| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 表目录 | 第14-15页 |
| 图目录 | 第15-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-34页 |
| ·引言 | 第17-31页 |
| ·研究背景 | 第17页 |
| ·植物衰老研究综述 | 第17-23页 |
| ·植物抗逆相关基因研究综述 | 第23-29页 |
| ·古树研究进展 | 第29-30页 |
| ·高通量测序技术 | 第30-31页 |
| ·研究意义及目的 | 第31-32页 |
| ·研究内容与技术路线 | 第32-34页 |
| ·研究内容 | 第32-33页 |
| ·技术路线 | 第33-34页 |
| 第二章 不同树龄侧柏活性氧产生与清除系统 | 第34-41页 |
| ·材料与方法 | 第35-37页 |
| ·试验材料 | 第35页 |
| ·测定指标与方法 | 第35-37页 |
| ·研究结果 | 第37-40页 |
| ·8 月份侧柏针叶活性氧与清除系统 | 第37页 |
| ·11 月份不同树龄侧柏针叶活性氧与清除系统 | 第37-38页 |
| ·不同树龄侧柏种子千粒重与发芽指数 | 第38-39页 |
| ·不同树龄侧柏种子活性氧与清除系统 | 第39-40页 |
| ·小结与讨论 | 第40-41页 |
| 第三章 侧柏叶片转录组测序与分析 | 第41-58页 |
| ·材料与方法 | 第41-44页 |
| ·侧柏叶片 RNA 提取 | 第42-43页 |
| ·侧柏叶片转录组测序 | 第43-44页 |
| ·转录组测序 | 第44-56页 |
| ·RNA 的浓度及质量 | 第44-45页 |
| ·原始测序数据产量 | 第45页 |
| ·中级分析结果 | 第45-50页 |
| ·高级分析结果 | 第50-51页 |
| ·蛋白功能和分类预测 | 第51-52页 |
| ·Unigene 代谢通路分析 | 第52-53页 |
| ·预测编码蛋白框（Coding sequence, CDS） | 第53-54页 |
| ·侧柏叶片转录组序列中 SSRs 分布特征 | 第54-55页 |
| ·侧柏叶片转录组序列中 SSR 的长度分布 | 第55-56页 |
| ·小结与结论 | 第56-58页 |
| 第四章 侧柏实时定量 PCR 内参基因的筛选 | 第58-72页 |
| ·材料与方法 | 第59-62页 |
| ·材料 | 第59页 |
| ·总 RNA 提取与纯化（见第三章） | 第59页 |
| ·内参基因的引物设计 | 第59-60页 |
| ·实时定量 PCR | 第60-61页 |
| ·半定量分析 | 第61页 |
| ·引物扩增效率验证和标准曲线的绘制 | 第61页 |
| ·数据处理和分析 | 第61-62页 |
| ·结果与分析 | 第62-70页 |
| ·内参基因 Ct 值比较 | 第62-63页 |
| ·GeNorm 计算结果分析 | 第63-65页 |
| ·NormFinder 计算结果分析 | 第65-67页 |
| ·BestKeeper 计算结果分析 | 第67-68页 |
| ·NAC 转录因子基因的表达量 | 第68-70页 |
| ·小结与讨论 | 第70-72页 |
| 第五章 不同树龄侧柏表达谱测序及基因功能分析 | 第72-96页 |
| ·材料与方法 | 第72-73页 |
| ·表达谱测序材料 | 第72页 |
| ·实验方法 | 第72-73页 |
| ·表达谱测序流程 | 第73页 |
| ·表达谱测序结果 | 第73-92页 |
| ·原始数据统计 | 第74-76页 |
| ·差异表达基因的筛选及差异基因的表达分析 | 第76-90页 |
| ·不同树龄侧柏表达谱差异基因验证 | 第90-92页 |
| ·小结与讨论 | 第92-96页 |
| 第六章 侧柏部分抗氧化相关基因的表达调控分析 | 第96-110页 |
| ·材料与方法 | 第96-98页 |
| ·试验材料的培养与处理 | 第96页 |
| ·测定指标与方法 | 第96-98页 |
| ·结果与分析 | 第98-107页 |
| ·胁迫下 H_2O_2含量测定分析 | 第98页 |
| ·胁迫下 NAC 转录因子基因表达分析 | 第98-99页 |
| ·胁迫下活性氧生成和清除相关基因表达分析 | 第99-101页 |
| ·胁迫下次生代谢相关基因表达分析 | 第101-102页 |
| ·胁迫下 GABA-Shunt 相关基因表达分析 | 第102-105页 |
| ·胁迫下端粒结合蛋白相关基因表达分析 | 第105-107页 |
| ·小结与讨论 | 第107-110页 |
| 第七章 结论与展望 | 第110-114页 |
| ·结论 | 第110-112页 |
| ·不同树龄侧柏活性氧产生与清除分析 | 第110页 |
| ·不同树龄侧柏转录组测序与分析 | 第110-111页 |
| ·不同树龄侧柏 SSR 特征分析 | 第111页 |
| ·侧柏实时定量 PCR 内参基因的筛选 | 第111页 |
| ·不同树龄侧柏表达谱测序及差异基因功能分析 | 第111-112页 |
| ·胁迫条件下抗逆基因表达分析 | 第112页 |
| ·展望 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-131页 |
| 附录 | 第131-141页 |
| 在读期间的学术研究 | 第141-142页 |
| 致谢 | 第142-143页 |
| 详细摘要 | 第143-145页 |