| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 生物信息学发展背景 | 第8-10页 |
| 1.2 生物信息学主要研究领域 | 第10-12页 |
| 1.3 微生物基因识别发展概况 | 第12-14页 |
| 1.3.1 微生物基因蛋白质编码区的识别概况 | 第12-13页 |
| 1.3.2 微生物基因翻译起始位点的识别概况 | 第13-14页 |
| 1.4 本论文的主要内容 | 第14-16页 |
| 第二章 相关知识介绍 | 第16-26页 |
| 2.1 生物学相关知识 | 第16-20页 |
| 2.1.1 原核微生物 | 第16页 |
| 2.1.2 遗传信息载体DNA及传递的中心法则 | 第16-17页 |
| 2.1.3 原核生物基因组及基因的结构特点 | 第17-18页 |
| 2.1.4 ORF与基因 | 第18页 |
| 2.1.5 遗传密码子的特征 | 第18-20页 |
| 2.2 数学相关知识 | 第20-22页 |
| 2.2.1 Fisher判别算法 | 第20页 |
| 2.2.2 Jack-Knife检验方法 | 第20-21页 |
| 2.2.3 逐步回归分析 | 第21页 |
| 2.2.4 相关性分析 | 第21-22页 |
| 2.3 相关软件 | 第22-26页 |
| 2.3.1 R软件（R语言） | 第22-23页 |
| 2.3.2 信号肽预测工具SignalP 4.1 软件简介 | 第23页 |
| 2.3.3 RNA二级结构预测软件vienna-rna_2.1.9 介绍 | 第23-26页 |
| 第三章 微生物翻译起始位点识别 | 第26-44页 |
| 3.1 前言 | 第26页 |
| 3.2 数据集 | 第26-28页 |
| 3.2.1 数据集 | 第26-27页 |
| 3.2.2 正、负样本数据集 | 第27-28页 |
| 3.3 序列分析与特征参量 | 第28-38页 |
| 3.4 识别过程与结果 | 第38-44页 |
| 第四章 结果分析与讨论 | 第44-48页 |
| 4.1 基因翻译起始位点附近保守序列 | 第44-47页 |
| 4.2 基因结构与协同扫描模型 | 第47-48页 |
| 第五章 结论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 致谢 | 第54页 |