| 摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第11-16页 |
| 1.1 奶牛乳腺组织的发育与泌乳 | 第11页 |
| 1.2 miRNA研究概述 | 第11-14页 |
| 1.2.1 miRNA的特征 | 第11-12页 |
| 1.2.2 miRNA的合成及作用机制 | 第12页 |
| 1.2.3 miRNA的功能 | 第12-13页 |
| 1.2.4 miRNA靶基因的寻找方法 | 第13-14页 |
| 1.3 small RNA测序研究进展 | 第14-15页 |
| 1.4 交联免疫沉淀测序 | 第15页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第16页 |
| 2.2 实验仪器 | 第16-17页 |
| 2.3 实验试剂 | 第17页 |
| 2.4 实验方法与步骤 | 第17-23页 |
| 2.4.1 乳腺组织RNA提取和质量检测 | 第17页 |
| 2.4.2 Small RNA测序数据处理及生物信息学分析 | 第17-18页 |
| 2.4.3 RNA结合蛋白免疫共沉淀 | 第18-20页 |
| 2.4.4 交联免疫沉淀测序数据处理及生物信息学分析 | 第20-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-43页 |
| 3.1 奶牛乳腺组织RNA质量检验 | 第23页 |
| 3.2 Small RNA测序结果 | 第23-30页 |
| 3.2.1 sRNA长度筛选 | 第23-24页 |
| 3.2.2 miRNA碱基偏好性 | 第24-25页 |
| 3.2.3 差异表达的miRNA | 第25-27页 |
| 3.2.4 差异表达miRNA的qRT-PCR验证 | 第27页 |
| 3.2.5 靶基因预测结果 | 第27-28页 |
| 3.2.6 靶基因的GO分析与通路分析 | 第28-30页 |
| 3.3 交联免疫沉淀测序结果 | 第30-38页 |
| 3.3.1 交联免疫沉淀测序样品质量检测 | 第30-31页 |
| 3.3.2 miRNA调控的差异表达靶基因 | 第31-34页 |
| 3.3.3 miRNA调控差异表达靶基因的qRT-PCR验证 | 第34-35页 |
| 3.3.4 miRNA调控差异表达靶基因的GO分析与通路分析 | 第35-38页 |
| 3.4 整合分析结果 | 第38-43页 |
| 3.4.1 small RNA测序与交联免疫沉淀测序联合分析 | 第38-40页 |
| 3.4.2 交集靶基因的GO和通路分析 | 第40-41页 |
| 3.4.3 miRNA和mRNA互作网络构建 | 第41-43页 |
| 4 讨论 | 第43-46页 |
| 4.1 奶牛乳腺中乳品质调控相关miRNAs | 第43页 |
| 4.2 奶牛乳腺中乳品质调控相关miRNAs的靶基因 | 第43-46页 |
| 4.2.1 奶牛乳腺中乳品质调控相关miRNAs靶基因的鉴定 | 第43-44页 |
| 4.2.2 奶牛乳腺中乳品质调控相关miRNAs靶基因的确定 | 第44-46页 |
| 5 结论 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 附录 | 第54-55页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第55页 |
