1.5 整合宏组学技术指导高温好氧连续固态发酵工艺的优化第25页
    1.6 立项依据第25-27页
第二章 山东省部分地区生物质固废原料及处理工艺的调研报告第27-35页
    2.1 前言第27-28页
    2.2 调研企业和调研方法第28-29页
        2.2.1 调研企业基本信息第28-29页
    2.3 调研流程和方法第29页
    2.4 结果与讨论第29-34页
        2.4.1 堆肥原料种类和混料第29-31页
        2.4.2 堆肥条件控制第31-33页
        2.4.3 堆肥成品及包装第33-34页
    2.5 本章小结第34-35页
第三章 鸡粪混合金针菇渣堆肥条件优化策略初探第35-53页
    3.1 前言第35-36页
    3.2 材料与方法第36-40页
        3.2.1 鸡粪金针菇渣混合堆肥方法和取样方式第36页
        3.2.2 鸡粪金针菇渣混合堆肥的理化性质分析第36页
        3.2.3 Native-PAGE和明胶底物的蛋白酶活性酶谱第36-37页
        3.2.4 DNA提取和宏基因组测序第37-38页
        3.2.5 聚类和统计分析第38页
        3.2.6 宏蛋白质组分析第38-39页
        3.2.7 生物信息学分析第39-40页
    3.3 结果与讨论第40-51页
        3.3.1 鸡粪金针菇渣混合堆肥理化性质变化第40-42页
        3.3.2 鸡粪金针菇渣混合堆肥蛋白酶活性变化第42-43页
        3.3.3 鸡粪金针菇渣混合堆肥纤维素酶活性变化第43-44页
        3.3.4 鸡粪金针菇渣混合堆肥微生物组成动态变化第44-49页
        3.3.5 鸡粪金针菇渣混合堆肥胞外功能蛋白质组动态变化第49-51页
    3.4 本章小结第51-53页
第四章 利用宏蛋白质组学研究鸡粪木糖渣混合堆肥功能微生物第53-65页
    4.1 前言第53页
    4.2 材料与方法第53-55页
        4.2.1 堆肥特征第53-54页
        4.2.2 堆肥的理化性质分析第54页
        4.2.3 蛋白活性酶谱分析第54页
        4.2.4 宏蛋白质组分析第54-55页
        4.2.7 生物信息学分析第55页
    4.3 结果与讨论第55-64页
        4.3.1 鸡粪混合木糖渣和活性污泥天然条堆理化性质动态变化第55-57页
        4.3.2 鸡粪混合木糖渣和活性污泥天然条堆纤维素的木聚糖酶活性动态变化第57-58页
        4.3.3 鸡粪混合木糖渣和活性污泥天然条堆纤维素的木聚糖酶谱动态变化第58-62页
        4.3.4 鸡粪混合木糖渣和活性污泥天然条堆蛋白质组鉴定与动态变化第62-64页
    4.4 本章小结第64-65页
第五章 鸡粪罐式发酵过程及其混合木糖渣的二次堆肥工艺条件探索第65-79页
    5.1 前言第65-66页
    5.2 材料与方法第66-69页
        5.2.1 堆肥特征第66页
        5.2.2 堆肥的理化性质分析第66页
        5.2.3 蛋白酶活性酶谱分析第66页
        5.2.4 DNA提取和宏基因组测序第66-67页
        5.2.5 聚类和统计分析第67页
        5.2.6 宏蛋白质组分析第67-68页
        5.2.7 生物信息学分析第68-69页
    5.3 结果与讨论第69-78页
        5.3.1 堆肥样品物理化学性质动态变化第69-70页
        5.3.2 宏基因组测序数据第70-72页
        5.3.3 堆肥微生物区系组成动态变化第72-75页
        5.3.4 堆肥微生物胞外动态酶谱动态变化第75-76页
        5.3.5 堆肥微生物宏胞外蛋白质组动态分析第76-78页
    5.4 本章小结第78-79页
第六章 全文总结与展望第79-81页
参考文献第81-90页
附录一第90-91页
附录二第91-94页
致谢第94-95页
攻读学位期间发表的学术论文第95-96页
附件第96页

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