樱桃病毒的检测及樱桃病毒A基因组序列分析
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第12-21页 |
| 1.1 樱桃病毒病的发生概况 | 第12-14页 |
| 1.2 樱桃病毒A的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.1 樱桃病毒A的分类地位 | 第14页 |
| 1.2.2 樱桃病毒A的发生分布及危害 | 第14-15页 |
| 1.2.3 樱桃病毒A的研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3 RNA病毒的遗传变异概述 | 第16-18页 |
| 1.4 RNA病毒的种群遗传学研究方法 | 第18-19页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 1.6 技术路线 | 第20-21页 |
| 第二章 我国樱桃主产区樱桃病毒病调查与病毒检测 | 第21-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-24页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第21-23页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第23页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第23-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-27页 |
| 2.2.1 植物总RNA提取 | 第24页 |
| 2.2.2 检测引物 | 第24页 |
| 2.2.3 RT-PCR检测 | 第24-25页 |
| 2.2.4 目的片段的克隆与测序 | 第25-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 樱桃病毒A的全基因组序列扩增及分析 | 第32-44页 |
| 3.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.1.1 实验样品 | 第32页 |
| 3.1.2 实验试剂 | 第32页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第32页 |
| 3.2 实验方法 | 第32-38页 |
| 3.2.1 植物总RNA提取 | 第32页 |
| 3.2.2 引物设计 | 第32-33页 |
| 3.2.3 5′RACE的RT-PCR反应 | 第33-35页 |
| 3.2.4 其它片段的RT-PCR反应 | 第35-36页 |
| 3.2.5 目的片段的克隆与测序 | 第36-38页 |
| 3.3 结果与分析 | 第38-42页 |
| 3.3.1 CVA全基因组序列的扩增与拼接 | 第38-39页 |
| 3.3.2 全基因组序列比较 | 第39-40页 |
| 3.3.3 系统发育树的构建与分析 | 第40-42页 |
| 3.4 讨论 | 第42-44页 |
| 第四章 樱桃病毒A的种群遗传学分析 | 第44-66页 |
| 4.1 实验材料 | 第44-46页 |
| 4.1.1 实验样品 | 第44-46页 |
| 4.1.2 实验试剂 | 第46页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第46页 |
| 4.2 实验方法 | 第46-50页 |
| 4.2.1 植物总RNA提取 | 第46页 |
| 4.2.2 引物设计 | 第46-47页 |
| 4.2.3 RT-PCR反应 | 第47-48页 |
| 4.2.4 目的片段的克隆与测序 | 第48-49页 |
| 4.2.5 序列分析 | 第49-50页 |
| 4.3 结果与分析 | 第50-63页 |
| 4.3.1 序列的扩增与数据处理 | 第50-51页 |
| 4.3.2 重组分析 | 第51-52页 |
| 4.3.3 系统发育分析 | 第52-57页 |
| 4.3.4 核苷酸/单体型多样性分析 | 第57-58页 |
| 4.3.5 基因交流与遗传分化 | 第58-62页 |
| 4.3.6 选择压分析 | 第62-63页 |
| 4.3.7 中性检测分析 | 第63页 |
| 4.4 讨论 | 第63-66页 |
| 第五章 全文结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-75页 |
| 附录 | 第75-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 作者简历 | 第84页 |
