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绵羊TYRP基因快速进化以适应海拔变化

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
中英文缩略词表(Abbreviation)第12-13页
1 文献综述第13-22页
    1.1 黑色素合成及其相关基因的研究进展第13-18页
        1.1.1 黑色素合成通路的基因成员第13-15页
        1.1.2 TYR基因家族的结构及其生物学功能第15-16页
        1.1.3 黑色素的光保护作用第16-17页
        1.1.4 黑色素合成相关基因的进化第17-18页
    1.2 中国藏系和蒙古系绵羊第18-19页
        1.2.1 藏系绵羊第18页
        1.2.2 蒙古系绵羊第18-19页
    1.3 基因变异与蛋白质结构的关系第19-20页
    1.4 DNA层面上正选择检验方法第20-21页
    1.5 本研究的目的及意义第21-22页
2 材料与方法第22-30页
    2.1 试验材料第22-24页
    2.2 试验仪器及试剂第24-25页
        2.2.1 试验主要试剂第24页
        2.2.2 试验主要仪器第24-25页
        2.2.3 试验常用缓冲液的配制第25页
    2.3 试验方法第25-30页
        2.3.1 绵羊血样DNA的提取与质量检测第25-26页
        2.3.2 DNA混合池构建第26页
        2.3.3 引物的设计、合成及测序第26-27页
        2.3.4 基因频率计算及连锁分析第27-28页
        2.3.5 单倍型构建与分析第28页
        2.3.6 海拔高度关联分析第28页
        2.3.7 蛋白质结构预测第28页
        2.3.8 TYRP基因的种间进化及进化驱动力分析第28-29页
        2.3.9 群体内进化分析第29-30页
3 结果与分析第30-52页
    3.1 TYRP基因变异与海拔的关系第30-41页
        3.1.1 TYRP基因单核苷酸多态性检测第30-31页
        3.1.2 TYRP基因SNP位点的哈代温伯格平衡检验及连锁图谱第31-36页
        3.1.3 TYRP基因变异与海拔高度的关联分析第36-37页
        3.1.4 TYRP等位基因频率在高中低海拔绵羊群体间的差异分析第37-39页
        3.1.5 TYRP基因单倍型分析第39-40页
        3.1.6 TYRP基因的群体遗传多样性第40-41页
    3.2 绵羊TYRP基因变异与其蛋白结构关系分析第41-46页
        3.2.1 TYRP基因变异和TYRP蛋白一级结构的关系第41-43页
        3.2.2 TYRP基因变异和TYRP蛋白二级结构的关系第43-44页
        3.2.3 TYRP基因变异和TYRP蛋白三级结构的关系第44-46页
    3.3 TYRP基因物种间的进化分析第46-49页
        3.3.1 TYRP基因种间进化树的构建与分析第46-47页
        3.3.2 TYRP基因种间相似性比较分析第47页
        3.3.3 TYRP基因正选择检验与分析第47-49页
    3.4 TYRP基因在绵羊种内的进化分析第49-52页
4 讨论第52-56页
    4.1 TYRP基因的进化分析第52-54页
    4.2 TYRP基因的变异与海拔变化的关系第54-56页
5 结语第56-57页
    5.1 结论第56页
    5.2 进一步研究建议第56-57页
参考文献第57-66页
在读期间发表的论文第66-67页
关键词索引第67-68页
致谢第68页

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